Plasticité génomique
Pr. Vincent Cattoir
CHU de Rennes, Service de Bactériologie-Hygiène hospitalière
Université de Rennes 1, Faculté de Médecine
E-mail : vincent.cattoir@chu-rennes.fr
UE « Agents infectieux »
DFGSM-3, 2ème semestre, année 2016-2017
Mécanismes de plasticité génomique
-Mutation /Restriction-modification
-Recombinaison homologue
-Recombinaison non-homologue :
.Transposition
.Recombinaison site-sp!cifique
-Transfert horizontal de g"nes :
.Transformation
.Transduction
.Conjugaison
Recombinaison non-homologue
Pas de séquenes homologues nécessaires pour la recombinaison
(“recombinaison non légitime“)
Transposition
-Transfert d‘un élément d‘ADN d‘un site donneur vers une région cible
non homologue du génome
-Evènement rare,fréquence 10-310-8 par génération
-Insertion de l‘élément d‘ADN de façon aléatoire ou au niveau hot spots
-Duplication possible de la séquence d‘intégration (“direct target repeat“)
-Nécessite l‘action d‘une transposase, RecA-indépendante
Site-specific (integrative) recombination
-Intégration au niveau d‘un site spécifique : séquence ADN consensus de
15-20 nt nécessaire à la recombinaison
-Implique des interactions spécifiques protéines-ADN
-Nécessite l‘action d‘une recombinase (résolvase/intégrase), RecA-
indépendante
Eléments transposables
!Chez les procaryotes, 2 types principaux
d’éléments transposables :
a. Insertion sequences (IS)
b. Transposons (Tn)
Séquences d’insertion (IS)
Inverted repeats (IR) :
similar but not identical nucleotide sequence (imperfect palindrome)
for recognition site of the transposase.
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