Changement de représentation et alignement de séquences.

Changement de représentation
et
alignement de séquences.
Hugues DELALIN
Encadrement: E. Mephu Nguifo

2
Plan
1. Présentation
2. Etude comparative des codages des
acides aminés
3. Alignement de séquences

3
Présentation
CRIL = Apprentissage symbolique
Bioinformatique:
E. MEPHU NGUIFO
H. FU
H. DELALIN
Projets: Génopole Lille

Etude comparative des codages
des acides aminés
Huaiguo FU
Encadrement: E. MEPHU NGUIFO

5
Codage des Acides Aminés
•Idée: Stocker des informations en plus du
caractère.
Ex: Alanine = A = 65 (ASCII)= 01000001
•But: Comparer 4 méthodes de
représentation binaire des acides aminés
afin de trouver la meilleure représentation
possible.
Huaiguo FU
[ Poster, ECCB’02 ]
Hyd Cha Pol Sma Ali Aro
Ala 1 0 0 1 0 0