THESE : Régulation moléculaire de la compétence

THESE : Régulation moléculaire de la compétence ovocytaire chez les poissons au cours d'un processus de domestication Contrat doctoral de l'Université 3 ans
Extrait du Société Française de Biologie du Développement / French Society for
Developmental Biology
http://www.sfbd.fr
THESE : Régulation
moléculaire de la compétence
ovocytaire chez les poissons
au cours d'un processus de
domestication Contrat doctoral
de l'Université 3 ans
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Date de mise en ligne : vendredi 22 juin 2012
Date de parution : 22 décembre 2012
Société Française de Biologie du Développement / French Society for
Developmental Biology
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THESE : Régulation moléculaire de la compétence ovocytaire chez les poissons au cours d'un processus de domestication Contrat doctoral de l'Université 3 ans
Unité de Recherche Animal et Fonctionnalités des Produits Animaux (URAFPA) Equipe Domestication en
Aquaculture Continentale (DAC)
Pr. Pascal Fontaine Dr. Bérénice Schaerlinger
[email protected]
Nancy (Lorraine)
Contexte et positionnement du projet :
Avec les baisses drastiques de prise de pêche, une alternative réside dans l'aquaculture qui s'est fortement
développée ces 30 dernières années et représente actuellement la moitié des poissons consommés. Toutefois, le
mode de développement actuel de la pisciculture questionne fortement nos sociétés et ses citoyens face aux enjeux
pour un développement durable de l'activité. Un modèle de développement consisterait à promouvoir une
diversification reposant sur la domestication d'espèces autochtones aux zones d'élevage. Cette approche permettrait
de limiter ces risques environnementaux tout en s'adaptant mieux aux marchés locaux. Cependant, ce modèle de
développement nécessite la compréhension des modifications intrinsèques aux poissons qui opèrent au cours du
processus de domestication et de l'effet des conditions de vie qui conduisent à ces modifications. Parmi les fonctions
biologiques affectées par le processus de domestication, la reproduction revêt un intérêt particulier car c'est une
fonction clé (maîtrise la reproduction indispensable pour la mise en oeuvre de programme de sélection). Dans ce
contexte, notre équipe étudie l'effet de ces mécanismes chez la perche commune Perca fluviatilis. Les performances
de reproduction dépendent fortement de la qualité des gamètes, en particulier celle des ovules qui contiennent la
majeure partie du matériel cellulaire nécessaire aux premières étapes du développement embryonnaire. Nous
cherchons à comprendre quels mécanismes moléculaires, contrôlant la qualité des ovules et donc les performances
de reproduction, sont affectés par le processus de domestication. Récemment, une analyse protéomique en
2D-DIGE nous a permis de mettre en évidence plusieurs protéines dont l'expression est potentiellement liée à la
qualité des ovules. Cette technique a permis de mettre en lumière plusieurs processus cellulaires (par exemple le
métabolisme énergétique ou la réponse cellulaire au stress) semblant être affectés dans des pontes de qualité
médiocre ou moyenne.
Objectifs et méthodologie du projet :
Le(a) candidat(e) étudiera plus précisément l'un de ces mécanismes cellulaires chez la perche commune. La voie
moléculaire étudiée sera identifiée après une étude préliminaire visant à préciser le mécanisme affectant le plus les
performances de reproduction. L'étudiant(e) déterminera alors quelles sont les conséquences de la dérégulation de
ce processus moléculaire sur le développement embryonnaire (stade de mortalité et phénotype associé,
identification du/des tissus malformés) par des techniques de microscopie (time lapse vidéo, hybridation in situ sur
embryon entier). Puis, il/elle étudiera plus précisément pourquoi cette voie est indispensable au développement des
embryons en modulant artificiellement l'expression de certaines protéines impliquées dans cette voie de transduction
par injection de morpholino (répression) et d'ARNm (activation). Ce travail sera fait en collaboration avec l'équipe de
Julien Bobe à l'INRA de Rennes chez une espèce modèle, le poisson zèbre. Le suivi du développement des
embryons injectés sera alors effectué par microscopie, hybridation in situ et immunomarquage. Ces expériences
permettront de mieux comprendre comment les voies de transductions (cascade de régulations protéiques) sont
affectées par la dérégulation de nos protéines d'intérêt. En parallèle à ce travail, l'étudiant(e) s'attachera à
comprendre comment et pourquoi cette fonction cellulaire est affectée au cours du processus de domestication des
perches et donc de déterminer les conditions extrinsèques (alimentation, origine des géniteurs) et intrinsèques
(niveau de stress, taux des hormones sexuelles) susceptibles de modifier la synthèse des protéines associées à
cette voie. Ces travaux nous permettront, à l'avenir, de mieux comprendre comment le processus de domestication
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affecte les géniteurs de perche, d'améliorer les performances de reproduction de cette espèce et donc la production
de poissons des pisciculteurs. Enfin, les protéines associées à ce processus intracellulaire pourraient constituer des
indicateurs moléculaires de la qualité des ovules, susceptibles de prédire les éventuels défauts de développement
des embryons.
Pour toute candidature envoyez un CV détaillé, une lettre de motivation et une lettre de recommandation
aux adresses suivantes :
Bérénice Schaerlinger : [email protected] Pascal Fontaine : [email protected]
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