Microbiologie - ceil@univ

3éme
ANNEE
FACULTE DE MEDECINE
D’ALGER.DEPARTEMENT
DE MEDECINE.CYCLE
GRADUE.
COMITE PEDAGOGIQUE
DE MICROBIOLOGIE
[CAHIER MODULE
MICROBIOLOGIE]
Dans ce cahier vous trouverez les informations relatives au module : les objectifs d’enseignement, les
intitulés des cours, les modalités d’enseignement, et d’évaluation, les références bibliographiques, le
programme des cours.

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Durée une année
1. Objectifs pédagogiques
Objectifs généraux
1) Acquérir les concepts nécessaires pour le diagnostic des infections
bactériennes et virales
2) Acquérir les bases nécessaires pour le traitement antibactérien et antiviral
3) Acquérir les connaissances nécessaires pour la mise en place de la
prévention primaire et secondaire des infections bactériennes et virales.
4) Appliquer certaines techniques de base de diagnostic bactériologique et
virologique au laboratoire
BACTERIOLOGIE
Objectifs intermédiaires
Acquérir les concepts nécessaires pour le diagnostic des infections bactériennes
1. Définir les bases fondamentales de la structure et de la physiologie des
bactéries
2. Décrire Les bactéries d’intérêt médical et leur pouvoir pathogène.
3. Décrire le diagnostic bactériologique (prélèvements, méthodes et
interprétation).
Objectifs spécifiques
Définir les bases fondamentales de la structure et de la physiologie des bactéries
1) Définir les bactéries
2) Classer les bactéries
3) Décrire les bases de la physiologie bactérienne
4) Définir les principaux éléments génétiques des bactéries.
5) Décrire les principaux mécanismes génétiques des bactéries.
6) Décrire les différents types de relation hôte/bactérie.
Décrire les bactéries d’intérêt médical et leur pouvoir pathogène.
1) Reconnaitre les caractéristiques morphologiques, culturales et
biochimiques spécifiques des bactéries.
2) Décrire les critères de classification des bactéries d’intérêt médical en
famille, genre et espèce.

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3) Décrire la physiopathologie des infections bactériennes : porte d’entrée,
modes de contamination et mécanisme physiopathologique.
4) Décrire le pouvoir pathogène des bactéries.
5) Corréler les bactéries à l’infection en cause.
Décrire le diagnostic bactériologique
1) Indiquer les différents prélèvements à effectuer, en fonction de l’infection et
de l’agent étiologique suspecté.
2) Décrire les modalités de prélèvement, de transport et de conservation
3) Rappeler l’importance de la fiche de renseignement qui doit accompagner
le prélèvement
4) Enumérer les différentes étapes du diagnostic bactériologiques
direct : microscopie, culture, identification biochimique, identification
moléculaire, tests rapides, tests de sensibilité aux antibiotiques.
5) Enumérer les différentes étapes du diagnostic bactériologiques indirect :
sérologie, test rapide
6) Indiquer la démarche diagnostic bactériologique à suivre en fonction de
l’infection et de l’agent suspecté, en respectant la hiérarchisation des
examens
7) Interpréter les résultats d’analyses bactériologiques
Objectifs intermédiaires
Acquérir les bases nécessaires pour le traitement antibactérien
Définir les antibiotiques
- Classer les antibiotiques
- Définir les modes et spectre d’action.
- Décrire les principaux mécanismes de résistance aux
antibiotiques.
- Décrire et Interpréter les résultats des tests de sensibilité des
bactéries aux antibiotiques.
III - Acquérir les connaissances nécessaires pour la mise en place de la
prévention primaire et secondaire des infections bactériennes.
1. Définir les moyens de prévention primaire
2. Définir les moyens de prévention secondaire : sérothérapie
3. Définir les infections associées aux soins et les moyens de
prévention
1- Définir les moyens de prévention primaire
- Définir les différentes mesures de prévention des
infections bactériennes
- Définir la vaccination
- Décrire les bases immunologiques de la vaccination
- Indiquer les différents types de vaccinsbactériens
- Lister les indications des différents vaccins
- Lister les contres indications des différents vaccins

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- Lister les effets secondaires des différents vaccins
- Décrire le calendrier vaccinal en Algérie
2- Définir les moyens de prévention secondaire : sérothérapie
- Définir les différentes mesures de prévention des
infections bactériennes
- Rappeler les bases immunologiques de la sérothérapie
- Lister les indications de la sérothérapie.
3- Définir les infections associées aux soins et les moyens de
prévention
- Acquérir les concepts d’hygiène générale de base : hygiène des
mains, hygiène d’environnement, les isolements protecteurs et
sources
- Définir les antiseptiques et leurs indications
- Définir les désinfectants et leurs indications
- Définir les différentes méthodes de stérilisation
IV. Appliquer certaines techniques de base de diagnostic
bactériologique au laboratoire.
1. Appliquer des techniques bactériologiques
- Effectuer un examen microscopique : lire au microscope optique,
mise au point, lecture de lame, état frais, les colorations (Bleu de
méthylène, Gram).
- Effectuer un isolement sur milieux de culture bactérienne
- Reconnaitre les caractéristiques d’une culture bactérienne
- Reconnaitre les caractéristiques biochimiques d’une culture
bactérienne
- Identifier les bactéries selon leurs caractéristiques culturales et
biochimiques.
- Lire et interpréter les tests de sensibilité : antibiogramme.
OBJECTIFS DE LA VIROLOGIE
I- Acquérir les concepts nécessaires pour le diagnostic des infections
virales
1- Définir les bases fondamentales de la structure et de la physiologie des
virus
2- Décrire Les virus d’intérêt médical et leur pouvoir pathogène.
3- Décrire le diagnostic virologique (prélèvements, méthodes et interprétation).
1. Définir les bases fondamentalesde la structure et de la physiologie des
virus
- Définir les virus.
- Classer les virus
- Décrire les bases de la physiologie virale.
- Définir les principaux éléments génétiques des virus.
- Décrire les principaux mécanismes génétiques des virus.

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- Décrire les différents types de relation hôte/virus.
2. Décrire les virus d’intérêt médical et leur pouvoir pathogène.
- Reconnaitre les bases morphologiques spécifiques des virus.
- Décrire les critères de classification des virus d’intérêt médicale
- Décrire la physiopathologie des infections virales : porte d’entrée,
modes de contamination et mécanisme physiopathologique.
- Décrire le pouvoir pathogène des virus.
- Corréler les virus à l’infection en cause.
3. Décrire le diagnostic virologique
- Indiquer les différents prélèvements à effectuer, en fonction de
l’infection et de l’agent étiologique suspecté.
- Décrire les modalités de prélèvement, de transport et de
conservation.
- rappeler l’importance de la fiche de renseignement qui doit
accompagner le prélèvement
- Enumérer les différentes étapes du diagnostic virologique
direct : recherche d’antigène viraux, culture cellulaire, isolement,
tests rapides et techniques de biologie moléculaire.
- Enumérer les différentes étapes du diagnostic virologique indirect :
tests immunoenzymatiques, tests d’agglutination, tests rapides.
- Indiquer la démarche du diagnostic virologique à suivre en fonction
de l’infection et de l’agent suspecté, en respectant la hiérarchisation
des examens
- Interpréter les résultats d’analyses virologiques
II -Acquérir les bases nécessaires pour le traitement antiviral
1. Définir les antiviraux
- Classer les antiviraux
- Définir le mode d’action et les cibles des antiviraux
- Identifierles limites des antiviraux.
- Reconnaitre les indications thérapeutiques des antiviraux.
III - Acquérir les connaissances nécessaires pour la mise en place de la
prévention primaire et secondaire des infections virales.
1. Définir les moyens de prévention primaire
2. Définir les moyens de prévention secondaire : sérothérapie
3. Définir les infections associées aux soins et les moyens de
prévention
1. Définir les moyens de prévention primaire
- Définir les différentes mesures de prévention des infections virales
- Définir la vaccination
- Décrire les bases immunologiques de la vaccination
- Indiquer les différents types de vaccins viraux
- Lister les indications des différents vaccins
- Lister les contres indications des différents vaccins
- Lister les effets secondaires des différents vaccins
- Décrire le calendrier vaccinal en Algérie