Diarrhées infectieuses

- 1 -
FORMATION CONTINUE- TECHNICIEN(NE) DE LABORATOIRE
Mme le Docteur Rosine BAURIAUD
MCU-PH – Hôpital RANGUEIL - TOULOUSE

- 2 -
P L A N
Diarrhées infectieuses
1. Définitions – Généralités
2. Diagnostic différentiel
Pathologies responsables de diarrhée aiguë
Diarrhées : lésionnelles - malabsorption
motrices - sécrétoires
Infectieuses : parasitaires - fungiques - virales
3. Physiopathologie
4. Flore physiologique intestinale
La coproculture
Analyse bactériologique des selles
1. Circonstances cliniques
2. Prélèvements – transports
3. Examen direct
4. Ensemencement
- routine . adulte
. enfant
- notion de voyage
- malade sous traitement antibiotique
- TIAC
- recherche de portage
- coproculture quantitative (malade hémato-oncologique)
5.Milieux
6.Culture identification - Sensibilité aux antibiotiques – Traitement
Bactéries pathogènes :
Entérobactéries Salmonella Shigella
Yersinia enterocolitica E. Coli Vibrio cholerae
Aeromonas Campylobacter
modification de la flore :
Clostridium difficile Klebsiella oxytoca
Diarrhées infectieuses
Virales
Parasitaires

- 3 -
Diarrhées infectieuses
1. Définition
Une diarrhée est définie par des émissions quotidiennes trop fréquentes de
selles trop abondantes, liquides ou pâteuses (poids supérieur à 300 gr/j). En pratique,
on parle de diarrhée lorsqu’il y a plus de trois selles molles ou liquides par jour.
La diarrhée aiguë dure en général moins de 8 à 10 jours. Elle est précédée d’un
transit normal et ne récidive pas à court terme. La diarrhée chronique dure en
général des mois ou des années.
Un syndrome dysentérique est défini par des excrétions glaireuses et
sanglantes pouvant ne pas contenir de matières fécales. Il s’y associe habituellement
des épreintes et une sensation de ténesme.
Les symptômes d’une toxi-infection alimentaire sont une diarrhée liquidienne,
des douleurs abdominales, des vomissements, parfois de la fièvre. L’évolution est le
plus souvent bénigne et spontanément résolutive en quelques jours.
La diarrhée aiguë peut se définir comme une modification brutale de la
fréquence et/ou de la consistance des selles évoluant depuis moins de 3 semaines.
Généralités
Les infections du tractus digestif se manifestent par divers syndromes
regroupés sous le terme de diarrhées infectieuses aiguës. Ces infections
représentent l’une des plus grandes causes de morbidité et de mortalité dans le
monde (zone tropicale du tiers-monde).
La prévalence des diarrhées aiguës varie en fonction de la saison, de la
localisation géographique, du groupe d’âge et des conditions d’hygiène.
Dans le tiers-monde, les diarrhées aiguës sont responsables de 5 à 10 millions
de milliers de morts par an et représentent la première cause de mortalité infantile.
En milieu occidental ou industrialisé, leur incidence (un épisode par adulte et
par an en France) en fait toujours un problème majeur de santé publique. La mortalité
est très basse, limitée aux malades fragilisés par leur âge ou des co-morbidités).
L’origine est trouvée dans 50 % des cas. En effet, en pays développé et sur
terrain sain, ce sont des maladies courtes, bénignes, guérissant spontanément, sans
qu’un diagnostic étiologique ne soit utile. Par contre, il existe des formes sévères,
importantes à reconnaître pour proposer un traitement adapté.
Diarrhées infectieuses : un des motifs de consultations les plus fréquents en
médecine générale.
L’incidence connaît des fluctuations importantes selon les périodes de l’année.
Habituellement revêtent un caractère aigu (infection principale cause) mais
aussi chronique (chez immunodéprimé).
Interrogatoire minutieux : voyage, âge patient, terrain immunodéprimé, mode
de vie, existence de cas identiques, délai d’incubation, aspect de la diarrhée, les
signes associés, la prise de médicaments des 5 jours précédents.
Tous les épisodes diarrhéiques ne sont pas infectieux. Toutes les diarrhées
infectieuses ne sont pas bactériennes (virus, parasites). Toutes les diarrhées
bactériennes ne sont pas dues à une bactérie infectieuse spécifique. En effet dans
certains cas, c’est un dysmicrobisme (déséquilibre dans la flore normale) qui est à
l’origine de la diarrhée.

- 4 -
2. Diagnostic différentiel des diarrhées infectieuses
Diarrhée aiguë
- colites inflammatoires, maladie de Crohn
- rectocolite hémorragique
- colites ischémiques
- colites d’origine tumorale
- intoxications par les champignons, toxines végétales diverses (algues, moules)
Diarrhée chronique
Certaines pathologies responsables de diarrhée aiguë peuvent être à l’origine de
diarrhée chronique. Les principales causes sont :
- diarrhée lésionnelle
- cancers, lymphomes
- polypose diverticulite
- maladies inflammatoires du tube digestif
- lésions ischémiques
- diarrhée par malabsorption
- certaines causes citées ci-dessus
- maladie cœliaque
- résection intestinale
- maladie de Whipple (agent infectieux : Tropheryma whippelii )
- amylose
- insuffisance pancréatique
- insuffisance en sels biliaires
- gastrectomie et vagotomie
- ischémie intestinale chronique
- diarrhée motrices
- neuropathies
- hyperthyroïdie
- diarrhées sécrétoires
- tumeur endocrine
- prise de laxatifs irritants
- adénome villeux hyper sécrétant
3. Physiopathologie
Diarrhée bactérienne
1- Invasion muqueuse et/ou production d’une cytotoxine.
Dans ce cas, la diarrhée aiguë est liée à la pénétration des microorganismes
dans les cellules de l’épithélium intestinal et/ou à la production d’une cytotoxine.
L’atteinte siège principalement au niveau de l’iléon distal et du colon. Cette invasion
est souvent responsable d’un syndrome dysentérique et de lésions muqueuses
macroscopiques (iléite et/ou colite).
Les souches qui en sont responsables, après une étape de colonisation
(facultative) envahissent l’épithélium intestinal. Elles peuvent :
- soit se multiplier au sein de l’entérocyte et créer des ulcérations de la
muqueuse (colique) entraînant un syndrome dysentérique. Entrent dans ce cadre :
Shigella, E. coli entéro-invasifs (« Shigella like ») et probablement Yersinia et

- 5 -
Campylobacter . L’activité entéro-invasive est sous le contrôle d’un plasmide
codant la synthèse des substances responsables de la lyse tissulaire. L’élaboration
des toxines, inconstante, peut également intervenir ;
- soit simplement traverser des entérocytes et coloniser les ganglions ; c’est le
cas des Salmonella responsables des fièvres typho-paratyphoïdiques ; ou se
multiplier dans la sous-muqueuse ( Salmonella responsables des gastro-entérites).
Bactéries invasives
- Salmonella
. invasion
. traversée de la muqueuse
. pénétration dans la sous muqueuse
. multiplication, macrophages dans les formations lymphoïdes (plaques de
Peyer)
. inflammation et exsudation liquidienne
. dissémination possible et localisations secondaires
- Shigella, E. coli invasif
. plasmide de virulence
. pénétration
. multiplication
. mouvement, dissémination horizontale
. destruction de la muqueuse : sang, pus et mucus dans les selles
. pas de passage au-delà de lamina propia
. pas de dissémination ni de localisation extra intestinale.
2- Production d’une entérotoxine ou adhésion entérocytaire
Une diarrhée hydro électrolytique peut être liée à une entérotoxine qui
stimule l’adénylcyclase membranaire et provoque une sélection d’électrolytes et d’eau.
Il n’existe dans ce cas ni lésion muqueuse histologique, ni bactériémie.
Les souches bactériennes adhèrent à la muqueuse, se multiplient sans
pénétrer dans les cellules et élaborent des toxines qui provoquent sur les
entérocytes des altérations fonctionnelles réversibles et transitoires, sans
modifications morphologiques, et dont le résultat est la sortie d’eau et d’électrolytes
dans la lumière du tube digestif. C’est le syndrome cholérique, de localisation
essentiellement entérique, caractérisé par l’abondance et la fréquence des selles,
trop liquides, trop aqueuses. C’est le cas de Vibrio cholerae , des Escherichia coli
entérotoxinogènes (ECET).
Production d’entérotoxine :
Vibrio cholerae
E. coli
- propriété d’adhésion
- prolifération jejunum iléon
- production d’entérotoxine
. protéique
. de type A – B
. récepteurs cellulaires (gangliosides)
. activation de l’adénylate cyclase
. augmentation de l’AMPC intracellulaire
. perte eau et électrolytes
. émission selles abondantes, aqueuses, incolores eau de riz