Thème Effets de la salinité sur l`activité des bactéries

UNIVERSITE KASDI MERBAH-OUARGLA
FACULTE DES SCIENCES DE LA NATURE ET DE LA VIE
DEPARTEMENT DES SCIENCES BIOLOGIQUES
Mémoire
MASTER ACADIMIQUE
Domaine:Sciences de la nature et de la vie
Filière : Biologie
Spécialité : Microbiologie appliquée
Présenté par:
Bireche yamina et Berregui fatiha
Thème
Effets de la salinité sur l’activité des bactéries
hydrocarbonoclastes
Soutenu publiquement
Le : 09/06/14
Devant le jury :
 - CHELOUFI. H (Professeur) Président UKM Ouargla
- OULD EL HADJ-KHELIL A. (Professeur) Encadreurs UKM Ouargla
 - BOUDERHEM .A (MAA) Co -Encadreur UKM Ouargla
 - HASSAINE .A (MAA) Examinatrice UKM Ouargla
- ANNOU. G (MAA) Examinatrice UKM Ouargla
Année universitaire: 2013/2014

Nous tenons tout d’abord à remercier ALLAH le tout puissant de nous avoir aidé à
réaliser ce modeste travail.
Nous remercions très chaleureusement notre encadreur Mme OULDELHADJ-KHELIL A.,
Professeur àl’Université Kasdi Merbah-Ouargla, qui n’aménagé aucun effort pour que ce
mémoire puisse voire le jour. Nous lui exprimons notre gratitude de nous avoir dirigé,
encouragé et sur tout aidé a fin de réaliser ce travail.
Nous a dressons nos remerciements à notre Co-encadreur Melle BOUDERHAM AMEL
Maitre assistant A à l’Université Kasdi Merbah-Ouargla pour notre avoir guidée et
soutenues.
Nous remercions les membres du jury, Monsieur CHELOUFI HAMID., Professeur
àl’Université Kasdi Merbah-Ouargla pour l’honneur qu’il nous fait en président ce jury.
Melle HESSAINE A ,Maitre assistant A à l’Université Kasdi Merbah-Ouargla et Madame
ANNOU G., Maitre assistant à l’Université Kasdi Merbah-Ouargla pour avoir accepté
l’évaluation de ce mémoire et d’en être les examinatrices.
Nous remercions tous les enseignants de notre cursus universitaire qui ont contribué à nous
formation.
Nous remercions tous les travailleurs de laboratoire pédagogique de la faculté des sciences
de la nature et de la vie et des sciences de la terre et de l’univers sans exception.
Merci à toutes les personnes qui ont contribué de près ou de loin a la réalisation de ce
travail.
Remerciement

J’ai l’honneur de dédier ce travail :
A ma chère mère, qui ne cesse de m’encourager, de me souteni
Pendant toute ma formation.
A mon cher père.
A mes sœurs :, Kaltoom, Hakima, Naaima, Saida et
Gamra, Wafa. Zahia,
A mes frères : Abd elfateh, Lahssen et Ali.
A toute la famille Bireche.
A mon binôme : Berregui fatiha et sa famille.
A mes amis : Hanona, Fadila, Nrimene ,Halima
Merry, Samra, Imaine, jiji ,Nedjma.
Qui ont supporté mes sauts d'humeur.
A tous les étudiants de la promotion 2014 de la
Microbiologie appliquée.
Dédicacé

TABLE DE MATIERE
INTRODUCTION .......................................................................................................................................... 01
PARTIE I : SYNTHESE BIBLIOGRAPHIQUE ............................................................................................
Chapitre I : Généralités sur hydrocarbures ..................................................................................................... 03
I.1. Définition des hydrocarbures ..................................................................................................................... 03
I.2. Origine des hydrocarbures ......................................................................................................................... 03
I.3. Classification .............................................................................................................................................. 04
I.3.1. Hydrocarbures saturés.............................................................................................................................. 04
a. Alcanes linéaires .............................................................................................. 04Erreur ! Signet non défini.
b. Alcanes ramifiés ............................................................................................... 04Erreur ! Signet non défini.
c.Cycloalcanes ................................................................................................................................................... 04
I.3.2. Hydrocarbures aromatiques...................................................................................................................... 05
I.3.3 .Composés polaires ................................................................................................................................... 05
I.3.4. Asphaltènes ............................................................................................................................................. 05
I.4. Devenir des hydrocarbures dans l'environnement ...................................................................................... 05
1.4.1. Evaporation…………………………………………………………………………………………………………………………06
I.4.2. Solubilisation ..............................................................................................Erreur ! Signet non défini.06
I.4.3. Emulsification ......................................................................................................................................... 06
I.4.4. Sédimentation ........................................................................................................................................... 06
I.4.5.Photo-oxydation ........................................................................................................................................ 07
I.4.6.Biodégradation .......................................................................................................................................... 07
Chapitre II: biodégradation des hydrocarbures .............................................................................................. 08
II 1.Définition………….. ................................................................................................................................. 09
II.2.Voies de dégradation……………………………………………………………………………….09
II.2.1.Aérobie…………………………………………………………………………………………….09
II.2.2. Anaérobie ..................................................................................................Erreur ! Signet non défini.10
II.3.Mécanisme de dégradation ........................................................................................................................ 12
II.4.Modes d’assimilation des hydrocarbures par la cellule bactérienne .............Erreur ! Signet non défini.12

II.4.1-Utilisation de la phase dissoute(le transfert par solubilisation dans la phase aqueuse ) 12
II.4.2-Transfert interfacial direct(TID) II.4.3-Transfert micellaire (pseudo solubilisation) 12
II.4.3Transfert micellaire (pseudo solubilisation) 12
II.5. Bactéries hydrocarbonoclastes 12
II.6.Facteurs physiques et chimiques affectant la biodégradation : .................................................................. 15
II.6.1. Compositions de polluant ; ....................................................................... 15Erreur ! Signet non défini.
II.6.2. Température ; ............................................................................................ 16Erreur ! Signet non défini.
II.6.3. Ressources en oxygène ; ........................................................................... 16Erreur ! Signet non défini.
II.6.4. Pression ; ................................................................................................................................................ 17
II.6.5. Nutriments ; ........................................................................................................................................... 17
II.6.6. Humidité ; .............................................................................................................................................. 17
II.6.7. Potentiel d’hydrogène (pH) ; ................................................................................................................. 17
II.6.8. Effet de la salinité. ................................................................................................................................. 17
Chapitre III : Effet de la salinité sur la biodégradation des hydrocarbures ......................................................
III. 1. Les microorganismes halophiles ............................................................................................................ 18
III. 1. 1. Non halophiles .................................................................................................................................... 18
III. 1. 2. Faiblement halophiles ......................................................................................................................... 18
III. 1. 3. Halophiles modérés ....................................................................................................................... 18
. III. 1.4Halotolérants ....................................................................................................................................... 18
III.2. Mécanismes d’adaptation à la vie en milieu hypersalin .......................................................................... 19
III.2.1. Adaptation à la salinité par production d’osmoprotecteurs .................................................................. 19
III.2.2. Adaptation à la salinité par accumulation de KCl ................................................................................ 19
III.2 .3. Adaptation des protéines à l’hypersalinité ......................................................................................... 19
III.3. la salinité et la biodégradation ................................................................................................................. 20
PARTIE II: MATERIEL ET METHODES .......................................................................................................
I.. Matériel Biologique ..................................................................................................................................... 22
I.1. Sol……………….. .................................................................................................................................... 22
I.2. Bactéries ...........................................................................................Erreur ! Signet non défini.
I.3. Solution à déférent concentration de Na Cl .....................................................Erreur ! Signet non défini.