Microbiologie aquatique
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Microbiologie aquatique I) les virus 1) l’origine virus : parasites obligatoire, ne peuvent se développer qu’en présence d’un hôte. présence virus => présence hôte si un virus ne correspond pas à celui d’un habitant du milieu -> contamination 2) vie aquatique des virus 2 types de virus : dans l’eau de façon permanente : liés au organismes autochtones de l’eau, se renouvellent. tous les autres : temps de passage court, ils vont être soit détruits, soit désactivés (facteurs de destruction : t°, pH, oxydant présent dans l’eau, lumière…) ils vont avoir tendance à s’adsorber sur les boues, nombre de virus qui vont se lier avec les argiles des boues. Virus vont être disponible, mais la moitié vie prolongée du fait de l’adsorption. rechercher virus dans l’eau n’est pas facile : pas de recherche exhaustive, pas possible de rechercher tous les virus d’un seul coup. II) les bactéries 1) flore banale flore banale spécifique qui est généralement assez faible, cette flore est complète par une flore terrestre. Elle dépend du temps, du pH et la nature et la quantité des sels minéraux et de la matière organique. Flore banale de l’eau (bactérie) : capable de consommer des substances nutritives très diluées. Eau les plus pauvres : eaux souterraines et les eaux de sources qui en résultent. Dans les eaux de sources : sources banales et composition salines, sources thermales Eaux superficielles : composition de la flore très variable, dépend du taux d’oxygénation, de la flore végétale et des quantités de matière organique dans l’eau. Flore d’autant plus importante que l’eau sera calme. Dans les eaux à faible mouvement, développement des végétaux plus important. En général, flore beaucoup plus riche dans eaux souterraines, présence bactérie du sol…… 2) flore et pollution apport en matière organique trop importante pour pouvoir être éliminé par un autoélimination de l’eau. problème liés à la consommation d’O2, si tout O2 dans l’eau est épuisé -> fermentation bactérie anaérobie sulfito- réductrice va conduire à la disparition d’autre organisme vivant -> début d’eutrophisation de l’eau. III) les champignons 1) flore très variable en fonction du type d’eau eaux souterraines : présence champignons très rare eaux potables : présence exceptionnelle de champignons eaux superficielles calmes : champignons présent dépend de la quantité de matière organique présente dans l’eau, champignons parasites, saprophytes. Phénomène de pollution : modification de la flore fongique, certaines familles disparaîtront. Milieu marins : champignons spécifique : halophiles : supportent quantité de sel importante. 2) vie aquatique dans les stagnantes, prépondérance des champignons saprophytes qui vont se développer sur les déchets. Eaux riches en matière organique : pénicillium ainsi que champignons de la famille des levures. Parasites sur les poissons, branchies, champignons qui parasitent les œufs, présence liées à des eaux surpeuplées, très riche en matière organique IV) algues rattachés au monde végétal du fait de leur capacité à faire la photosynthèse, quelque algues produisent des spores -> multiplication vie aquatique : algues sont susceptible d’être responsable du phénomène d’eutrophisation, en présence d’eaux stagnantes. Certaines algues fixent éléments radioactif ou dégradent substances toxique. Algues fournissent sucre à certaines bactérie. V) protozoaires 1) flore 2 groupes : - sacromastigophora / - ciliophona - flagelle : organisme unicellulaire qui présente des ressemblances avec les cellules animale sacrodina : peuvent se déformer, ex amibe : provoque disfonctionnement au niveau hépatique et intestinal. Se nourrissent par phagocytose. ciliés : au lieu des flagelles, cil vibratiles qui vont leur permettre de se déplacer. Vibrent à la surface des boues de station d’épuration. les cils vont leur permettre de se déplacer et de se nourrir 2) vie aquatique dans les eaux pollués, vont se développer proportionnellement à la quantité de bactérie. Multiplication bactérienne tendance à perturber l’eau. type d’eau, quantité nutritive, selon type de pollution -> favorisation de protozoaire plutôt saprophytes, plutôt prédateur. Faune de protozoaire, la plus importante dans les eaux calmes. Relation de coopération ou proie- prédateur. VI) organismes planctoniques 2 types de plancton : - copépodes micro crustacé - cladocères - rotifères -> micro vers copépodes sont les seuls à avoir une reproduction sexuée, la reproduction des planctons se fait par filtration d’eaux. 2 types de prédateurs : micro- prédateurs : organismes plus petit qu’eux macro- prédateurs : organismes plus grand présence : dépend quantité d’eau, quantité matière organique présence de gros micro- orga -> quantité nutritive dans l’eau importante
