lettre_intention-microbiote_10022016 - EVA

PROGRAMME TRANSVERSAL 2016
PROJETS DE RECHERCHE DANS LE DOMAINE DU
MICROBIOTE
Lettre d'intention
La lettre d'intention doit être déposée par le candidat sur le site internet EVA
(https://www.eva2.inserm.fr/EVA/jsp/) avant le 31 mars 2016 à 16h00.

AAP – Microbiote 2016 2/8
TABLE DES MATIERES
PARTIE I: ETAT CIVIL .................................................................................................................................. 3
1. CANDIDAT ......................................................................................................................................................3
2. EQUIPE(S) CANDIDATE(S) (SI APPLICABLE) ............................................................................................................3
PARTIE II: PARTIE SCIENTIFIQUE................................................................................................................. 4
1. CANDIDATURE .........................................................................................................................................4
2. RESUME DU PROJET ...............................................................................................................................6
PARTIE III: CV DE(S) EQUIPE(S) PARTICIPANTE(S) ........................................................................................ 7
PARTIE IV : EXPERTS RECUSES .................................................................................................................... 8

AAP – Microbiote 2016 3/8
Partie I: Etat civil
1. Candidat
Nom
Prénom
Laboratoire de rattachement
Directeur du laboratoire
Responsable d'équipe
Nom de l'équipe
Adresse du laboratoire
Ville
2. Equipe(s) candidate(s) (si applicable)
Nom du responsable d’équipe associée
Prénom du responsable d’équipe associée
Laboratoire de rattachement
Directeur du laboratoire
Responsable d'équipe
Nom de l’équipe
Adresse du laboratoire
Ville
Prévoir un tableau par équipe associée.

AAP – Microbiote 2016 4/8
Partie II: Partie scientifique
L'objectif du programme transversal est de financer le programme scientifique défini dans le
texte de l'appel à projets qui sera réalisé par un consortium d'équipes. Vous postulez pour
rejoindre le consortium.
Cette lettre d’intention doit être rédigée en anglais et doit comprendre les rubriques suivantes:
1. candidature
 Votre thème de recherche actuelle? (10 lignes)
 Le lien avec le programme transversal (10 lignes max)
 Votre motivation pour participer au programme transversal (10 lignes max)
 Outils et ressources humaines mobilisables dans votre équipe pour ce projet (une demi-page
page max)
 Une synergie des équipes mobilisées (si applicable) (une demi-page max)
Se reporter au texte de l'appel à projets pour connaitre les objectifs du programme et les différents
axes de travail.
Axe de Travail 1
Choix du verrou
☐
Réaliser, par OMICS de l’environnement intestinal et modélisation mathématique sans a priori,
l’analyse des signatures moléculaires homéostatiques entre microbiote et hôte à partir de
cohortes précisément établies pour définir le continuum de santé.
☐
Développer de nouvelles approches standardisées de préparation (purification, extraction,
enrichissement mécanique ou in silico de l’information) et d'analyse (assemblage, annotation,
modélisation...) des échantillons biologiques intégrant l'accès aux signatures d'éléments
endogènes pouvant corréler avec certains contextes physiopathologiques et aux organismes
viraux ou bactériens faiblement représentés.
☐
Etablir leur variation sous l’influence de l’environnement, notamment l’alimentation.
☐
Etablir les signatures moléculaires du microbiote extracellulaire (mucosal) et intracellulaires
(tissulaire, immunitaire, métabolique) dans ce cadre.
Choix des axes de travail
☐
Axe de travail 1
☐
Axe de travail 2
☐
Axe de travail 3
☐
Axe de travail 4

AAP – Microbiote 2016 5/8
☐
Identifier l’adaptation moléculaire du système immunitaire voire entero-endocrine et de
tissus/organes périphériques (foie, tissus adipeux) aux signatures en fonction du continuum
de santé.
☐
autre
Si autre, précisez
Axe de travail 2
Choix du verrou
☐
Etude et modélisation multiparamétrique des régulations et des équilibres écologiques.
☐
Transition du commensalisme vers la pathogénicité
☐
Développement de technologies dédiées, en particulier la culture de bactéries actuellement
non cultivables.
☐
autre
Si autre, précisez
Axe de travail 3
Choix du verrou
☐
Comment compartimentaliser, isoler l’effet de ces flores pour en étudier individuellement
l’impact, en éliminant en particulier la reconnaissance par l’hôte de signaux issus de la flore
intestinale et de manière conditionnelle les mécanismes par lesquels l’hôte adapte la
composition de chacun de ses microbiotes ?
☐
Quelle biologie systémique et quelle modélisation mathématique pourrait être appliquée à la
compréhension d’un hôte « mosaïque de microbiotes »
☐
autre
Si autre, précisez
Axe de travail 4
Choix du verrou
☐
dévoiler les causes de la variabilité inter-individuelle de ses propriétés vis-à-vis des
xénobiotiques, en vue de prédire et d'optimiser l'efficacité et la tolérance des médicaments.
☐
les mécanismes et marqueurs prédictifs du phénomène de résilience du microbiote intestinal
en réponse aux traitements immuno-régulateurs.
☐
compréhension des propriétés adjuvantes des commensales et des pro(pré)biotiques et
l'identification des marqueurs prédictifs de leur efficacité.
☐
autre
Si autre, précisez