infection d`origine endogène

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Comment obtenir
des données microbiologiques
fiables devant une plaie infectée ?
René Courcol
CHU de Lille
Société Française de Microbiologie
Absence de conflit d’intérêt
Classification des lésions et suppurations cutanées
• Classe I infections profondes et fermées
 infection d’origine endogène
• Classe II infections profondes secondairement fermées
infections profondes ouvertes, fistules
 infection d’origine exogène probable
• Classe III infections ouvertes
 forte probabilité d’infection origine
endogène et/ou exogène
Un foyer infecté ouvert est toujours en contact avec le
microbiote cutané
Phases
Défaillances observées aux différentes phases
de traitement d’un échantillon biologique
Pré-analytique
Pré-opératoire
Per-opératoire
Post-analytique
Transport
consultation
 bloc opératoire
lit du patient
 acheminement
Quoi ?
Prescription
Programmation
Information
Prélèvement
Conditionnement
Collecte
Tri
Transport
Livraison
Qui ?
Opérateur
Equipe bloc op.
Transporteur
% erreurs
Où ?
31 - 75%
externe au labo : 46 -68%
interne au labo : 3 – 5%
0,05% erreurs critiques
Analytique
Post-opératoire
 laboratoire
Réalisation de
l’examen
secrétariat et dossier
Réception des
résultats
Equipe labo.
Labo. et opérateur
13 - 32%
9 - 32%
Pré-analytique - Informations de prescription
ISO 15189 - § 5.4.3.
Phases
Loi 2013-442
Pré-analytique
Pré-opératoire
Où ?
Consultation
Quoi ?
Prescription
Programmation
Information
Qui ?
Opérateur
• Identification du patient: nom, DDN, sexe, n° SS,
NIP, adresse
• Nom et identifiant du clinicien
• Type d’échantillon primaire, site anatomique
• Nature de l’examen prescrit
• Informations cliniques pertinentes
• Date et heure du prélèvement
• Date et heure de la réception de l’échantillon avec
sa prescription
• Traitement anti-infectieux éventuel
Phases
Comment effectuer un bon prélèvement ?
Où ?
Quoi ?
Qui ?
Pré-analytique
Per-opératoire
Lit du patient
Transport
 bloc opératoire
 Lit du patient
 acheminement
Prélèvement
Conditionnement
Collecte
Tri
Transport
Livraison
Equipe bloc op.
Transporteur
Objectif
Identifier les micro-organismes responsables de
l’infection primitive ou de la surinfection
Mode de prélèvement
nettoyer le site à prélever
choix selon la nature de la plaie
écouvillon universel nylon/dacron avec milieu
de transport (rech. bact. aérobies/anaérobies,
BioMol, virologie)
ponction-biopsie sans ajout de liquide 
biologie moléculaire
Transmission au laboratoire dans les
deux heures
Phases
Pré-analytique
Echantillons justifiant un refus d’analyse microbiologique
Analytique
Où ?
 laboratoire
Quoi ?
Réalisation de
l’examen
Qui ?
Equipe labo.
• Echantillons non ou improprement étiquetés
• Echantillons reçus dans des récipients endommagés
et non étanches
• Échantillons provenant de sites normalement
stériles et reçus dans des récipients non étanches
• Échantillons visiblement contaminés
• Echantillons reçus sans avoir été conservés dans les
conditions recommandées
• Échantillons inappropriés aux analyses prescrites
• Echantillon identique à un autre échantillon reçu le
même jour
Phases
Résultats attendus
Analytique
Où ?
 laboratoire
Quoi ?
Réalisation de
l’examen
Qui ?
Equipe labo.
Examen microscopique direct
résultat dans les 2 heures
leucocytes – bactéries (dont suspicion bactéries
anaérobies)
Cultures selon les données cliniques
Biologie moléculaire selon les données cliniques :
 amplification génique non spécifique (gène rrs)
 amplification génique spécifique (SARM, BLSE, BHRe)
mono/multiplex
Quelles sont les bactéries à surveiller en chirurgie ?
Liste OMS
• Priorité critique
Acinetobacter baumannii, résistance aux carbapénèmes
Pseudomonas aeruginosa, résistance aux carbapénèmes
Entérobactéries, résistance aux carbapénèmes, production de
BLSE
• Priorité élevée
Enterococcus faecium, résistance à la vancomycine
Staphylococcus aureus, résistance à la méthicilline, résistance
intermédiaire ou complète à la vancomycine
 Prévention des infections = respect des mesures de sécurité
biologique
 Usage approprié des antibiotiques
Phases
Etape post-analytique
Post-analytique
Post-opératoire
Où ?
secrétariat et dossier
Quoi ?
Réception des
résultats
Qui ?
Labo. et opérateur
Les données d’une analyse
microbiologique ne sont pas des
paramètres.
Elles doivent être confrontées avec les
données cliniques.
C’est ce qui rend le résultat fiable
Merci de votre attention
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