Conservation de la diversité génétique de la vigne

Conservation de la diversité génétique de la
vigne - La Chambre d'Agriculture de la Gironde
confirme son engagement
Service Vigne & Vin
Date de rédaction : 4 juin 2010
Réf : 1006AAA1VEG
Nom du média : Avenir Aquitain
Page : /
Auteur : Marie-Catherine Dufour
Selon la convention de diversité biologique signée par 175 pays dont la France, la
biodiversité est « la variabilité des organismes de toute origine […]. Cela comprend la
diversité au sein des espèces ainsi que celle des écosystèmes. » Des ressources
méconnues aujourd’hui peuvent devenir utiles demain, avec l’apparition de nouveaux
besoins. Il y a également une dimension éthique dans la préservation de la
biodiversité : « nous devons maintenir ce qui ne nous appartient pas ».
3 000 variétés conservées au Domaine de Vassal
La vigne ne déroge pas à la règle. C’est une culture très ancienne puisque la domestication
de la vigne pourrait avoir eu lieu il y a 10 000 ans, au Proche-Orient. Certaines variétés sont
donc très anciennes. Elles ont été transmises de la même façon que l’olive, du Moyen Orient
à l’Est méditerranéen, et plus tard à l’Europe de l’Ouest. Or, des vignes sauvages étaient
présentes dans ces zones de culture. L’hybridation (multiplication sexuée) entre plusieurs
espèces a permis la création de nouvelles variétés, dans chaque région viticole (cf. encart).
Le conservatoire de Vassal, domaine de l’INRA, près de Montpellier, est en charge de la
conservation de près de 3 000 cépages de vigne. C’est la plus importante collection au
monde de Vitis Vinifera L., l’espèce de vigne cultivée en Europe. Elle comprend 2 300 des 5
à 7 000 cépages cultivés dans le monde, originaires de 40 pays des 5 continents. Elle
possède notamment 600 variétés françaises dont 220 peuvent être cultivées et seulement 40
sont réellement utilisées. 250 variétés de porte-greffe sont également conservées à Vassal,
dont 30 sont utilisés en France. Enfin, des variétés de vignes sauvages sont sauvegardées
car ce sont des réservoirs de gènes pour la sélection variétale. L’ensemble de ce matériel
est décrit dans une base de donnée (origine et données morphologiques, technologiques et
sanitaires).
Plus de 4 000 clones conservés sur le Domaine de l’Espiguette
La conservation de la vigne peut également être vue à une autre échelle. En effet, les
cépages cultivés depuis des siècles constituent des populations polyclonales. Ces individus
se ressemblent suffisamment pour faire partie du même cépage. Néanmoins, il y a quelques
différences génétiques qui leurs confèrent des caractéristiques morphologiques,
agronomiques ou organoleptiques différentes. C’est à partir de ce postulat que la sélection
clonale a été mise en place dans les années 70. Le conservatoire de l’Espiguette, dans le
Gard, a pour mission la conservation du matériel sélectionné et le maintien de la diversité
naturelle. Il comprend tous les clones agréés en France, ainsi que des clones non agréés.
Fin 2007, ce conservatoire était riche de 4202 clones de 452 variétés de raisins de cuves, de
table et de porte-greffe. Chaque année, 50 à 100 nouveaux clones sont introduits. Il est géré
par l’IFV (Institut Français de la Vigne et du Vin).
Conservation des cépages autochtones dans chaque région viticole
Ces conservatoires sont complétés par des conservatoires régionaux. Ils ont été mis en
place en parallèle de la sélection clonale. Pour le Bordelais, depuis le début des années 70,
la Chambre d’Agriculture de la Gironde travaille sur la sélection clonale des cépages
girondins. L’objectif est d’améliorer l’état sanitaire du vignoble et la qualité de la vendange.
Le principe est de sélectionner quelques individus, dont les profils agronomiques et
sanitaires correspondent aux objectifs fixés et de les multiplier par voie végétative (méthode
classique de production d’un plant). Ainsi, une même parcelle est constituée d’individus tous
Chambre d'Agriculture de la Gironde - Service Vigne & Vin - E-mail : [email protected]
39 rue Michel Montaigne - B.P. 115 - 33094 BLANQUEFORT CEDEX - Tel : 05.56.35.00.00
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Auteur : Marie-Catherine Dufour
génétiquement identiques, ce qui améliore l’homogénéité et permet d’adapter le matériel
végétal à son terroir et à ses objectifs de production. Actuellement, 90 % des plantations
sont réalisées avec du matériel issu de sélection clonale. Afin de palier à la diminution de la
biodiversité dans les vignobles, des conservatoires régionaux sont mis en place pour les
cépages locaux. Ils doivent permettre la préservation du matériel végétal en répondant à 2
objectifs. Tout d’abord, le matériel doit être le plus divers possible. Pour cela, il est
sélectionné sur de nombreuses parcelles. Le plus grand nombre de phénotypes différents
sont sélectionnés, sans à priori. Le matériel doit également être indemnes de viroses graves.
Transfert des conservatoires de cépages noirs
Dans le Bordelais, tous les cépages ont un conservatoire, hormis la Muscadelle, conservée
en Dordogne . Ils sont plantés sur les domaines viticoles de l’INRA. Pour certaines variétés,
le nombre de clones est relativement important, signe d’une réelle diversité génétique. Pour
d’autres, comme la Carmenère (cf. tableau), un lourd travail de prospection doit encore être
réalisé pour prétendre à conserver ce cépage bordelais. Par ailleurs, les conservatoires
situés à Latresne doivent être transférés rapidement car cette propriété sera vendue dans un
proche avenir. La pérennité des parcelles n’est donc plus assurée. La Chambre d'Agriculture
de la Gironde a pris en charge cette mission. Les conservatoires vont être transférés sur les
exploitations des Lycées Agricoles de Gironde, avec une échéance à 2012. Pour cela, il est
nécessaire de tester sanitairement chaque individu, pour s’assurer de ne planter que des
pieds indemnes de viroses graves (court noué et enroulement). Ensuite, il faut greffer une
très faible quantité de chaque accession (5 plants par clone seront mis en place sur le
nouveau conservatoire) en suivant une traçabilité irréprochable. Enfin, la plantation sera
réalisée en suivant strictement le plan, pour positionner les différents clones.
Nombre d’accessions conservées par cépage dans le Bordelais
Cépage
Nombre de clones
Petit Verdot
84
Cabernet franc
328
Carmenère
10
Cabernet Sauvignon
150
Merlot
258
Cot
42
Sauvignon
80
Sémillon
148
La connaissance du génome accélère la sélection
De nombreux projets sont en cours, pour assurer la conservation du matériel végétal. Tout
d’abord, le Domaine de Vassal projette d’utiliser la cryogénie pour congeler des bourgeons
et conserver ainsi les ressources génétiques. Cette méthode permet de conserver des
quantités plus importantes de matériel végétal, à condition que l’on sache régénérer les
cellules congelées. L’IFV, quant à lui, projette de doubler le conservatoire de l’Espiguette, en
culture hors sol, sous serre insect-proof. L’intérêt de cette méthode est de préserver le
matériel végétal des contaminations par des vecteurs aériens (cochenilles ou cicadelles).
Enfin, l’INRA, après avoir participé au séquençage du génôme de la vigne, en 2007 (cf.
encart), a fait de la génomique un axe prioritaire de recherche. C’est un point de départ pour
la caractérisation des gènes. Par exemple, nous connaissons maintenant le gène codant
pour l’enzyme Stylbène Syntase qui permet la synthèse du resvératrol, un composé associé
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à des bénéfices pour la santé dans le cas d’une consommation modérée de vin. Le
séquençage va également permettre une meilleure compréhension de la variation génétique
naturelle, ce qui sera très utile pour caractériser la diversité génétique dans nos
conservatoires et ainsi les compléter. Enfin, ces travaux vont accélérer la sélection du
matériel végétal et la création de variétés résistantes aux maladies par l’identification de
gènes responsables d’un caractère agronomique ou organoleptique précis et par un tri
rapide des souches les possédant.
Le Cabernet Sauvignon N et le Merlot N sont des hybrides. Ils sont issus de croisements
entre 2 variétés. Il est en aucun cas question d’OGM (Organisme Génétiquement Modifié)
mais de multiplication sexuée (formation d’une graine après fécondation). Le Cabernet
Sauvignon N est un fils du Cabernet franc N et du Sauvignon B. Le Merlot N, quant à lui, a
pour père le Cabernet franc N et pour mère la Magdeleine noire des Charentes, un cépage
peu connu, retrouvée dans la zone charentaise et à l’état de traces au nord de la Bretagne
où elle était cultivée au Moyen Age (Boursiquot et al., 2009).
Le Bureau de Recherche Génétique (BRG) a été créé en 1983. Sa mission est d’élaborer et
de conduire une politique nationale en matière de ressources génétiques, de permettre la
concertation de tous les acteurs et de disposer des expertises nécessaires au niveau
national et international. Ses missions concernent aussi bien les animaux que les végétaux
ou les microorganismes. Sous son impulsion, le réseau français des conservatoires de
vignes a été créé en 1999. Il regroupe la plupart des partenaires engagés dans la
conservation des ressources génétiques de cette plante en France, dont la Chambre
d'Agriculture de la Gironde.
Le génome de la vigne : l’ADN, présent dans le noyau de chaque cellule d’un être vivant,
constitue son information génétique. C’est son génome. Cet ADN est constitué de 4
nucléotides répétés, représentés par les lettres A, C, G et T. Un gène est constitué de
nucléotides disposés d’une façon précise. Nous pouvons le comparer à un mot écrit dans un
alphabet à 4 lettres. Pour la vigne, il y a environ 30 000 gènes différents. Chaque gène code
pour une protéine, qui participe au fonctionnement de la plante. Pour un caractère que l’on
observe extérieurement, un phénotype, plusieurs gènes sont souvent impliqués.
A aucun moment nous avons abordé la problématique des OGM (Organismes
Génétiquement Modifiés) dans cet article. Néanmoins, il nous semble important d’apporter
quelques précisions car il y a souvent confusion entre hybridation, études génomiques et
transformation génétique. Dans ce dernier cas, un gène exogène est introduit dans l’ADN de
la vigne. Ce gène peut être issu d’une autre espèce de vigne ou d’un être vivant très
différent. En effet, dans la nature, quel que soit l’être vivant, un animal, un végétal ou un
micro organisme, les gènes sont toujours constitués des mêmes « 4 lettres », les
nucléotides. L’objectif d’une telle pratique est d’apporter à la vigne une propriété qu’elle ne
possède pas naturellement. Par exemple, un essai est en cours à Colmar, pour tester des
porte-greffe génétiquement modifiés pour résister au court noué, une virose grave de la
vigne (cf. communiqué de presse).
La conservation du matériel végétal est possible grâce à la participation financière du
Conseil Général, du Conseil Régional, de France AgriMer et du CIVB. Ces travaux sont
menés par la Chambre d'Agriculture de la Gironde dans le cadre des Partenaires de la
Sélection Vigne France.
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Marie-Catherine DUFOUR
Chambre d’Agriculture de la Gironde
Mots clés : cépage, conservatoire, génomique, biodiversité.
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