Comment obtenir des données microbiologiques fiables devant une plaie infectée ? René Courcol CHU de Lille Société Française de Microbiologie Absence de conflit d’intérêt Classification des lésions et suppurations cutanées • Classe I infections profondes et fermées infection d’origine endogène • Classe II infections profondes secondairement fermées infections profondes ouvertes, fistules infection d’origine exogène probable • Classe III infections ouvertes forte probabilité d’infection origine endogène et/ou exogène Un foyer infecté ouvert est toujours en contact avec le microbiote cutané Phases Défaillances observées aux différentes phases de traitement d’un échantillon biologique Pré-analytique Pré-opératoire Per-opératoire Post-analytique Transport consultation bloc opératoire lit du patient acheminement Quoi ? Prescription Programmation Information Prélèvement Conditionnement Collecte Tri Transport Livraison Qui ? Opérateur Equipe bloc op. Transporteur % erreurs Où ? 31 - 75% externe au labo : 46 -68% interne au labo : 3 – 5% 0,05% erreurs critiques Analytique Post-opératoire laboratoire Réalisation de l’examen secrétariat et dossier Réception des résultats Equipe labo. Labo. et opérateur 13 - 32% 9 - 32% Pré-analytique - Informations de prescription ISO 15189 - § 5.4.3. Phases Loi 2013-442 Pré-analytique Pré-opératoire Où ? Consultation Quoi ? Prescription Programmation Information Qui ? Opérateur • Identification du patient: nom, DDN, sexe, n° SS, NIP, adresse • Nom et identifiant du clinicien • Type d’échantillon primaire, site anatomique • Nature de l’examen prescrit • Informations cliniques pertinentes • Date et heure du prélèvement • Date et heure de la réception de l’échantillon avec sa prescription • Traitement anti-infectieux éventuel Phases Comment effectuer un bon prélèvement ? Où ? Quoi ? Qui ? Pré-analytique Per-opératoire Lit du patient Transport bloc opératoire Lit du patient acheminement Prélèvement Conditionnement Collecte Tri Transport Livraison Equipe bloc op. Transporteur Objectif Identifier les micro-organismes responsables de l’infection primitive ou de la surinfection Mode de prélèvement nettoyer le site à prélever choix selon la nature de la plaie écouvillon universel nylon/dacron avec milieu de transport (rech. bact. aérobies/anaérobies, BioMol, virologie) ponction-biopsie sans ajout de liquide biologie moléculaire Transmission au laboratoire dans les deux heures Phases Pré-analytique Echantillons justifiant un refus d’analyse microbiologique Analytique Où ? laboratoire Quoi ? Réalisation de l’examen Qui ? Equipe labo. • Echantillons non ou improprement étiquetés • Echantillons reçus dans des récipients endommagés et non étanches • Échantillons provenant de sites normalement stériles et reçus dans des récipients non étanches • Échantillons visiblement contaminés • Echantillons reçus sans avoir été conservés dans les conditions recommandées • Échantillons inappropriés aux analyses prescrites • Echantillon identique à un autre échantillon reçu le même jour Phases Résultats attendus Analytique Où ? laboratoire Quoi ? Réalisation de l’examen Qui ? Equipe labo. Examen microscopique direct résultat dans les 2 heures leucocytes – bactéries (dont suspicion bactéries anaérobies) Cultures selon les données cliniques Biologie moléculaire selon les données cliniques : amplification génique non spécifique (gène rrs) amplification génique spécifique (SARM, BLSE, BHRe) mono/multiplex Quelles sont les bactéries à surveiller en chirurgie ? Liste OMS • Priorité critique Acinetobacter baumannii, résistance aux carbapénèmes Pseudomonas aeruginosa, résistance aux carbapénèmes Entérobactéries, résistance aux carbapénèmes, production de BLSE • Priorité élevée Enterococcus faecium, résistance à la vancomycine Staphylococcus aureus, résistance à la méthicilline, résistance intermédiaire ou complète à la vancomycine Prévention des infections = respect des mesures de sécurité biologique Usage approprié des antibiotiques Phases Etape post-analytique Post-analytique Post-opératoire Où ? secrétariat et dossier Quoi ? Réception des résultats Qui ? Labo. et opérateur Les données d’une analyse microbiologique ne sont pas des paramètres. Elles doivent être confrontées avec les données cliniques. C’est ce qui rend le résultat fiable Merci de votre attention