ATTRIBUTIONS DES ALLOCATIONS DE RECHERCHE 2012-2013 [ Titre du sujet proposé Contrôle de Legionella par des agents antimicrobiens produits par des bactéries environnementales Laboratoire d’accueil : Ecologie et Biologie des Interactions, UMR CNRS 7267 Equipe : Microbiologie de l’Eau Directeur de thèse Jean-Marc BERJEAUD Taux global d’encadrement de thèses : 50% au 1er octobre 2011 Co-Directeur de thèse Julien VERDON Taux global d’encadrement de thèses : 50% au 1er octobre 2011 Résumé du sujet: Dans l’équipe Microbiologie de l’Eau de l’UMR7267 (Ecologie & Biologie des Interactions), l’une des thématiques de recherche est axée sur l’étude de composés actifs contre Legionella, l’agent responsable de la légionellose. C’est une bactérie d’origine hydrotellurique retrouvée aussi bien dans les environnements naturels (lacs, rivières) que dans les environnements artificiels (tours aéroréfrigérantes, réseaux d’eau chaude sanitaire…). Généralement, sa présence dans l’environnement est attribuée à une coexistence avec d’autres microorganismes au sein de biofilms multi-espèces. Elle possède un mode de vie parasitaire, se développant au sein de protozoaires tels que les amibes et, de manière opportuniste, à l’intérieur des macrophages alvéolaires. L’inhalation d’aérosols contaminés par ce germe est la voie de contamination humaine avérée. Plusieurs peptides actifs contre Legionella ont été caractérisés au laboratoire. Ils sont produits par des staphylocoques, bactéries qui ne partagent pas la même niche écologique que Legionella. Cependant, une étude récente (Guerrieri et al., 2008, Curr. Microbiol, 57, p532) a montré que des souches issues de la même niche que Legionella, notamment du genre Pseudomonas, possédaient une activité inhibitrice de L. pneumophila mais les molécules actives n’ont pas été caractérisées. D’autre part, il a été montré que Pseudomonas aeruginosa produisait des biosurfactants, comme les rhamnolipides, qui présentaient des activités antimicrobiennes dirigées contre plusieurs bactéries (Mohammad et al., 2010, Appl. Microbiol. Biotechnol., 86, p1323) mais également des protozoaires comme Dictyostelium discoideum (Cosson et al., 2002, J. Bacteriol. 184, p3027). L’objectif du sujet de thèse proposé est d’isoler et de caractériser des agents antimicrobiens, produits par une collection de souches environnementales, en particulier de Pseudomonas spp. et Bacillus spp., afin de lutter contre Legionella spp directement et/ou de façon indirecte par action contre les amibes qui les abritent (Acanthamoeba, Hartmanella,…). Le but final est de mieux contrôler la prolifération de ce pathogène dans les environnements aqueux artificiels, en particulier au sein de biofilms. Signature du Responsable d’équipe Y. Héchard Signature du Directeur de Laboratoire D. Bouchon Ecole Doctorale Sciences pour l’Environnement Gay Lussac 4 rue Michel Brunet – Bât B27 Chimie – BP 633 – 86022 Poitiers cedex : 33 (0)5 49 45 35 88 - fax: 33 (0)5 49 45 35 80 http://gaylussac.ed.univ-poitiers.fr ou [email protected]