Plateforme hospitalière de génétique moléculaire des cancers de
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Plateforme hospitalière de génétique moléculaire des cancers de Midi-Pyrénées Pr Eric Delabesse Laboratoire d’Hématologie CHU Purpan [email protected] Plateformes de diagnostic moléculaire des cancers Purpan Hématologie ACP ICR Biochimie ACP Rangueil ACP Purpan Hématologie ACP ICR Biochimie ACP Rangueil ACP Contexte • Président de la République, discours du 27 Avril 2006 « Les plateformes destinées à établir la carte d’identité des tumeurs doivent se développer au sein de tous les pôles régionaux de cancérologie » • Génétique moléculaire outil indispensable – Diagnostic – Classification – Choix et surveillance du traitement des cancers • Surtout si thérapeutique ciblée • Exemple – Leucémie myéloïde chronique et Glivec (Imatinib) Plateformes cibles • Collectif de différents laboratoires – Appartenant ou non au même établissement – Ensemble des techniques indispensables de génétique moléculaire • Cytogénétique chromosomique et moléculaire (FISH) • Génétique moléculaire – Mesure de l’expression génique – Détection de mutations ponctuelles, de translocations, de délétions ou d’amplifications – Assurer un chaînage des informations du prélèvement analysé • Développement de complémentarités nécessaires – Tumorothèques à visée sanitaire – Laboratoires d’anatomo-pathologie ou d’hémato-cytopathologie • Rôle essentiel de la phase pré-analytique du prélèvement – Recherche • Passage rapide de la recherche à l’utilisation en diagnostic de routine Engagement des demandeurs • Crédits accordés exclusivement pour activité de génétique moléculaire clinique • Maintien de l’intégralité des dotations déjà existantes • Rendre rapidement les résultats • Bilan d’activité annuel à l’INCa Moyens 2010 • Prise en charge complète • Trois programmes en cours – Cancers colo-rectaux : KRAS, 118 k€ • Coordinatrice : Dr Janick Selves – Cancers pulmonaires : EGFR, 70 k€ • Coordinatrice : Dr Isabelle Rouquette – Leucémies myéloïdes chroniques : BCRABL1, 84 k€ • Coordinateur : Pr Éric Delabesse AO Biomarqueurs émergents • Mise en place préventive d’outils de recherche diagnostique de biomarqueurs émergents • Demandé 310.429 € – Poumon • ACP_Rg 159.841 € • Biol_ICR 2.025 € – Cancer pulmonaire – Cancer colo-rectal – Mélanome – Colo-rectal • ACP_Pp 127.908 € – Mélanome • ACP_Pp 17.820 € • Hemato_Pp 2.835 € • Obtenu 106.800 € – Poumon • ACP_Rg 54.991,70 € • Biol_ICR 696,68 € – Colo-rectal • ACP_Pp 44.005,47 € – Mélanome • ACP_Pp 6.130,79 € • Hemato_Pp 975,35 € AO Biomarqueurs émergents Poumons • Coordinatrice : Dr Isabelle Rouquette – • • Adénocarcinome du poumon chez lesquels une mutation activatrice de l'EGFR a par ailleurs déjà été recherchée.. Le financement concerne: – – – – – – • 56 k€ mutations de résistance de l'EGFR ; mutations de KRAS : exon 2 (codons 12 et 13) ; mutation de BRAF V600E ; mutations de PIKCA : exons 9 et 20 ; mutations de HER2 : exon 20 ; translocation d'EML4-ALK par FISH Ne rentrent pas dans le cadre de cette demande de subvention: – – – – les études en immunohistochimie pour compléter la recherche par FISH des translocations d'EML4-ALK ; la recherche des mutations de résistance de l'EGFR sur des patients en progression ; la recherche des mutations rares de PI3KCA et de KRAS ; les frais de renvoi des blocs aux pathologistes. AO Biomarqueurs émergents Colo-rectal • Coordinatrice : Dr Janick Selves – • • Cancer colorectal chez lesquels une mutation de KRAS a par ailleurs été recherchée Le financement concerne: – – • 44 k€ mutation de BRAFV600E ; recherche du statut MSI pour les patients chez lesquels un test KRAS a déjà été effectué et âgés de moins de 60 ans. Ne rentrent pas dans le cadre de cette demande de subvention: – – – les tests MSI pour l'ensemble des patients de moins de 60 ans; l'étude d'expression des protéines MMR par IHC et l'étude des promoteurs de MLHl encomplément du test MSI ; la recherche des mutations de PI3KCA. AO Biomarqueurs émergents Mélanomes • Coordinatrice : Pr Laurence Lamant – • • 7 k€ Mélanome métastatique Le financement concerne : – – mutation de BRAFV600E ; mutations de KIT : exons 11, 13, 17 et 18 ; Réunion coordonnateurs 19 janvier 2011 (1) • 1. Indications de prescription des tests EGFR dans le cancer du poumon; – Analyse 3 premiers trimestres de 2010 • • • • • • • – Combien de patients à tester? • • • • – 11846 tests Taux ininterprétables 5.8% Positifs EGFR 10.6% Pas d’effet de technique 40/41 labos font X19 et X20 27/41 font X18 29/41 font X20 Age (proposition < 80 ans) Type (4.4 fois plus de mutations dans les adénocarcinomes par rapports aux antres cancers pulmonaires) Stade? Proposition de restreindre la recherche aux adénocarcinomes non à petites cellules non épidermoïdes de moins de 80 ans (estimation de 22.200 patients à tester) Forte demande clinique d’avoir un délai médian de résultat de 10 jours… • 2. Projet de recueil des données cliniques et moléculaires et de suivi des patients (cancer colorectal, cancer du poumon, mélanome) – – A titre rétrospectif pour 2010 A titre prospectif – C’est un projet sur un corpus minimal de collecte de données cliniques Qui as du temps libre pour aller chercher les informations?? – Réunion coordonnateurs 19 janvier 2011 (2) • 3. Programme Biomarqueurs Emergents: – • • • • • Centralisation actuelle en Belgique Sonde « similaire » à celle des lymphomes Kit poumon commercialisé en mai 2011 Formation d’Abbott en 2 sessions 7 plateformes associés aux tests des inhibiteurs (Hôtel-Dieu) Autres plateformes un jour… Nécessité d’un contrat type avec Abbott avant tout test de la sonde commercialisée Développement de techniques alternatives à la FISH EML4-ALK • • – 4. Assurance qualité – Point d'information sur la mise à disposition de la sonde EML4-ALK • • – • IHC, RTPCR Possible mais à valider par rapport à la technique de référence du FISH qui est la seule reconnue pour l’instant Stratégies d'analyse pour les différents biomarqueurs Hétérogène • • • – Volonté de l’INCa de faire émerger en priorité des CQ pour • • • • Structuration en onco-hématologie CQ européen pour KRAS Initiatives régionales BCR-ABL1 KRAS EGFR 5. Informations diverses: – – Charte des plateformes Programme de visites des plateformes • Arrivée INCa Visite à Toulouse le 25 octobre 2010 – Frédérique Novak, Julien Blin Visite INCa - Présentation plateforme (E. Delabesse) Visite INCa - Laboratoire Hématologie (E. Delabesse, V. De Mas, N. Dastugue, S. Dobbelstein) Visite INCa - Laboratoire ACP Purpan (E. Delabesse, J. Selves, L. Lamant, P. Brousset) Visite INCa - Laboratoire ACP Rangueil (E. Delabesse, M.B. Delisle, I. Rouquette) Visite INCa - Laboratoires ICR (E. Delabesse, C. Toulas, P. Rochaix) Visite INCa - Réunion Purpan (Administratif, biologistes, pathologistes, cliniciens) Départ INCa 9:10 10:00 11:00 12:00 14:00 15:30 17:00 19:45 Purpan Hématologie ACP ICR Biochimie ACP Rangueil ACP
