Parcours 3 Cours 11
27/01/2016
Dr Jacinta Bustamante
jacinta.bustamante@inserm.fr
RT :
BERTHERAT Irene
BAUDELIN Camille
BEN MOUL BLED Ademe
BERD Ted
RL :
RAZAFINIMANANA Andry
LOUBEYRE Elise
Génétique des maladies infectieuses
Plan :
I. Généralités
a. Modèle proposé
b. Importance de lier les maladies infectieuses à des maladies
génétiques
c. Facteurs qui influencent l'expression clinique de la maladie
d. Modèle humain ou animal
e. Méthodes de recherche chez l'homme
II. Déficits immunitaires
a. Présentation des déficits immunitaires primaires typiques ou
classiques, conventionnels) et atypiques (non classiques, non
conventionnels)
b. Déficit immunitaire primaire
c. Classification des déficits immunitaires primaires
d. Branches du système immunitaire
e. 2 exemples de déficits immunitaires primaires et classiques
i. SCID
ii. CID
f. Méthode d'étude des déficits immunitaires non classiques
III. Exemple de 2 microbes non opportunistes
a. Streptococcus pneumoniae
b. Herpes virus
Introduction :
Nous allons nous intéresser aux infections, à la génétique, tout ceci étant lié à
éficits immunitaires 
généralement une infection.
La cause de ce type de déficit immunitaire est généralement génétique. On va donc
chercher la mutation causale, et pour pouvoir la classer en « mutation » et non plus
« variation 
La biologie cellulaire permet de caractériser les maladies en laboratoire de recherche ou
hospitalier.
I. Généralités
Les maladies infectieuses sont des modèles pour l'étude des maladies génétiques.
On relève 2 questions importantes concernant les maladies infectieuses :
Pourquoi certains enfants développent des infections (parfois très graves) alors
qu'ils reçoivent la même exposition que d'autres qui sont sains (parfois même dans une même
famille) ?
Quel est le rôle de chaque type cellulaire et molécules 
contrôler ces infections ?
Il y a 2 réponses importantes :
Pouvoir arr
patients et à sa famille)
A partir du microbe, identifier la voie de signalisation importante soit pour la
susceptibilité soit pour la résistance à cette infection.
Pouvoir trouver quelle est la maladie génétique et avoir un traitement.
Il existe des maladies où il y a des individus qui peuvent avoir la même mutation, au même stade
que le patient, et pourtant ils ne développent pas la maladie.
Le traitement peut être ciblé : même si le patient est susceptible de faire une infection, en dehors

on.
Certains patients ont une maladie génétique sévère entraînant une susceptibilité à plusieurs
infections, une greffe de moelle osseuse étant alors nécessaire. Une mutation peut agir de
plusieurs façons différentes, il faut donc la caractériser :
Certaines maladies sont causées par plusieurs mutations sur le même gène et selon le type de
mutation, on obtient des maladies complétement différentes.


a. Modèle proposé
Les maladies infectieuses chez les enfants ont, souvent, des traits de transmission dits
mendéliens. Ce sont des variations rares (mutations) dans le génome, qui sont responsables des
maladies génétiques.
on va vers l'âge adulte, ces maladies infectieuses peuvent être expliquées
 polymorphismes (moins rares) dans le génome, qui
sont en cause, et les infections ne sont pas aussi sévères.
Dans le cas d'une infection biliaire disséminée et sévère chez l'enfant, causée par un tuberculosis,
on recherche des mutations, qui sont des variations très rares dans le génome. Cette maladie
génétique passe en général par la voie d’interféron gamma.
Alors que pour une infection moins sévère chez l'adulte (tuberculose pulmonaire), on cherche de
variations plus fréquentes (polymorphisme) dans la population. On a alors une expression clinique
complétement différente : un seul organe est touché (le poumon, alors que l’infection biliaire chez
l’enfant est disséminée et plusieurs organes sont touchés).
b. Importance de lier les maladies infectieuses à des maladies génétiques
Les maladies infectieuses doivent être liées à des maladies génétiques, qui entraînent par la
suite un impact sur le système immunitaire. Cela est important pour 2 raisons :
Importance clinique
Cela permet le diagnostic de la maladie, qui lie la partie génétique aux différentes manifestations
cliniques.
Ex : Des pathologies cliniquement assez sévères comme la méningite, peuvent être en lien avec un
déficit de l'immunité innée, ou avec une asplénie (absence de rate), d'origine génétique.
On veut alors identifier le gène causal et son mode de transmission, notamment pour
réaliser un diagnostic génétique au sein de la famille (exemple : des frères et ).
 
et ainsi de déterminer le gène en cause dans la maladie.
Du point de vue du traitement, on sait selon le problème génétique de l'enfant à quels microbes
il peut être susceptible, et on peut raccourcir la période active de la maladie, avec la recherche
du microbe, un traitement ciblé à ces microbes (exemple : des antibiotiques, des antiviraux,et
parfois d'autres molécules, comme l'interféron gamma (exemple 
mycobactérie).

traitemagit directement sur la mutation.
NB : Certaines maladies infectieuses nécessitent parfois des traitements de fond, comme la greffe de
moelle, la thérapie génique…
Implications biologiques
Utiliser les propres cellules du patient pour pouvoir caractériser sa maladie (modèle humain).
c. Facteurs qui influencent l'expression de la maladie
On propose la « Théorie de la Maladie infectieuse » pour expliquer la survenue de ces maladies.
Plusieurs éléments (qui sont appelés « théories » dans le cours, mais qui sont en fait plus des
« facteurs ») concourent à donner le phénotype clinique final de la maladie infectieuse.

- Le milieu écologique à proprement parler
- La microbiologie be et sa virulence
 :
- Le terrain immunologique
- Le terrain génétique

phénotype.
Il existe des facteurs génétiques et des facteurs non génétiques. e
phénotype clinique, et  le phénotype biologique, parfois exprimé parce 
une protéine très réactive e
cytokines pro inflammatoires.
d. Modèle humain ou animal : avantages et inconvénients
 :
- Le modèle expérimental, qui peut être in vivo sur des animaux, ou même in vitro sur
une lignée de cellules. On peut étudier ici directement pourquoi une certaine voie de
signalisation est altérée dans une maladie particulière. Il est possible de moduler les

- Le modèle in natura 
 
puisque représentative des conditions naturelles, mais de faite elle est limitée et ne
des précises. 
Le modèle animal et le modèle humain présentent tous deux des avantages et des inconvénients.
Avec le modèle humain, on peut choisir de faire une analyse selon les individus ou selon
les populations (certaines étant plus sensibles que d'autres à certains microbes) dans
s appartiennent. On peut avoir une susceptibilité spécifique selon

Avec le modèle animal au contraire, les observations sont parfois tr
observe in natura.
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