Stratégies diagnostiques des pharyngites de l`enfant

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ECOLE DOCTORALE DE SANTE PUBLIQUE (ED 420)
Doctorat en Santé Publique
Spécialité Epidémiologie
Thèse présentée par
Jérémie COHEN
Stratégies diagnostiques des pharyngites de l'enfant
Du test de diagnostic rapide aux règles de décision clinique
Soutenue publiquement le 2 octobre 2014
Pour obtenir le grade de docteur de l’Université Paris Descartes
Devant le jury composé de :
Rapporteurs : Madame Dominique COSTAGLIOLA
Monsieur Patrick BOSSUYT
Examinateurs : Madame Claire POYART
Monsieur Olivier LORTHOLARY
Monsieur Didier GUILLEMOT (président)
Directeur de Thèse : Monsieur Martin CHALUMEAU

REMERCIEMENTS
Je remercie Madame Dominique COSTAGLIOLA d’avoir accepté d’être rapporteur
de cette thèse de doctorat. Vos travaux en épidémiologie clinique et en biostatistique
m’ont beaucoup appris. Veuillez recevoir toute ma gratitude et mon plus profond
respect.
Je remercie Monsieur Patrick BOSSUYT d’avoir accepté d’être rapporteur de cette
thèse de doctorat. Votre excellence dans le domaine de l’épidémiologie clinique et de la
méthodologie des études diagnostiques est une source d’enseignement pour moi.
Veuillez recevoir toute ma gratitude et mon plus profond respect.
Je remercie Madame Claire POYART d’avoir accepté de faire partie du jury de cette
thèse de doctorat. J’ai eu l’occasion de lire certaines de vos nombreuses publications
dans le domaine de l’infection par le streptocoque du groupe A et j’espère que mon
intérêt pour ce pathogène m’amènera un jour à travailler avec vous. Veuillez recevoir
toute ma gratitude et mon plus profond respect.
Je remercie Monsieur Olivier LORTHOLARY d’avoir accepté de faire partie du jury
de cette thèse de doctorat. Votre expérience de clinicien et de chercheur dans le
domaine des maladies infectieuses est un modèle pour mon exercice futur. Veuillez
recevoir toute ma gratitude et mon plus profond respect.
Je remercie Monsieur Didier GUILLEMOT d’avoir accepté de présider le jury de cette
thèse de doctorat. Vos compétences en épidémiologie des maladies infectieuses,

notamment dans le domaine de la consommation d’antibiotiques et des résistances
bactériennes aux antibiotiques, vous permettent de porter sur cette thèse un regard
critique qui m’est précieux. Veuillez recevoir toute ma gratitude et mon plus profond
respect.
Je remercie Monsieur Martin CHALUMEAU de m’avoir proposé puis d’avoir dirigé
ce travail doctoral. J’ai eu la chance de bénéficier de ton enseignement, de ton soutien et
de ta disponibilité tout au long de ce travail et je t’en remercie sincèrement. J’espère
avoir été à la hauteur de la qualité de ton encadrement et de ta grande générosité.
Accepte de trouver ici le témoignage de ma sincère reconnaissance et de mon plus
profond respect.
Je remercie tous ceux qui ont permis de mener à bien ce travail doctoral :
- Monsieur Philippe RAVAUD, directeur de l’unité Inserm U1153, notamment pour
son soutien à la poursuite fructueuse de ces travaux ;
- Monsieur Pierre-Yves ANCEL, responsable de l’équipe EPOPé, unité Inserm U1153
;
- Monsieur François GOFFINET, directeur de l’unité Inserm U953 ;
- Madame Corinne LEVY et Monsieur Philippe BIDET, qui ont eu un rôle primordial
dans l’étude ACTIV TDR SGA et qui ont nourri le travail doctoral de leur expertise ;
- Les pédiatres investigateurs de l’étude ACTIV TDR SGA : les Dr. Mohamed
BENANI, François CORRARD, Patrice DEBERDT, Annie ELBEZ, Marie
GOLDREY, Juliette GOSSELIN, Marc KOSKAS, Patrick MARTIN, Anne-
Sylvestre MICHOT, Nadia PANIS, Douah QUTOB, Catherine ROMAIN, Olivier
ROMAIN, Catherine SCHLEMMER, Franck THOLLOT et Alain WOLLNER ;

- Les microbiologistes et techniciens de microbiologie de l’étude ACTIV TDR SGA :
Madame Patricia MARIANI-KURKDJIAN, Mademoiselle Camille D'HUMIÈRES
et Madame Sandrine LIGUORI ;
- Les membres de l’unité Inserm U953 et de l’équipe EPOPé, et en particulier : Madame
Jeanne-Sophie BERLIN, Madame Béatrice BLONDEL, Madame Marie-Hélène
BOUVIER-COLLE, Monsieur Ricardo CARBAJAL, Madame Catherine
DENEUX-THARAUX, Madame Nine GLANGEAUD, Madame Sophie
GOUVAERT, Madame Françoise MAILLARD et Madame Jennifer ZEITLIN ;
- Mes collègues et amis étudiants en thèse : Nathalie BERTILLE, Marie-Pierre
BONNET, Jean-François BRASME, Anne CHANTRY, Bénédicte COULM,
Xavier DURRMEYER, Romain GUEDJ, Cyrille HUCHON, Elise LAUNAY et
Karim TARARBIT.
Je tiens à remercier particulièrement Monsieur Robert COHEN. Vous m’avez fait
l’honneur de me proposer de travailler avec vous sur un sujet qui vous tient à cœur.
J’admire votre énergie et votre enthousiasme et j’espère avoir la chance de pouvoir
continuer à collaborer avec vous et à bénéficier de vos enseignements.
Je souhaite remercier chaleureusement Madame Josette RAYMOND et Monsieur
Dominique GENDREL. Votre enseignement clinique et théorique en infectiologie
pédiatrique, vos encouragements et votre bienveillance tout au long de mon internat et
de ce travail doctoral m’ont aidé à surmonter les obstacles que j’ai pu rencontrer.
Mes remerciements vont à Monsieur Babak KHOSHNOOD. Les discussions que nous
avons eues autour d’aspects méthodologiques et statistiques de ce travail doctoral me