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II- Les gènes du Complexe d’Histocompatibilité Majeur
A- Polymorphismes HLA
Définition
Un polymorphisme est une variation de séquence d'un gène dans une population.
Un gène est considéré comme polymorphe si il existe au moins deux allèles à une
fréquence égale ou supérieure à 1%.
Au niveau des HLA
Au niveau du gène HLA, ces variations vont entraîner une variation de la nature
physicochimique de la molécule. Cela retentit sur la nature du peptide antigénique fixé et
présenté ou autrement dit sur la capacité de fixation d’un peptide donné.
Le polymorphisme est très important mais est distribué de manière intelligente sur le gène :
il ne touche que les parties du gènes codant pour les domaines correspondants au site de
fixation. D’où le retentissement direct sur la nature du peptide qui se fixe.
On l’a vu, les polymorphismes sont très importants. En effet, il existe 400 allèles HLA DR,
100 allèles HLA DQ et 100 allèles HLA DP.
Ces chiffres sont donnés au niveau d’une population mais chez un individu, en général
hétérozygote, il n’y a bien entendu que 2 allèles différents.
Intérêt polymorphisme
Le polymorphisme est intéressant surtout au niveau de la population générale : il
augmente les chance dans la population qu’on ait au moins un allèle capable de lutter contre
au moins un agent pathogène. Ce qui revient à dire que face aux agents pathogènes, le
polymorphisme induit la survie de l’espèce.
Au niveau d’un individu il y a peu de HLA différents donc chaque allèle doit être capable de
fixer le plus grand nombre de peptides différents. Mais certains individus seront incapables de
répondre à une protéine donnée par une bonne réponse immunitaire.
Dans une population donnée et face à une AG donné, il y a des bons et des mauvais
/non répondeurs : les bons répondeurs sont capables de déclancher un réponse adaptée à la
présence de l’AG alors que les non répondeurs en seront incapables.
En thérapeutique, cela est très important : il faut tenir compte des polymorphismes au
sein d’une population pour fabriquer un vaccin. Le vaccin doit permettre de déclencher une
réponse immunitaire adaptée chez un maximum de personne.
Etude des polymorphismes
L’étude des polymorphismes se fait à 2 niveaux :
- au niveau protéique (avant, peu précis)
- au niveau génomique (maintenant, très précis) se base sur l’étude des séquences