Microbiologie aquatique

Microbiologie aquatique
I) les virus
1) l’origine
virus : parasites obligatoire, ne peuvent se développer qu’en présence d’un hôte.
 présence virus => présence hôte
si un virus ne correspond pas à celui d’un habitant du milieu -> contamination
2) vie aquatique des virus
2 types de virus :
 dans l’eau de façon permanente : liés au organismes autochtones de l’eau, se renouvellent.
 tous les autres : temps de passage court, ils vont être soit détruits, soit désactivés (facteurs
de destruction : t°, pH, oxydant présent dans l’eau, lumière…)
ils vont avoir tendance à s’adsorber sur les boues, nombre de virus qui vont se lier avec les
argiles des boues. Virus vont être disponible, mais la moitié vie prolongée du fait de
l’adsorption.
rechercher virus dans l’eau n’est pas facile : pas de recherche exhaustive, pas possible de
rechercher tous les virus d’un seul coup.
II) les bactéries
1) flore banale
flore banale spécifique qui est généralement assez faible, cette flore est complète par une flore
terrestre. Elle dépend du temps, du pH et la nature et la quantité des sels minéraux et de la
matière organique.
Flore banale de l’eau (bactérie) : capable de consommer des substances nutritives très diluées.
Eau les plus pauvres : eaux souterraines et les eaux de sources qui en résultent.
Dans les eaux de sources : sources banales et composition salines, sources thermales
Eaux superficielles : composition de la flore très variable, dépend du taux d’oxygénation, de
la flore végétale et des quantités de matière organique dans l’eau.
Flore d’autant plus importante que l’eau sera calme. Dans les eaux à faible mouvement,
développement des végétaux plus important. En général, flore beaucoup plus riche dans eaux
souterraines, présence bactérie du sol……
2) flore et pollution
apport en matière organique trop importante pour pouvoir être éliminé par un auto-
élimination de l’eau.
problème liés à la consommation d’O2, si tout O2 dans l’eau est épuisé -> fermentation
bactérie anaérobie sulfito- réductrice va conduire à la disparition d’autre organisme vivant ->
début d’eutrophisation de l’eau.
III) les champignons
1) flore
très variable en fonction du type d’eau

 eaux souterraines : présence champignons très rare
 eaux potables : présence exceptionnelle de champignons
 eaux superficielles calmes : champignons présent
dépend de la quantité de matière organique présente dans l’eau, champignons parasites,
saprophytes.
Phénomène de pollution : modification de la flore fongique, certaines familles disparaîtront.
Milieu marins : champignons spécifique : halophiles : supportent quantité de sel importante.
2) vie aquatique
dans les stagnantes, prépondérance des champignons saprophytes qui vont se développer sur
les déchets.
Eaux riches en matière organique : pénicillium ainsi que champignons de la famille des
levures.
Parasites sur les poissons, branchies, champignons qui parasitent les œufs, présence liées à
des eaux surpeuplées, très riche en matière organique
IV) algues
rattachés au monde végétal du fait de leur capacité à faire la photosynthèse, quelque algues
produisent des spores -> multiplication
vie aquatique : algues sont susceptible d’être responsable du phénomène d’eutrophisation, en
présence d’eaux stagnantes.
Certaines algues fixent éléments radioactif ou dégradent substances toxique.
Algues fournissent sucre à certaines bactérie.
V) protozoaires
1) flore
2 groupes : - sacromastigophora / - ciliophona
- flagelle : organisme unicellulaire qui présente des ressemblances avec les cellules animale
- sacrodina : peuvent se déformer, ex amibe : provoque disfonctionnement au niveau
hépatique et intestinal. Se nourrissent par phagocytose.
- ciliés : au lieu des flagelles, cil vibratiles qui vont leur permettre de se déplacer. Vibrent à
la surface des boues de station d’épuration. les cils vont leur permettre de se déplacer et de
se nourrir
2) vie aquatique
dans les eaux pollués, vont se développer proportionnellement à la quantité de bactérie.
Multiplication bactérienne tendance à perturber l’eau.
type d’eau, quantité nutritive, selon type de pollution -> favorisation de protozoaire plutôt
saprophytes, plutôt prédateur.
Faune de protozoaire, la plus importante dans les eaux calmes.
Relation de coopération ou proie- prédateur.
VI) organismes planctoniques

2 types de plancton :
- copépodes micro crustacé
- cladocères
- rotifères -> micro vers
copépodes sont les seuls à avoir une reproduction sexuée, la reproduction des planctons se fait
par filtration d’eaux.
2 types de prédateurs :
 micro- prédateurs : organismes plus petit qu’eux
 macro- prédateurs : organismes plus grand
présence : dépend quantité d’eau, quantité matière organique
présence de gros micro- orga -> quantité nutritive dans l’eau importante