CAHIER DE TEXTES 2016-2017
Jeudi 01/09/16
2h
Accueil des élèves
Vendredi
02/09/16
3h - TP
TP n° 1 : ORGANISATION FONCTIONNELLE DE LA CELLULE :TECHNIQUES D'ETUDE ET
DIVERSITE DES TYPES CELLULAIRES
I - OBSERVATION DE CELLULES EN MICROSCOPIE OPTIQUE
A - QUELQUES TECHNIQUES D’EXPLORATION EN MICROSCOPIE
OPTIQUE
1° Principe de la microscopie optique
2° Techniques permettant d’améliorer l’observation en microscopie optique
B - OBSERVATION DE CELLULES EUCARYOTES
1° Observation de cellules mortes : préparation « du commerce » de cellules
sanguines
Cours - 1h
PARTIE I : DES MOLECULES DU VIVANT A LA CELLULE : ORGANISATION
FONCTIONNELLE
I - A : Organisation fonctionnelle des molécules du vivant
Chap 1: Une chimie particulière du vivant
I. LES CELLULES SONT CONSTITUEES D'UN PETIT NOMBRE D'ATOMES
INTERAGISSANT ENTRE EUX POUR FORMER DES MOLECULES ORGANIQUES
A. Une composition atomique déterminant une chimie particulière du vivant
B. Des atomes s'incorporant à des molécules variées
1) Différents types de liaisons
a) Des liaisons covalentes
Mardi 06/09/16
2h - Cours
b) Des liaisons non covalentes
2) Différents types de molécules
C. Des molécules portant des radicaux et fonctions variés sur leurs atomes de
carbone
1) Des radicaux peu réactifs
2) Des fonctions plus réactives
II. LES CELLULES SONT CONSTITUEES MAJORITAIREMENT D'UNE MOLECULE
MINERALE, L'EAU
1) Une molécule polaire
2) Un solvant pour de nombreuses molécules
a) Des molécules polaires
b) Des molécules de petite taille
3) Un milieu modifiant les interactions faibles entre molécules
4) Un milieu permettant des réactions acido-basiques
5) Un milieu aux propriétés thermiques particulières
Mardi 06/09/16
2h - TIPE
Classe entière
Présentation des épreuves de concours.
Présentation des TIPE.
Mercredi
07/09/16
4h - Cours
III. LES PETITES MOLECULES BIOLOGIQUES EN MILIEU AQUEUX SONT MODIFIEES PAR
DES REACTIONS CHIMIQUES QUI LES DIVERSIFIENT
1) Des réactions de réarrangement (d'isomérisation)
a) Conversion en isomères optiques possédant des propriétés chimiques et
physiques quasiment identiques
b) Conversion en isomères possédant des groupes fonctionnels différents
2) Des réactions d'addition
a) Hydratation
b) Estérification
c) Aldolisation
3) Des réactions d'oxydoréduction
a) Principe de l'oxydoréduction
b) Oxydoréduction des molécules biologiques
Chap 2 : Organisation fonctionnelle des petites molécules organiques
I. DES PETITES MOLECULES PRESENTANT UNE UNITE CHIMIQUE ET UNE DIVERSITE
FONCTIONNELLE : LES GLUCIDES
A. Des monomères : les oses
1) Des molécules réductrices
2) Des molécules chirales
a) L'origine de l'isomérie : la présence d'un carbone asymétrique
Vendredi
09/09/16
3h - TP
TP n° 1 (suite) : ORGANISATION FONCTIONNELLE DE LA CELLULE :TECHNIQUES
D'ETUDE ET DIVERSITE DES TYPES CELLULAIRES
2° Observation de cellules vivantes
C - OBSERVATION DE BACTERIES : FROTTIS DE BACTERIES DU YAOURT
II - OBSERVATION DE CELLULES EN MICROSCOPIE ELECTRONIQUE
A - LES TECHNIQUES DE MICROSCOPIE ELECTRONIQUE
1° Principe de la microscopie électronique et comparaison avec la microscopie
optique
2° Quelques techniques complémentaires d'exploration en microscopie
électronique
B - EXPLOITATION DE MICROGRAPHIES
1° Des cellules végétales
2° Des cellules animales
3° Des cellules eucaryotes ni animales, ni végétales : les cellules fongiques
2° Des cellules non eucaryotes : les eubactéries
BILAN
Mardi 13/09/16
2h - Cours
b) Les principaux oses et leurs stéréo-isomères
Les aldoses
Les cétoses
3) Des molécules existant le plus souvent sous forme cyclique
a) La cyclisation des oses
b) Les conséquences de cette cyclisation : l'apparition d'un nouveau carbone
asymétrique
4) Des molécules ayant un rôle central dans le métabolisme
a) Les oses peuvent être phosphorylés
b) Les oses sont oxydés par la voie de la glycolyse
c) Les oses sont produits par la voie du cycle de Calvin
B. Des dérivés d'oses résultant de la modification d'une fonction
1) Perte d'une fonction alcool
2) Substitution d'une fonction alcool par une fonction amine
3) Oxydoréduction d'une fonction
a) Oxydation d'une fonction alcool primaire
b) Réduction de la fonction aldéhyde ou cétone
Mardi 13/09/16
2h - TIPE
Méthodologie : les khôlles.
Classe entière
1ère séance : Quelques aspects de la démarche expérimentale.
Mercredi
14/09/16
4h - Cours
C. Des dimères : les di-osides
1) La formation des di-osides = la liaison O-glycosidique
2) Les principaux di-osides et leurs propriétés fonctionnelles
II. DES PETITES MOLECULES PRESENTANT UNE DIVERSITE CHIMIQUE ET
FONCTIONNELLE : LES LIPIDES
A. Des lipides formés d'esters d'acides gras et de glycérol
1) Les propriétés des acides gras présents dans les lipides
a) Des molécules saturées ou insaturées
Les acides gras saturés
Les acides gras insaturés
b) Des molécules pouvant se trouver à l'état solide ou liquide
c) Des molécules insolubles dans l'eau
2) Les triglycérides, des lipides de réserves
a) Des molécules construites à partir du glycérol
b) Des molécules aux propriétés physico-chimiques proches de celles des acides
gras
Point de fusion
Solubilité dans l’eau
c) Des molécules de réserve à rôle énergétique
3) Les glycérophospholipides ou phosphoglycérides, des lipides membranaires
a) Des molécules dérivées de l'acide phosphatidique
b) Des molécules portant divers radicaux liés au phosphate
c) Des molécules amphiphiles constituant les membranes biologiques
B. Des lipides formés à partir d'autres alcools ou d'autres chaines carbonées
1) Des dérivés d'alcools aminés : les sphingolipides
2) Des dérivés d'alcools cycliques : les stéroïdes
a) Des molécules dérivées d'un stérol
b) Des molécules amphiphiles aux rôles variés
3) D'autres lipides ou dérivés de lipides
Vendredi
16/09/16
3h - TP
TP n° 2 : STRUCTURE ET DYNAMIQUE DU GLOBE
I - LA TERRE, UNE PLANETE PARTICULIERE DU SYSTEME SOLAIRE
1° La Terre, une planète tellurique
2° Les caractéristiques astronomiques de la Terre
II - LA STRUCTURE DES ENVELOPPES SOLIDES DE LA TERRE : L'APPORT DES
DONNEES SISMIQUES
A - METHODES D'ETUDE
1° Rappels : séismes et ondes sismiques
2° Etude de la vitesse de propagation des ondes
3° Etude de la trajectoire des ondes
B - RESULTATS
1° Mise en évidence de discontinuités majeures
2° Mise en évidence de différentes zones dans le manteau
III - LA DYNAMIQUE DES ENVELOPPES SOLIDES DE LA TERRE
A - MISE EN EVIDENCE D'UN DECOUPAGE DE LA LITHOSPHERE EN PLAQUES
MOBILES
1° Les limites latérales des plaques
2° Les mouvements horizontaux des plaques
B - MISE EN EVIDENCE D'UNE HETEROGENEITE ET DONC D'UNE DYNAMIQUE
DANS LE MANTEAU
1° Méthode : la tomographie sismique
2° Résultats
Mardi 20/09/16
2h - Cours
III. DES PETITES MOLECULES DERIVEES DES OSES ET AUX FONCTIONS MULTIPLES :
LES NUCLEOTIDES
A. Des molécules composées d'un pentose phosphorylé et d'une base azotée
1) Les nucléosides : des associations d’une base et d’un pentose
a) Les oses
b) Les bases azotées
c) La liaison d'un pentose et d'une base azotée
2) Les nucléotides : des esters-phosphates de nucléosides
B. Des molécules aux fonctions multiples
1) Des intermédiaires énergétiques
a) L’ATP, un intermédiaire énergétique permettant la réalisation de nombreux
travaux cellulaires
Mardi 20/09/16
2h - TIPE
Groupe 1
séance : Obtenir des données
Mercredi
21/09/16
3h - Cours
b) Des nucléotides triphosphates permettant la formation d'intermédiaires de
synthèse
2) Des seconds messagers
3) Des coenzymes
a) Des coenzymes d'oxydoréduction
b) Des coenzymes de transfert de groupement : le coenzyme A
4) Des monomères des acides nucléiques ADN et ARN
IV. DES PETITES MOLECULES DE STRUCTURE VARIEE, MONOMERES DES PROTEINES :
LES ACIDES AMINES
A. Des molécules présentant une dualité chimique
1) Deux groupes fonctionnels responsables de propriétés acido-basiques
a) Structure de base d'un acide aminé
b) Equilibre acido-basique et ionisation des acides aminés
2) Des radicaux variés responsables de nombreuses propriétés physico-chimiques
a) Une solubilité variable en relation avec la nature du radical
b) Des molécules chirales
c) Un ajout possible de groupements sur certains radicaux
B. Des molécules synthétisées à partir d'intermédiaires du métabolisme
C. Des molécules pouvant s'unir par une liaison covalente : la liaison peptidique
1) Formation de la liaison peptidique
2) Géométrie de la liaison peptidique
Chap 3 : Organisation fonctionnelle des macromolécules
I. LES POLYMERES GLUCIDIQUES, DE GRANDS EDIFICES AUX FONCTIONS DIVERSES
A. Des polyosides de réserve
1) L’amidon, forme de stockage du glucose chez les végétaux
Vendredi
23/09/16
3h - TP
TP n° 3 : NATURE, PROPRIETES ET TECHNIQUES D’ETUDE DES BIOMOLECULES
I - RAPPELS : QUELQUES COLORANTS ET REACTIFS CARACTERISTIQUES DES
PRINCIPALES BIOMOLECULES
A - MISE EN EVIDENCE DE GLUCIDES
1° La liqueur de Fehling met en évidence les petits glucides réducteurs
2° L'eau iodée met en évidence certains polymères glucidiques
B - MISE EN EVIDENCE DE PROTIDES
1° La réaction du biuret met en évidence la liaison peptidique
2° La réaction xanthoprotéique met en évidence les acides aminés aromatiques
3° Complément : forme des protéines, température et pH
C - MISE EN EVIDENCE DE LIPIDES
1° Les lipides sont hydrophobes et forment des gouttelettes en solution aqueuse
2° Le rouge Soudan III met en évidence les gouttelettes lipidiques
II - TECHNIQUES DE SEPARATION DE BIOMOLECULES : ELECTROPHORESE ET
CHROMATOGRAPHIE
A - L’ELECTROPHORESE, UNE SEPARATION DE MOLECULES EN
FONCTION DE LEUR MASSE ET DE LEUR CHARGE
1° Principe de la séparation des protéines par électrophorèse
Séparation d'un grand nombre de protéines par électrophorèse
bidimensionnelle
3° Réalisation pratique de la séparation de protéines par électrophorèse
4° Quelques exercices d’application
B - LA CHROMATOGRAPHIE, UNE SEPARATION DE MOLECULES EN
FONCTION DE LEUR AFFINITE POUR LE SUPPORT ET POUR UNE PHASE MOBIL E
1° Principe de la chromatographie
2° Diversité des techniques de chromatographie
III - QUELQUES TECHNIQUES D'ETUDE SPECIFIQUES DES PROTEINES
A - LE SEQUENÇAGE D'UNE PROTEINE
B - LA DETERMINATION DE LA STRUCTURE TRIDIMENSIONNELLE D'UNE
PROTEINE
1° La cristallographie aux rayons X
2° La spectroscopie par RMN
Mardi 27/09/16
2h - Cours
Photo de classe
2) Le glycogène, forme de stockage du glucose chez les animaux
B. Des polyosides de structure
1) La cellulose, macromolécule structurale de la paroi des cellules végétales
2) D'autres homopolymères de structure
3) Quelques hétéropolymères de structure
Mardi 27/09/16
2h - TIPE
Groupe 2
séance : Obtenir des données
Mercredi
28/09/16
3h - Cours
Correction du TP n° 3
C. Des polyosides à rôle informatif
II.LES PROTEINES, DES POLYMERES SEQUENCES D'ACIDES AMINES AUX MULTIPLES
FONCTIONS
A. Les protéines sont organisées selon différents niveaux structuraux à l'origine de
leur fonction
1) Un premier niveau d'organisation : la structure primaire
2) Des liaisons entre les groupements peptidiques à l'origine de motifs locaux : la
structure secondaire
a) Les hélices
b) Les feuillets
3) Des liaisons entre les radicaux des acides aminés à l'origine de la conformation
des protéines : la structure tertiaire
a) Les liaisons impliquées dans la mise en place de la structure IIIre
Mise en évidence
Les diverses liaisons intervenant
Election des délégués
Vendredi
30/09/16
Correction du TP n°2
3h - TP
PARTIE IV : LA CARTE GEOLOGIQUE
La carte géologique
I.LES CARTES GEOLOGIQUES S'APPUIENT SUR UNE REPRESENTATION DE LA
SURFACE TOPOGRAPHIQUE
1) Outils et méthodes
a) Le recueil de données
b) Le traitement des données
2) Résultats : cartes topographiques et MNT
a) La carte topographique
Les informations permettant de lire une carte topographique
La lecture du relief
Application : un extrait de la carte IGN TOP 25 "Nice-Menton"
b) Le modèle numérique de terrain (MNT)
II.LES CARTES GEOLOGIQUES REPRESENTENT LES STRUCTURES ET LES
FORMATIONS GEOLOGIQUES OBSERVABLES A L'AFFLEUREMENT
1) Outils et méthodes
a) Le recueil de données
b) Le traitement des données
2) Résultats : les différentes cartes géologiques
a) Des cartes à différentes échelles pour différents usages
b) Des cartes sur lesquelles se trouvent différentes informations
Informations géographiques
Informations géologiques
III.D'AUTRES GEOCARTES FOURNISSENT DES RENSEIGNEMENTS DE NATURE
DIFFERENTE
1) Des cartes géophysiques
2) Des cartes des différentes ressources naturelles
3) Des cartes des différents aléas et risques
Mardi 04/10/16
2h - Cours
b) Les conséquences de l'établissement de ces liaisons : l'acquisition de la forme
de la protéine
4) Des liaisons entre plusieurs chaines peptidiques aboutissant parfois à un niveau
d'organisation supplémentaire : la structure quaternaire
B. Les protéines sont des structures dynamiques dont la fonction est permise par
une association spécifique et temporaire à d'autres molécules
1) Une conformation définissant le plus souvent un ou plusieurs sites de fixation
spécifiques d'autres molécules
2) Une structure tertiaire ou quaternaire pouvant être modifiée par la fixation d'un
ligand a) Une structure tertiaire dynamique
b) Une structure quaternaire permettant des interactions entre protomères
Un effet coopératif entre les protomères
Mardi 04/10/16
2h - TIPE
Groupe 1
3è séance : Représenter des données
Mercredi
05/10/16
3h - Cours
Une régulation possible de l'activité grâce à des protomères aux rôles
différents
C. Les protéines peuvent également être associées de manière durable à d'autres
groupements organiques
1) Des associations covalentes de groupements glucidiques
a) Certaines protéines sont glycosylées
Exercice : les antigènes responsables des groupes sanguins.
b) Mécanisme de la glycosylation
2) Des assemblages supramoléculaires par des liaisons faibles
III.LES ACIDES NUCLEIQUES, DES POLYMERES SEQUENCES DE NUCLEOTIDES A ROLE
INFORMATIF
A. Les acides nucléiques sont des polymères de nucléotides
1) Des macromolécules formées de nucléotides unis par une liaison
phosphodiester
a) La liaison entre les nucléotides
b) Les conséquences de cette liaison
2) Des macromolécules capables d'établir des interactions faibles avec d'autres
molécules
a) Des interactions ioniques dues à la charge négative du squelette pentose-
phosphate
b) Des liaisons hydrogène entre bases azotées
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