Stage proposé par

Stage proposé par
Vincent Galy
Nom et adresse du Laboratoire ou de l’Unité :
UMR7622 - Laboratoire de Biologie du Développement, Institut de Biologie Paris Seine, UPMC, Paris
Téléphone : 0144273494
Mail : [email protected]
Site internet : http://dev-nematode.snv.jussieu.fr/Home.html
Directeur du Laboratoire ou de l’Unité : Sylvie Schneider-Maunoury
Equipe d’accueil : C. elegans Hérédité et Développement
Prénom et NOM du Responsable de l’équipe : Vincent Galy
Résumé du thème de recherche de l’équipe
La fécondation de l'ovocyte par un spermatozoïde est une étape clé de la reproduction sexuée qui
provoque des transformations radicales et rapides dans l'oeuf. La contribution génétique et
épigénétique n'est pas la même pour les deux gamètes puisque le génome des mitochondries n'est
transmis que par l'ovocyte. Cette transmission uniparentale maternelle est une caractéristique
conservée chez de nombreuses espèces expliquant la transmission par la mère de certaines maladies
mitochondriales chez l'Homme. Les mécanismes responsables de l'exclusion ou de la dégradation
dans l'oeuf des mitochondries paternelles et leurs génomes sont toujours mal compris. C'est en
utilisant le nématode C. elegans que nous sommes parvenus à identifier le mécanisme principal de
cette dégradation : l'autophagie. Notre objectif est maintenant de comprendre :
- Comment les composants paternels sont ciblés ?
- Quels sont les mécanismes embryonnaires garants de l’hérédité maternelle et de l’homoplasmie du
génome mitochondrial?
Titre du projet de stage : Etude de la transmission du génome mitochondrial
Prénom, NOM, téléphone et adresse e-mail du Responsable du stage:
Vincent Galy, 0144273494, [email protected]
Projet de stage :
Le stage proposé pour un Master 2 aura pour objectif d’analyser la distribution et la
transmission du génome mitochondrial entre les blastomères au cours des divisions cellulaires de
l’embryon précoce de C. elegans et de quantifier expérimentalement le nombre de molécules d’ADN
mitochondrial transmises à la descendance par l’intermédiaire des cellules germinales primordiales
(PGCs). En complément, vous tenterez d’identifier les mécanismes qui contrôlent cette quantité. Dans
ce but, vous testerez l’impact sur la quantité d’ADN mitochondrial dans les PGCs de la déplétion, par
RNAi, de protéines candidates connues comme agissant dans la dégradation des mitochondries. Avec
cette étude, réalisée dans un système biologique métazoaire au développement simple et stéréotypé,
nous devrions clarifier un des aspects responsable de la transmission uniparentale maternelle et
clonale du génome mitochondrial.
Approches et techniques mises en œuvre :
RNAi, DNA fish, imagerie du vivant, analyse quantitative d’images de microscopie, Q-PCR
Publications du Responsable de stage au cours des 5 dernières années :
• « Sperm-inherited organelle clearance in C. elegans relies on LC3-dependent autophagosome
targeting to the pericentrosomal area. » Djeddi A, Al Rawi S, Deuve JL, Perrois C, Liu Y-Y, Russeau M,
Sachse M, Galy V. Development 2015 ; 142, 1705-1716.
• « Modern Tools to Study Nuclear Pore Complexes and Nucleocytoplasmic Transport in
Caenorhabditis Elegans.» Askjaer P, Galy V, Meister P. Methods in Cell Biol 2014;122:277-310.
• « A generic classification-based method for segmentation of nuclei in 3D images of early embryos.»
Gul-Mohammed J, Arganda-Carreras I, Andrey P, Galy V, Boudier T. BMC Bioinformatics 2014 Jan
14;15(1)9.
• « Guidelines for the use and interpretation of assays for monitoring autophagy.» Klionsky DJ, Galy V
et al. Autophagy 2012 Apr;8(4):445-544. Review.
• « Allophagy: A macroautophagic process degrading spermatozoid-inherited organelles.» Al Rawi S,
Louvet-Vallée S, Djeddi A, Sachse M, Culetto E, Hajjar C, Boyd L, Legouis, Galy V. Autophagy 2012
Mar 1;8(3). Punctum.
• « A quantitative method for measuring photoxicity of a live cell imaging microscope.»
Tinevez JY, Dragavon J, Baba-Aissa L, Roux P, Perret P, Canivet A, Galy V and Shorte S. Methods
in enzymology. Methods Enzymol. 2012;506:291-309.
• « Postfertilization autophagy of sperm organelles prevents paternal mitochondrial DNA
transmission » Al Rawi S, Louvet-Vallée S, Djeddi A, Sachse M, Culetto E, Hajjar C, Boyd L, Legouis,
Galy V. Science. 2011 Oct 27.
• « CLLD8/KMT1F is a lysine methyltransferase that is important for chromosome segregation.»
Falandry C, Fourel G, Galy V, Ristriani T, Horard B, Bensimon E, Salles G, Gilson E, Magdinier F. J
Biol Chem. 2010 Jun 25;285(26):20234-41.
Autres informations:
Etudiants actuellement en thèse ou en M2 dans l’équipe d’accueil.
• Sara Al Rawi, Dir. V. Galy, 2012, CDV
Etudiants ayant préparé ou soutenu leur thèse ou leur M2 dans l’équipe d’accueil au cours des
six dernières années.
• Eve Corot-Morel, Resp V. Galy, thèse 2009-2013, CDV
• Laure Etourneau, Resp S. Louvet, M2, 2012, UPMC
Cette proposition de stage s’adresse-t-elle spécifiquement à un étudiant scientifique, médecin
ou vétérinaire ou bien est-il ouvert à tous les profils ?
Etudiant scientifique
Ce sujet peut-il donner lieu à une thèse ?
Oui