NEJM_Paper_22Apr14 v2

publicité
Emergence of Zaire Ebola Virus
Disease
in Guinea — Preliminary Report
Emergence de la maladie du
Zaïre Ebola virus en Guinée Rapport préliminaire
Content
• Describes the detection of the virus strain
causing the outbreak in the BSL4
laboratories in Lyon, France and Hamburg,
Germany
• Describes the timeline of the outbreak until
detection of the virus in the cases confirmed
in Lyon and Hamburg
• Does not describe samples tested in Guinea
Teneur
• Décrit la détection de la souche de virus à l'origine
de l'épidémie dans les laboratoires de BSL4 à
Lyon, en France et Hambourg, Allemagne
• Décrit la chronologie de l'épidémie jusqu'à la
détection du virus dans les cas confirmés à Lyon
et Hambourg
• Ne décrit pas les échantillons testés en Guinée
Activities described
• 14 March: Dr. Emmanuel Roland Malano, Dr.
Emmanuel Heleze, Dr. Mamadou Saliou Sow, Dr
Lamine Koivogui, and Dr. Bare Soropogui arrived
in Gueckedou.
• 18 March: Team of MSF arrived
• Both teams started epidemiological investigation,
collection of samples
• Samples taken by Team Lamine were given to
MSF.
• MSF sent 20 samples from both teams to Europe.
Les activités décrites
• 14 Mars: Dr Emmanuel Roland Malano, le Dr
Emmanuel Heleze, Dr Mamadou Saliou Sow, Dr
Lamine Koivogui, et le Dr Bare Soropogui sont
arrivés à Guéckédou.
• 18 Mars: L'équipe de MSF est arrivée
• Les deux équipes ont commencé une enquête
épidémiologique et la collecte d'échantillons
• Les échantillons prélevés par l'équipe du Dr
Lamine ont été donnés à MSF.
• MSF a envoyé 20 échantillons des deux équipes
en Europe.
Results of the Laboratories in
Europe
• 15 of 20 patients positive for Ebola virus
Zaire
• PCR positive
• Virus culture positive
• Electron microscopy positive
Les résultats des laboratoires en
Europe
• 15 des 20 patients positifs pour le virus Ebola
Zaïre
• PCR positives
• La culture du virus positive
• Microscopie électronique positive
Virus sequencing and phylogeny
done in Hamburg
• Virus from 3 patients was completely
sequenced
• Phylogeny analysis shows a separate the virus
is Ebola Zaire Virus
• The virus is a new strain of Zaire Ebola virus
• Confusion due to terminology: Now, Zaire
Ebola virus is called just Ebola virus
Séquençage du virus et
phylogénie fait à Hambourg
• Les virus de 3 patients ont été complètement
séquencés
• Analyse de phylogénie montre un virus unique
et proche d’Ebola Zaïre
• Le virus est une nouvelle souche du virus Ebola
Zaïre
• Confusion due à la terminologie: maintenant, le
virus Ebola Zaïre est appelé juste virus Ebola
Where does the outbreak comes
from?
• Looking back from the confirmed cases
• Transmission chains indicate a health care
worker from Gueckedou spread the disease
to Macenta
• First case may be a child in village
Meliandou who died in December 2013
• Outbreak was caused by a single source
D'où vient l'épidémie?
• Enquête rétrospective des cas confirmés
• Chaînes de transmission indiquent qu'un
travailleur de santé de Guéckédou a propagé la
maladie à Macenta
• Premier cas peut être un enfant dans le village
de Meliandou décedé en Décembre 2013
• Épidémie a été causée par une seule source
(un seule chaine)
Matching confirmed cases with transmission chains
Correspondant à des cas confirmés par des chaînes
de transmission
Conclusions
• Single source outbreak probably started in
December
• Caused by a new strain of Ebola virus Zaire
• Demonstrates rapid response of Guinea to
investigate the outbreak
• Great success of research collaboration
between Guinea and Europa
• Very positive response from the scientific
community around the world for getting these
results so early
Conclusions
• Épidémie de source unique a probablement
commencé en Décembre
• Causée par une nouvelle souche du virus Ebola
Zaïre
• Démontre une réponse rapide de la Guinée pour
enquêter sur l'épidémie
• Grand succès de la collaboration scientifique
entre la Guinée et l’Europe
• Réponse très positive de la communauté
scientifique dans le monde entier: obtention et
présentation rapide des résultats
Implications for the current outbreak
• Outbreak response: The outbreak is caused by Zaire Ebola
virus. Therefore, high case fatality rate is expected (up to
90%), but no consequence for outbreak response
• Diagnostics: Available assays have been checked with the
sequences and will work.
• Experimental therapeutics and vaccines: Experiments to test
efficacy of experimental therapeutics and vaccines will be
initiated in Biosafety level 4 Laboratories around the world
• Ecological studies: The virus most likely originates from
Guinea and may circulate here since some time. Studies are
warranted to identify the animal reservoir.
• Preparation for future public health: Raise in public
awareness to avoid contact with potential animal sources
(monkeys, bats)
Implications pour l’épidémie actuelle
• Réponse: L’épidemie est causée par le virus Ebola Zaire, d’où la
mortalité importante attendue (Peut atteindre 90%), mais aucun
changement dans la réponse, et la surveillance épidémiologique.
• Diagnostics: Les méthodes actuelles de détection moléculaire ont été
verifiées á partir de la séquence obtenue et sont valides.
• Traitement experimentaux et vaccins: Les experiences pour tester
l’efficacité des traitements et vaccins experimentaux seront initiées
dans les laboratoires de classe 4 dans le monde
• Etudes écologiques: Selon toutes vraisemblances, le virus existe en
Guinée et circule depuis quelques temps. Il serait nécessaire
d’identifier le réservoir animal.
• Préparation pour le futur: Attirer l’attention du public sur les contacts
dangereux avec les sources animales potentielles (singes, chauvesouris). Plans et préparation pour le futur.
Thanks to the authors for their great work - I was just the coordinator
Merci aux auteurs pour leur excellent travail - j'étais juste le coordinateur
1 National Reference Center for Viral Hemorrhagic Fevers, Lyon, France
2 Unité de Biologie des Infections Virales Emergentes, Institut Pasteur, Lyon, France
3 Centre International de Recherche en Infectiologie (CIRI), Université de Lyon, INSERM U1111, Ecole Normale
Supérieure de Lyon, Université Lyon 1, CNRS UMR5308, Lyon, France
4 Laboratoire P4 Inserm-Jean Mérieux, US003, Lyon, France
5 Bernhard-Nocht-Institute for Tropical Medicine, WHO Collaborating Centre for Arbovirus and Haemorrhagic Fever
Reference and Research, Hamburg, Germany
6 German Centre for Infection Research (DZIF), Partner Site Hamburg, Germany
7 Institut National de Santé Publique, Conakry, Guinea
8 Université Gamal Abdel Nasser de Conakry, Laboratoire des Fièvres Hémorragiques en Guinée, Conakry, Guinea
9 Hôpital National Donka, Service des Maladies Infectieuses et Tropicales, Conakry, Guinea
10 Ministry of Health Guinea, Prevention and Disease Control, Conakry, Guinea
11 Médecins Sans Frontières, Brussels, Belgium
12 Médecins Sans Frontières, Geneva, Switzerland
13 Epicentre, Paris, France
14 Section Prévention et Lutte contre la Maladie à la Direction Régionale de la Santé de Nzérékoré, Nzérékoré, Guinea
15 Section Prévention et Lutte contre la Maladie à la Direction Préfectorale de la Santé de Guéckédou, Guéckédou, Guinea
16 Hôpital Prefectoral de Guéckédou, Guéckédou, Guinea
17 World Health Organization, Conakry, Guinea
18 Pole de Génotypage des Pathogènes, Unité de Recherche et d’Expertise Environnement et Risques Infectieux, Institut
Pasteur, Paris, France
19 World Health Organization, African Regional Office, Brazzaville, Republic of Congo
20 World Health Organization, Geneva, Switzerland
Téléchargement