Analyse de données avec Stata

Programme du Cours
Analyse de données avec Stata
Année universitaire 2015 - 2016
SESSION 1 :
Commandes Stata et tests univariés
2 - 6 novembre 2015
Co-directeurs
Arnaud FONTANET et Yoann MADEC
Institut Pasteur
Unité d’Epidémiologie des Maladies Emergentes
Chefs de travaux
Loïc CHARTIER
LYSARC
Centre Hospitalier Lyon-Sud
Bich-Tram HUYNH
Lénaig LE FOULER
Institut Pasteur
Unité de Pharmacoépidémiologie
et Maladies Infectieuses

DESCRIPTION DU COURS
Cette première session Stata alternant cours théoriques et travaux dirigés débutera par la
manipulation de fichiers (ouverture, importation de données, fusion de fichiers), l’exploration
d’une base de données (structure, recherche de doublons, données manquantes, valeurs
aberrantes, recodage des variables), et la réalisation de graphiques.
Puis seront étudiés les tests statistiques (paramétriques et non paramétriques) comparant des
variables discrètes ou continues entre deux groupes indépendants (Test t de Student, test de
Mann-Whitney, test du Chi² ou test exact de Fisher), plus de deux groupes indépendants
(Analyse de variance, test de Kruskal-Wallis, comparaisons multiples) ou deux groupes
appariés (Test de Student sur séries appariées, test des rangs signés de Wilcoxon, test de Mc
Nemar).
Enfin, les étudiants apprendront comment faire un calcul de taille d’échantillon avec Stata.
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Analyse de données avec Stata
- Session 1 -
Lundi 2 novembre 2015
9h00 - 9h30 Accueil des étudiants Secrétariat de la Scolarité, A. Fontanet
B. T. Huynh, L. Chartier
et L. Le Fouler
9h30 - 12h30 Introduction à l'analyse de données sur Stata B. T. Huynh
L. Chartier
L. Le Fouler
13h30 - 17h00 Exploration d'un fichier de données B. T. Huynh
L. Chartier
L. Le Fouler
Mardi 3 novembre 2015
9h00 - 12h30 Création de variables B. T. Huynh
L. Chartier
L. Le Fouler
13h30 - 17h00 Organisation d'une base de données B. T. Huynh
L. Chartier
L. Le Fouler
Mercredi 4 novembre 2015
9h00 - 13h00 Contrôle de qualité des données / nettoyage B. T. Huynh
L. Chartier
L. Le Fouler
14h00 - 17h00 Commandes pour faire des graphiques B. T. Huynh
L. Chartier
L. Le Fouler
Jeudi 5 novembre 2015
9h00 - 13h00 Comparaison de variables continues A. Fontanet, B. T. Huynh
entre deux / plusieurs groupes L. Le Fouler
14h00 - 17h00 Comparaison de variables discrètes A. Fontanet, B. T. Huynh
entre deux / plusieurs groupes L. Le Fouler
Vendredi 6 novembre 2015
9h00 - 12h30 Taille d'échantillon / Révisions A. Fontanet, B. T. Huynh
L. Le Fouler
14h00 - 17h00 Examen : analyse d'une base de données à l'aide
du logiciel Stata (faite de façon individuelle et
guidée par des questions)
durée 3h00, noté sur 20

Pôle Epidémiologie et Santé Publique
Programme du cours
Analyse de données avec Stata
Année universitaire 2015 - 2016
SESSION 2 : Régression logistique
14 - 18 décembre 2015
Co-directeurs
Arnaud FONTANET et Yoann MADEC
Unité de recherche et d'expertise
Epidémiologie des Maladies Emergentes
Institut Pasteur
Chefs de travaux
Lénaig LE FOULER
Unité de Pharmacoépidémiologie et maladies infectieuses
Institut Pasteur
Laura TONDEUR
Unité de recherche et d'expertise
Epidémiologie des Maladies Emergentes
Institut Pasteur

DESCRIPTIF
Le cours Stata 2 est destiné à des personnes ayant déjà été initiées au logiciel Stata, et possédant
des connaissances en statistiques de niveau Césam ou équivalent.
Ce cours permettra aux participants de savoir analyser une base de données, de construire un
modèle de régression logistique et de pouvoir interpréter les résultats obtenus. Les enseignements,
répartis sur 5 journées, porteront sur l’introduction à la régression logistique, la prise en compte de
facteurs de confusion, l’évaluation d’une interaction entre facteurs et enfin la construction d’un
modèle de régression logistique. Seront également abordées les techniques de mesure
d’adéquation du modèle, la construction d’un score clinique prédictif, les méthodes d’imputation
multiple, et la régression logistique conditionnelle pour les observations appariées.
En pratique, les matinées seront consacrées à une partie théorique suivie d’exercices commentés ;
les après-midi seront dédiés à des travaux dirigés avec mise en application sur des bases de
données réelles, chaque participant bénéficiant d’un ordinateur individuel. Les enseignants
assisteront les étudiants et corrigeront les exercices proposés. Le cours sera validé par un examen
final.
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