Commensal - Collège de France

Commensal ou pathogène, tout est-il
écrit dans le génome?
Erick Denamur
Collège de France
16 Décembre 2015

Commensalisme
cum « avec », mensa « table » : « qui mange à la même table »
Une association entre la bactérie et son hôte sans conséquence pour chacun
Mutualisme
Une relation entre deux organismes dans laquelle les deux sont bénéficiaires
Pathogène
Un microbe capable de causer des dommages à l’hôte
Pathogène opportuniste
Un microbe capable de causer des dommages à l’hôte quand les défenses
de celui-ci sont diminuées
Virulence
La capacité relative pour un microbe de causer des dommages à l’hôte
Saprophytisme
La vie dans l’eau ou le sol sans dépendre d’un autre être vivant
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Un peu de vocabulaire

Un candidat idéal : Escherichia coli
• Un savoir considérable accumulé sur une souche modèle :
« K-12 »
• Une grande diversité :
- 1020 cellules de E. coli estimées sur terre
- Styles de vie variés

Habitat
primaire
Habitat
secondaire
Intestinal (diarrhées) Extra-intestinal
Pathogène 1 M de morts / an
Tube digestif des vertébrés
Homme = 108 E. coli / g de fèces
Commensal ou Mutualiste?
(protège l’hôte de la colonisation par des pathogènes,
est protégé de l’extérieur dans un milieu nutritif riche;!
Saprophyte

• Infections localisées
- infections urinaires
basse=cystite ; haute=pyélonéphrite
- suppurations profondes (abdominales)
- pneumonies
• Infections généralisées
- septicémies/bactériémies
(point de départ urinaire, digestif)
- une forme particulière (rare)
méningite néonatale avec septicémie
Un pouvoir pathogène extra-intestinal varié