Caractérisation des génotypes du virus de l`hépatite B

UNIVERSITE DE OUAGADOUGOU
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UNITE DE FORMATION ET DE RECHERCHE
SCIENCES DE LA VIE ET DE LA TERRE
(UFR/SVT)
LABORATOIRE DE BIOLOGIE MOLECULAIRE
ET DE GÉNÉTIQUE MOLÉCULAIRE
(LABIOGENE)
Mémoire Présenté
Par : DIARRA Birama
Pour l’obtention du Master II
de Biologie Moléculaire et de Génétique Moléculaire Appliquées
de l’Université de Ouagadougou
SUR LE THEME:
Caractérisation moléculaire des génotypes du virus de l’hépatite B
(VHB) chez les donneurs de sang du centre régional de
transfusion sanguine de Ouagadougou, Burkina Faso.
Soutenu le 12 Novembre 2013 devant le jury composé de :
Président : Alain BOUGOUMA, Professeur Titulaire, Université de Ouagadougou
Membres : Jacques SIMPORE, Professeur Titulaire, Université de Ouagadougou
Rokia SANOGO, Maitre de Conférences Agrégé, Université de Bamako
Virginio PIETRA, Chargé de Recherche, Université de Brescia, Italie
N° d’Ordre……………..BioGeMA

Master 2 BioGeMA 2011-2012 DIARRA Birama Page I
Préface du Coordonnateur du Master BIOGEMA
De nos jours, les connaissances avancées en génétique et biologie moléculaires sont
incontournables pour conduire des études de hautes valeurs ajoutées en sciences biologiques.
Les outils de la Biologie moléculaire ont permis d’accomplir de grands progrès dans le
domaine du diagnostic, de la pharmacie, de la thérapeutique, de l’agriculture et même dans
l’aide à la justice par l’identification humaine. Les Universités et les laboratoires de
recherche des Pays membres de l’UEMOA dans leur grande majorité, restent arrimés aux
pays et laboratoires de recherche du Nord pour leurs besoins en recherches et activités en
génétique et biologie moléculaires. Cet état de fait est lié au déficit en personnel qualifié et le
manque de ressources financières et matériel pour conduire les recherches en local in situ.
Cela a pour conséquence, une non maîtrise de la finalité ainsi que de l’utilisation des
résultats et produits des recherches que nous conduisons, une surenchère du coût des
examens et des études en biologie et génétique moléculaires. Un autre corollaire et non des
moindres de cet état de fait est la fuite de capitaux mais également la fuite des cerveaux car
les étudiants les plus compétents envoyés dans les pays du Nord ont tendance à y rester.
Le master en Biologie Moléculaire et en génétique moléculaires appliquées (BioGeMA) a
pour but de combler le vide constaté dans l’expertise en génétique et biologie moléculaires
par la mise à disposition des pays de l’espace UEMOA, de personnels qualifiés, de haut
niveau de compétences pour conduire des études et recherches en génétique et biologie
moléculaires.
Le master BioGeMA est :
 Un Master à dimension sous-régionale
 Géré par un réseau de chercheurs et praticiens en génétique et biologie
moléculaires
 Soutenu par une plateforme technologique sous-régionale à LABIOGENE
(Laboratoire de Biologie et de Génétique Moléculaires)
Ce Master a pour objectif de former des biologistes, des pharmaciens, des vétérinaires et des
médecins biologistes capables d’effectuer des diagnostics biomoléculaires dans des centres
hospitaliers et d’élaborer des études d’investigations dans des structures de recherches. En
outre, il ouvrira la porte d’études doctorales aux meilleurs étudiants pour permettre la
formation de chercheurs et d’enseignants-chercheurs afin d’assurer la relève du corps
enseignants, la constitution d’une masse critique d’experts africains et la mise en place d’un
véritable réseau africain de recherche dans le domaine ci-dessus cité.
Professeur Jacques SIMPORE
Professeur Titulaire de Biologie Moléculaire
et de Génétique Moléculaire
UFR/SVT - École Doctorale Sciences et
Technologies
Université de Ouagadougou – Burkina Faso

Master 2 BioGeMA 2011-2012 DIARRA Birama Page II
DEDICACES
A mon père Zan et à ma mère Sounkoura MALE qui ont donné tout ce qu’ils pouvaient
pour que je sois là aujourd’hui. Soyez honorés pour tous vos efforts.
A ma femme Kadidiatou SYLLA et ma fille Sounkoura dite Batoma, mes plus grandes
joies de vivre, pour ces temps passés loin de vous alors que vous avez si besoin de moi. Je
vous dédie ce mémoire.
Au Professeur Rokia SANOGO, ce travail est le fruit de votre générosité et engagement
dans la formation des étudiants. Soyez honoré pour les efforts consentis.
A Docteur Cheikna ZONGO et famille pour votre accueil chaleureux, et votre soutien moral
et matériel. Je vous dédie ce mémoire.
A mes Frères, Sœurs, Parents et Amis pour votre soutien moral et vos encouragements tout au
long de mes études.
A tous ceux, qui, d’une manière ou d’une autre, ont contribué à l’aboutissement de ce travail.

Master 2 BioGeMA 2011-2012 DIARRA Birama Page III
REMERCIEMENTS
Ce travail a été réalisé dans le laboratoire de biologie moléculaire du Centre de Recherche
Biomoléculaire Pietro Annigoni (CERBA/LABIOGENE). Nous exprimons notre profonde
gratitude :
Au Pr Jacques SIMPORE, Professeur titulaire, Coordonnateur du Master de Biologie et de
Génétique Moléculaires Appliquées (BioGeMA), Directeur du laboratoire du Centre Médical
Saint Camille (CMSC) à Ouagadougou, Directeur du Centre de Recherche Biomoléculaire
Pietro ANNIGONI /Laboratoire de Biologie Moléculaire et de Génétique
(CERBA/LABIOGENE), Recteur de l’Université Saint Thomas d’Aquin , pour avoir accepté
la direction de ce Master, pour le choix pertinent de ce thème, pour le support économique de
cette étude et pour son encadrement exceptionnel.
Aux honorables membres du jury pour avoir accepté de faire partie du jury malgré vos
multiples occupations. Soyez-en remercié.
Au Dr Cyrille BISSEYE, Enseignant au Master II BioGeMA, pour son encadrement
technique au laboratoire et son expertise dans la rédaction de ce mémoire.
Aux Docteurs DJIGMA Wendkuuni Florencia, Djénéba OUERMI et SAGNA Tani, pour
leurs disponibilités et conseils dans l’amélioration de la qualité de ce travail.
A Mr TAO Issoufou, pour sa disponibilité lors de la collecte de nos échantillons.
A la Première promotion du Master II de BioGeMA, en souvenir de nos moments certes
difficiles mais prometteurs, ma reconnaissance pour ces bons moments de marche commune.
La volonté et le sens patriotique qui nous animent me laissent croire à un lendemain meilleur
de la Biologie et Génétique Moléculaires Appliquées dans nos pays respectifs. Aussi, j’espère
que la bonne ambiance qui a caractérisé nos relations durant ces moments nous permettra de
tisser des relations professionnelles saines et fécondes. Brillante carrière professionnelle et
scientifique à tous!!!
Au corps professoral de l’UFR/SVT en général et celui du Master II de BioGeMA en
particulier, Vous avez contribué à notre formation en nous dispensant des enseignements de
hauts niveaux. Nous vous en serons toujours reconnaissants et en ferons bon usage.
A l’Union Economique et Monétaire Ouest Africaine (UEMOA) pour le soutien financier
du master BioGeMa à travers le programme PACER2.

Master 2 BioGeMA 2011-2012 DIARRA Birama Page IV
RESUME
Introduction : L'infection persistante au virus de l’hépatite B (VHB) est un facteur de risque
au développement de la cirrhose et du carcinome hépatocellulaire (CHC). Les facteurs viraux,
tels que les génotypes et leur variant, se sont révélés être associés à la pathogenèse du
carcinome hépatocellulaire et à la réponse aux traitements. Peu d’études se sont intéressées
aux génotypes du VHB circulant au Burkina Faso. L’objectif de cette étude est la
caractérisation des génotypes du virus de l’hépatite B chez les donneurs de sang, positifs à
l’AgHBs par ELISA, du centre régional de transfusion sanguine de Ouagadougou, Burkina
Faso.
Méthodes : Cette étude menée au centre régional de transfusion sanguine de Ouagadougou
(CRTS) et au laboratoire du centre de recherche biomoléculaire Pietro Annigoni (CERBA) a
concerné 200 donneurs de sang de premier don positifs à l’antigène de surface du VHB
(AgHBs). La PCR multiplex a été utilisée pour caractériser les génotypes du VHB. Les
génotypes caractérisés ont été confirmés par une PCR de pré-séquençage.
Résultats : L'étude a confirmé par PCR la présence effective de l'ADN viral du VHB
chez 41sur les 200 donneurs de sang. Les génotypes A, B, D et F du VHB étaient absents
chez les donneurs de sang.
Les prévalences des génotypes E et C étaient respectivement de 26,8% et 9,8%. La majorité
(63,4%) des donneurs de sang était porteurs d’infections mixtes E/C.
Conclusion : Dans cette étude nous confirmons non seulement la prédominance du génotype
E mais mettons aussi en évidence pour la première fois à notre connaissance l’existence du
génotype C du VHB au Burkina Faso. Le nouveau recombinant E/C pourrait éventuellement
être le premier sous génotype du virus de l’hépatite B en Afrique de l’ouest nommé E1.
Mots clés : VHB, PCR multiplex, Génotypage, Donneurs de sang, Burkina Faso.