1 Exploitation et création de mutants

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QUELLE EST L’IMPORTANCE
DES BIOTECHNOLOGIES DANS
LE PROGRES GENETIQUE ?
Les sources classiques de la variation biologique
: la mutation et la recombinaison
MUTATION
Micropropagation
Haplodiploïdisation
Polyploïdisation
Mutagenèse
RECOMBINAISON
Marquage moléculaire
Transgénèse
Hybridation somatique
Hybridation interspécifique
Production d’hybrides F1
Hybridation puis
sélection généalogique
1ère stratégie: sélection des
variations, spontanées ou
provoquées, et les exploiter
autant que possible.
2ème stratégie: combiner des
caractères dans une perspective de
construction de génotype.
MUTATION : 1 Exploitation et création de
mutants
Exploitation des mutants naturels
Les mutations spontanées constituent la base de la variabilité génétique
exploitée par tous les sélectionneurs.
A quoi sont dues les mutations ?
• Présence d’agents mutagènes naturellement présents,
• Disfonctionnement des protéines impliquées dans la réparation et
réplication de l’ADN,
• Insertion de transposons et de rétrotransposons.
Quelques exemples de mutations naturelles importantes
1865, mutation « pois ridé » (Mendel). Voir TD TD 1
1872, première variété de haricot avec des grains restant verdâtres
(flageolet).
1930, mutation permettant d’ajouter l’orangé à la palette de couleur de la
rose.
1948, mutation monogerme chez la betterave.
1986, afila, mutation exploitée dans la variété de pois Solara.
MUTATION : 1 Exploitation et création de
mutants
(mutation monogerme – betterave)
Betterave multigerme (fleurs soudées)
Betterave monogerme
Savitsky, 1948
GROS PROBLEMES
Difficultés de semis (utilisation de semoirs
impossible)
Grosse quantité de semence
Nécessité de démariage – travail pénible –
très coûteux en mains d’oeuvre
Hilleshög créé la première
variété monogerme en 1966.
‘MonoHill’
Presque 100% du marché
Disparition de 90% des
entreprises semencières
MUTATION : 1 Exploitation et création de
mutants
(mutation afila – pois)
normal
af
af et st
Vrilles
Folioles
Bractée
Gros travail de
physiologie végétale pour
savoir quelle doit être la
morphologie de la plante
pour avoir un bon
rendement
Stipules
Rendement moyen
Rendement bon
Rendement mauvais
Foliole : - capacité photosynthétique très moyenne
– occulte la lumière pour les stipules
Stipule : - capacité photosynthétique excellente
– colonise le sol, lutte contre les mauvaises herbes
MUTATION : 1 Exploitation et création de
mutants
(Résistance au Phylloxera – Vigne)
Femelle
gallicole
1847 épidémie
d’oïdium – import de
vignes américaines
Femelle
radicole
Arrivé des EtatsUnis en 1861
1900 : vignoble
européen dévasté
Catastrophe
économique
Forme sexué
Femelle ailée sexupare
Espèce américaine
Vin piètre qualité
Greffage sur espèce
américaine
1973, Fercal
Problèmes de
chloroses
Croisement
interspécifiques
MUTATION : 1 Exploitation et création de
mutants
(Autres)
Autres mutants importants
Ne pas oublier
• le nanisme (blé), (Voir TD révolution verte)
• le caractère 00 (colza), (voir cours colza)
• la résistance au curly-top et rhizomanie ( betterave),
• etc…
Les mutations causent une diversité génétique qui est à la base du
travail du sélectionneur mais,….
diversité quelquefois réduite,…
Cas des espèces créées par l’Homme récemment,…
Cas des espèces introduites,…
La variabilité intervariétale dans un pays est réduite (maïs, betterave, blé, …)
Nécessité de faire des prospections
Disparition d’écosystèmes, instabilité politique, conférences de Rio
Création
de
nouveaux
mutants
MUTATION : 1 Exploitation et création de
mutants
(pré-requis pour la mutagenèse artificielle)
Mutagenèse artificielle
- Découverte des radiations ionisantes au début du 20ème siècle.
- 1927: Les altérations (mutations) provoquées par les radiations sont héritables.
- Diversification des agents mutagènes
Physique: Rayons g, Rayons X, Ultraviolets,…
Chimique: EMS,...
Variation somaclonale et sélection in vitro.
MUTATION : 1 Exploitation et création de
mutants
(Comment créer des mutants 1/3)
• En fonction de se que l’on veut faire
• EMS : mutations ponctuelles G/C > A/T
• Fortes doses de radiations ionisantes :
délétion de gros fragments d’ADN.
• Effet aléatoire
• Amélioration crible cellulaire in vitro
(résistance aux herbicides).
Choix de l’agent
mutagène
Choix de l’explant
organe
Type d’agent mutagène utilisé en amélioration des plantes ?
Régénération
de plantes
Plus de 70% des variétés ont été
obtenues par radiations ionisantes
Obtention d’une
variété
MUTATION : 1 Exploitation et création de
mutants
(Comment créer des mutants 2/3 )
En général un tissu qui va donner un méristème
Choix de l’agent
mutagene
Choix de l’explant
organe
Régénération
de plantes
Récolter les graines
Multiplication végétative
PLANTES
CHIMERIQUES
Obtention d’une
variété
Amélioration : culture de tissu in vitro, culture de cellules embryogenèse somatique
MUTATION : 1 Exploitation et création de
mutants
(Comment créer des mutants 3/3)
Grand travail de tri des phénotypes favorables.
• Mutations silencieuses – mutations actives.
•Mutations défavorables >>>> mutations favorables
• Mortalité, stérilité, mort de cellules (phyllotaxie,
développement, bizarres.
• Grande majorité des plantes sans intérêts.
(nombre de plante + facilité de repèrage des
mutants d’intérêt = clefs de la réussite)
Cas d’une plante mutagenéïsée caractère intéressant
mais pas viable agronomiquement (accumulation de
mutations néfastes.
Solution : plan de rétrocroisement
Problème des plantes chimériques (ségrégation
anormales)
Choix de l’agent
mutagene
Choix de l’explant
organe
Régénération
de plantes
Obtention d’une
variété
MUTATION : 1 Exploitation et création de
mutants
(Impact de la mutagenèse sur l’amélioration des
plantes)
Quelques variétés issues de mutagenèse artificielle
Pamplemousse
Cerisier
Riz
Forsythia
Weigela
Couleur rouge de la pulpe
Aspermie
Autofertilité
Qualité du grain
Port compact
Feuillage panaché
1984,
1970,
1985,
1970,
1985,
1979,
Ruby Red
Star Ruby
Stella
Delta
« Courtalyn », Weekend
« Courtatom », couleur ...
Quelques mutations très répandues
- Denso, conférant un semi-nanisme, probablement présente dans plus de 150 variétés
d’orge à brasserie.
- Mutation riche en acide oléique chez le tournesol, obtenue en 1976 par Soldanov est
retrouvée dans toutes les variétés riches en acide oléique inscrites en France et aux USA.
- Œillet ‘William Sim’ créé en 1938 :qualité de fleur et productivité.
- Résistance aux Imidazolinones (céréales) et au chlorsulfuron (endive).
2252 variétés recensées par la FAO/IAEA en 2000.
Stratégie basique – facile à réaliser (donc essayée souvent) – énorme
travail de tri après (peu de réussite) – regain d’intérêt (TILLING)
MUTATION : 2 Polyploïdisation (Auto)
La polyploïdisation est un phénomène se caractérisant par une multiplication
du stock chromosomique qui peut se produire de manière naturelle du fait
de la rencontre de gamètes non réduits.
Plantes naturellement autopolyploïdes
Exemple de plantes autotétraploïdes:
dactyle,
luzerne,
poireau,
pomme de terre.
Un nombre sans doute important de plantes aujourd’hui considérées
comme diploïdes sont probablement d’anciens autotétraploïdes.
Proportion de plantes cultivées polyploides >>> Proportion de plantes sauvages polyploides
Augmentation de la vigueur
Augmentation de la taille des tissus végétatifs
Plus grande variété allélique
Divergence fonctionnelle des gènes dupliqués
Diminution de la fertilité
Sélection plus difficile
MUTATION : 2 Polyploïdisation (Auto)
La polyploïdisation induite
- 1937, Blakeslee découvre l’action de la colchicine : il devient possible d’induire
des polyploïdisations chez de nombreuses espèces.
- Découverte d’autres agents mitoclasiques (ether, NO2,…).
MUTATION : 2 Impact de la polyploïdisation
sur l’amélioration des plantes
Quelques variétés issues de polyploïdisation induite
1951,
1965,
1966,
1968,
1985,
Kihara réalise des pastèques triploïdes. Voir TD 3
Réveille 1ère variété de ray-grass anglais tétraploïde.
Tétri 1ère variété de trèfle violet tétraploïde.
Monohill, une des premières betteraves triploïdes.
Courtalor «Carnaval» variété de weigela triploïde.
Autre utilisation de la polyploïdisation
La polyploïdisation est une méthode nécessaire à la réussite de très nombreux croisements
interspécifiques.
1)
et
2)
3)
4)
La polyploïdisation a été utilisée principalement chez les plantes fourragères
ornementales.
La triploïdie est une stratégie de choix pour introduire une apyrénie.
La polyploidisation est utile pour les croisements interspécifiques.
2002 1ère autorisation de consommation d’huître triploïde.
MUTATION : 3 Haplodiploïdisation
Une plante haploïde est un individu possédant un nombre gamétique de chromosomes.
Haplodiploïdisation = Haploïdisation + doublement (spontanée ou induit)
Gynogenèse
Androgenèse
Culture
d’anthère
Culture de
microspore
isolée
Gynogenèse
in situ
Croisements
interspécifiques
Culture
d’Ovule
Pollinisation avec
du pollen irradié
MUTATION : 3 Haplodiploïdisation
Haploïdisation spontanée
- polyembryonie (ex: asperge), androgenèse in situ (ex: tabac) et gynogenèse in situ (ex: maïs).
Androgenèse
- Culture d’anthères (1964) : Datura, Tabac ...
- Culture de microspores isolées (1973) : Datura, Riz, Colza, Orge, Blé, Pomme de terre, Maïs,...
Gynogenèse
- Culture d’ovaires/ovules (1976) : Orge, Blé, Tabac, Riz, Gerbera, Maïs, Betterave, Tournesol,...
- Croisements interspécifiques (1964) : Pomme de terre, Orge, Melon, Blé, Luzerne, Allium, ...
- Utilisation de pollen irradié (1983) : Orge, Blé, Pétunia, Melon, Carotte, Concombre, Chou,...
De gros efforts de recherche ont été consentis
En 1980, des méthodes d’androgenèse avaient donné des résultats sur 153 espèces différentes !
MUTATION : 3 Impact de l’haplodiploïdisation
sur l’amélioration des plantes
Principale utilisation de l’haplodiploïdisation
Fixation du matériel génétique:
- PLUS RAPIDE
- PLUS COMPLETE
- PERMETTANT LE CONTOURNEMENT DES PROBLEMES DE CONSANGUINITE
Quelques exemples de variétés obtenues par haplodiploïdisation
Années 50, DEKALB 640, variété hybride double de maïs avec 3 parents haploïdes doublés.
Années 70, Maris Haplona, variété de colza.
1974, F211, variété japonaise de tabac.
1978, Lunghua 1, variété chinoise de riz.
1980, Mingo, variété canadienne d’orge.
1987, Florin, variété française de blé.
1989, Adria et Mégal, variétés d’aubergine.
1990, Andréas, variété d’asperge hybride F1 100% mâle.
1995, Osir, variété de piment.
L’haplodiploïdisation est utilisée en routine par certaines sociétés pour améliorer
les espèces citées ci-dessus notamment.
MUTATION : 4 Micropropagation
Micropropagation = Extension des techniques classiques de division de touffes, de
bouturage, de marcottage et de greffage
Micropropagation
ORGANOGENESE
NEOFORMATION DE BOURGEON (CAL)
DEVELOPPEMENT DE BOURGEON
EMBRYOGENESE SOMATIQUE
Bourgeon apicale
Bourgeon axillaire
Autres
Vers la mise au point de la multiplication végétative in vitro
1939,
1952,
1958,
1960,
Gautheret réalise une culture indéfinie de cambium.
Morel et Martin réalisent le premier assainissement par culture de méristème de dahlia.
Reinert et Stewart obtiennent les premiers embryons somatiques de carotte.
Morel réalise la première multiplication végétative in vitro de l’orchidée.
En 1988, plus de 450 espèces pouvaient être micropropagées
MUTATION : 4 Impact des méthodes de
micropropagation sur l’amélioration des plantes
Multiplication d’un génotype à l’identique
- Microbouturage : séquoia, divers pins, eucalyptus, peuplier, merisier, framboisier,
vigne, gerbera, chrysanthème, porte-greffes d’arbres fruitiers,…
- Embryogenèse somatique : caféier, pins, mélèzes, épicéas, douglas, palmier à huile,...
Malgré de nombreux efforts : pas de semences artificielles, pb des variants
somaclonaux
Sélection sanitaire
- Culture de méristèmes: pomme de terre, artichaut, dahlia, vigne, ail, fraisier,…
- Thermothérapie: pêcher, agrumes, Allium,...
- Microgreffage : agrumes,…
Sauvetage d’embryons
- Résolution des problèmes de dormance pour réaliser des générations accélérées
(tournesol),
- Réussite d’un certain nombre de croisements interspécifiques.
Amélioration des plantes
Variétés clonales, variétés hybride de clones, parents d’hybride F1
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