Nouveau procédé d’identification d’utilisation d’un gène
de résistance au virus de la panachure jaune du riz
OFFRE
TECHNOLOGIQUE
Résumé
Cetteinventionconcernel’utilisation
desoutilsdelabiologiemoléculaire
pourl’identificationd’ungènemajeur
delarésistanceauvirusdelapanachure
jauneduriz(RYMV).
Ceprocédémisaupointparles
chercheursdel’IRD,enpartenariatavec
l’AssociationpourleDéveloppementde
laRizicultureenAfriquedel’Ouest
(ADRAO),permetd’identifierun
polymorphismeliéaulocusdugènede
résistancepourdéterminerles
phénotypesrésistantsauvirus.Cette
inventionouvredesperspectivespourle
clonagedecegèneetledéveloppement
devariétésrésistantesauvirus.
Description
Cetteinventionconsisteenl’identification
demarqueursmoléculairesdulocusd’un
gènemajeurintervenantpourla
résistanceauvirusdelapanachurejaune
duriz.CetterésistanceauRYMVestliéeà
ungènerécessifprésentdansles2
souchesOryzasativaetOryzaglaberrima.
Ceprocédépermetaussil’établissement
delacartographiephysiquedela
résistanceetleclonagedugène.
Samiseenœuvrenécessitel’amplification
sélectiveparPCRdefragmentsd’ADNde
rizd’individusrésistantsetsensibles.Ces
fragmentssontpréalablementsoumisà
uneétapededigestion,aveclesenzymes
derestrictionEcoRIetMesI,puisde
ligationpourfixerdesadaptateurs
complémentairesd’amorcesayant,àleur
extrémité,unouplusieursnucléotides
spécifiques.L’unedesamorcesducouple
estmarquéeauxfinsderévélation.La
séparationdesproduitsPCRsefaitpar
électrophorèsesurgeldansdes
conditionsdénaturantes.
L’étudecomparativedesprofilsobtenus
aveclesfragmentsprovenantdesvariétés
parentalesrévèlent2bandes
polymorphesspécifiquementprésentes
chezlesvariétéssensibles,le
polymorphismeétantgénétiquement
liéaulocusderésistance.Letauxde
recombinaisongénétiqueentrele
marqueuretlelocusderésistancepeut
êtrecalculépourvaliderlesrésultats.Ces
2bandespolymorphesde510et140pb
déterminent2segmentschromosomiques
inférieursà10cMflanquantlelocusde
résistance.
L’isolementetleclonagedecesfragments
permettentl’obtentiond’unADNc
capabledes’hybrideravecuncloneBAC
cribléàpartird’unebanquedisponible
auprèsdel’IRRI.Cettebanqueest
constituéedefragmentsd’ADNde100à
150kbd’unevariétéderiztellequeIR64.
L’ADNcpeuts’hybrideravecunclone
appartenantàuncontigrenfermantles
séquencesd’ADNdesmarqueurs
identifiésàpartirdessouchessensibles.
CetADNcpeutdoncêtreutiliséentant
quemarqueurdehautespécificitévis‐à‐
visdulocuspourprédireunphénotype
résistant.
Laboratoire
IRD–France
ADRAO–Bénin
Chercheur
M.C.BRUGIDOU
M.J‐P.BRIZARD
M.A.GHESQUIERE
Contact
IRD
Département
Expertise & Valorisation
Le Sextant
44, boulevard de Dunkerque
CS 90009
F-13572 Marseille cedex 02
France
Tél. [+33] (0)4 91 99 96 26
www.dev.ird.fr
Avantages
‐ Permetdedéterminersiuneplante
estsensibleourésistanteauvirus
RYMV.
‐ Permetleclonagedelaséquence
comprenantlelocusdugène
‐ Obtentiondemarqueursdegrande
spécificitévis‐à‐visdulocusd’un
gènemajeurderésistanceauRYMV
Type de transfert
• Brevet prioritaire français
FR99/07831 déposé le 21
Juin 1999 – Extension PCT
n° PCT / FR2000 / 01723
déposée le 21 Juin 2000
• Disponible pour licence de
brevet et de savoir-faire
Ref.dev/OT34
Partenariat
Applications industrielles
Prédictiondephénotyperésistantau
virusRYMV.
Clonagedugènederésistanceet
développement devariétésrésistantes.
Technologie
‐Procédépermettantleclonagedugène
derésistanceauvirusRYMVpouvant
êtretransféréàdesvariétéssensibles
parvoieconventionnellepour
développerfacilementetrapidement
desvariétésrésistantes.
‐ Permetl’améliorationdesplantes
baséssurdesrésistancesnaturellesaux
pathogènesdesvégétaux.
Stadededéveloppement:Preuvede
conceptréalisée
www.ird.fr
L’IRD est un établissement public
français, à caractère scientifique et
technologique, placé sous la tutelle
conjointe des ministres chargés de
la Recherche et de la Coopération