Sujet de stage : Effet des origines et trajets des eaux - lha

Sujet de stage : Effet des origines et trajets des eaux de surface dans les Alpes du Sud sur
l’abondance de la bactérie phytopathogène Pseudomonas syringae dans ces eaux.
Responsables/contact :
Cindy E. Morris, INRA-Avignon, Unité de Pathologie Végétale
Tél : 04-32-72-28-86
[email protected]
En collaboration avec Yves Travi, LHA
Ce sujet a son origine dans notre observation récente de la présence de la bactérie
phytopathogène Pseudomonas syringae dans les eaux de surface des Alpes du Sud. Nous
l’avons détectée dans plusieurs lacs à 2600 m d’altitude (Lac Foréant au Col Vieux et les lacs
Bes et Longet au Col du Longet) et dans les cours d’eau (le Riou Mounal sur plusieurs sites
entre le Col de Vars et St. Paul sur Ubaye, et sur plusieurs sites le long de l’Ubaye jusqu’au
Lac de Serre Ponçon) à des densités de 100 – 1000 bactéries/L. C’est la première fois qu’une
telle abondance d’une bactérie phytopathogène est mise en évidence dans des eaux en dehors
des écosystèmes agricoles. L’objectif du stage serait d’évaluer l’impact de l’origine des eaux
et des différents réseaux hydrologiques sur l’abondance de cette bactérie dans l’eau afin
d’identifier les contextes spatio temporels qui favorisent sa survie et sa dissémination depuis
les précipitations (neige et pluie) jusqu’aux eaux de la Durance utilisées en arrosage. Les
travaux impliqueraient 1) la caractérisation des réseaux et des régimes hydrologiques
(bibliographie) pour mettre au point un plan d’échantillonnage représentatif des différentes
conditions hydrologiques dans les Alpes du Sud, 2) l’échantillonnage sur le terrain avec
analyses physico-chimiques in situ (Juin), 3) l’analyse micro biologique des eaux afin de
quantifier l’abondance de P. syringae.