HuBac - Ifremer

Méthodes de dépistage des sources de
pollution microbienne :
Les marqueurs bactériens :
Alain Rincé, Stéphanie La Carbona
Laboratoire de Microbiologie de l'Environnement
USC INRA 2017
Université de Caen
14032 CAEN Cedex, FRANCE
colloque qualité sanitaire des eaux de baignade et conchylicoles – Brest 29 octobre 2010

La qualité sanitaire
(microbiologique) des eaux
= enjeu important
Contaminations
fécales
assez
fréquemment
observées.
Discriminer les origines =
important pour limiter ces
contaminations.
Ces pollutions fécales peuvent
provenir d’une origine humaine
(stations de traitement des eaux usées,
fosses septiques)…
où de matières fécales d'animaux
(élevages, animaux sauvages ou
domestiques).

De nombreuses méthodes d’identification des sources de pollutions ont été
décrites.
Elles reposent sur :
- la détection de composés chimiques signant l’origine de la pollution
- la détection de virus ou bactériophages
- la détection de bactéries

Méthodes d’identification des sources de pollutions
basées sur des caractéristiques bactériennes.
Méthodes dépendantes
de banques de données Méthodes indépendantes de banques de données

Méthodes d’identification des sources de pollutions
basées sur des caractéristiques bactériennes.
Méthodes dépendantes
de banques de données
Font appel à une culture des
bactéries
Des bactéries sont isolées de
différentes sources fécales d’origines
connues (fèces, lisiers, eaux-usées) et
des échantillons à analyser (eaux,
sédiments, coquillages)
Les isolats sont individuellement
analysés par des approches
phénotypiques ou génotypiques
Les isolats des échantillons à
analyser sont comparés à ceux
provenant des sources fécales
d’origines connues (Banque de donnée)
Type bovinType humain Type ovin
Source(s) de pollution