Interactions génotype x environnement dans un contexte d

Interactions génotype x environnement
dans un contexte d'amélioration des plantes
Brigitte Courtois, Cirad, UMR DAP
Octobre 2011
Master BPT, module Stress Abiotiques
Courtois_1
Master BPT, module Stress Abiotiques

Problème des interactions GxE
abordé sous l'angle de la sélection variétale
Basé sur une expérience de
sélection du riz pluvial pour
l'Asie
Chez le riz, la méthode classique
pour créer des lignées pures est
pour créer des lignées pures est
la sélection généalogique.
– Croisements entre variétés
complémentaires
– Test et sélection des
descendances sur plusieurs
générations
Mais les environnements cibles
sont très variés

Les variétés répondent différemment
dans différents environnements
Les performances d'une variété (rendement, cycle, etc.) varie
d'un environnement à un autre.
Pour pouvoir conseiller une variété ou pratiquer une sélection, il
Pour pouvoir conseiller une variété ou pratiquer une sélection, il
est nécessaire d'évaluer l'importance de ces variations et d'en
comprendre la source: pratique culturales, stress biotiques ou
abiotiques...
Décomposition de la variation: σ2P= σ2G+ σ2E+σ2GxE
Phénotype = Génotype + Environnement + Interactions GxE

Les différents types d'interactions GXE
Interaction :
non-additivité
V4
Interaction :
changement de rang
Rendement
Pas
d'interaction
E1
--
E2
-
E3
+
E4
++
E5
+++
V2
V3
E1
--
E2
-
E3
+
E4
++
E5
+++
V2
V1
V2
E1
--
E2
-
E3
+
E4
++
E5
+++
Niveau de fertilité
ou de stress

Si très large gamme d'environnements:
Interaction :
non-
additivité
V3
Interaction :
changement
de rangs
Rendement
E1
--
E2
-
E3
+
E4
++
E5
+++
V2
V3
E1
--
E2
-
E3
+
E4
++
E5
+++
V2
E7
+++++
E6
++++
Niveau de fertilité
ou de stress