idr-14-2883 merged fr

Infection et résistance aux médicaments Dovepress
le libre accès à la recherche scientifique et médicale
Article en texte intégral en libre
accèsRECHERCHE
ORIGINALE
Infection urinaire associée aux cathéters :
Incidence, facteurs associés et profils de résistance
aux médicaments des isolats bactériens dans le
sud de l'Éthiopie
Yisiak Oumer1
Belayneh Regasa Dadi1
Mohamed Seid1
Gelila Biresaw2
Aseer Manilal1
1Département de microbiologie
médicale, Université d'Arba Minch,
Arba Minch, Éthiopie ;2 Département
d'hématologie et
d'immunohématologie, Université
d'Arba Minch, Arba Minch, Éthiopie
Correspondance : Belayneh Regasa Dadi Courriel : [e-mail]
Abonnez-vous à DeepL Pro pour traduire des fichiers plus volumineux.
Visitez www.DeepL.com/pro pour en savoir plus.

Introduction : Les infections
urinaires liées aux cathéters
(CAUTI) sont l'infection
nosocomiale la plus courante et
l'une des principales causes de
morbidité. L'objectif de cette étude
était de déterminer la prévalence, les
facteurs associés et l'antibiogramme
des isolats bactériens chez les patients
atteints d'infections urinaires liées à
un cathéter. Méthodes : Une
étude transversale basée sur
l'établissement a été menée de
mars à décembre 2019 à l'hôpital
général d'Arba Minch, dans le sud
de l'Éthiopie. Les données
cliniques et socio-démographiques
ont été obtenues à l'aide d'un
questionnaire. Des échantillons
d'urine de milieu de captage propre
ont été collectés et inoculés sur
gélose au sang, gélose MacConkey
et gélose déficiente en cystéine-
lactose-électrolyte (CLED). Les
milieux de culture inoculés ont été
incubés dans une atmosphère
aérobie à 37°C pendant 24 heures.
Après une nuit d'incubation, la
croissance bactérienne sur les
milieux respectifs a été inspectée
visuellement et classée pour la
présence d'une bactériurie
significative. Une bactériurie significative était considérée si la culture pure présentait une
concentration ≥105 unités formatrices de colonies (UFC)/mL. Tous les isolats ont été
identifiés à l'aide de la morphologie des colonies et de tests biochimiques. La sensibilité aux
antimicrobiens a été déterminée par la méthode modifiée de diffusion du disque de Kirby-
Bauer. Les données ont été analysées à l'aide de SPSS version 25. La valeur P inférieure à
0,05 a été considérée comme statistiquement significative.
Résultats : L'incidence globale des CAUTI symptomatiques était de 39/231 (16,8 %).
Indépendants
Les facteurs prédictifs de CAUTI étaient un cathétérisme prolongé (≥7 jours) (AOR = 3,6,
95% CI = 1,0- 12,2), le diabète sucré (AOR = 5,3, 95% CI = 1,4-19,6) et l'insertion d'un
cathéter dans un service de chirurgie (AOR = 3,6, 95% CI = 1,08-12,28). Les isolats bactériens
les plus courants étaient E. coli 17/42 (40,5 %), Klebsiella species 9/42 (21,4 %) et
Enterococcus species 5/42 (11,9 %). Une résistance élevée (>80%) a été observée contre le
cotrimoxazole, la céfoxitine et la tétracycline. La ciprofloxacine et la nitrofurantoïne étaient
les médicaments les plus actifs. La prévalence globale de la multirésistance parmi les isolats
était de 37/42 (88,1 %). La plupart des isolats bactériens (30/42, soit 71,4 %) étaient des
producteurs de biofilms.
Conclusion : Des niveaux élevés de résistance aux médicaments ont été observés pour les
antibiotiques couramment utilisés. Dans notre étude, les isolats bactériens produisant des
biofilms étaient la cause prédominante des infections nosocomiales. Par conséquent, une
surveillance continue des schémas de résistance aux antimicrobiens est nécessaire pour aider
les médecins dans le traitement et la gestion des infections nosocomiales.
Mots clés : infections urinaires liées aux cathéters, uropathogènes, sensibilité aux
antimicrobiens, facteurs de risque
Introduction
Les infections urinaires liées aux cathéters (CAUTI) continuent de figurer parmi les
infections associées aux soins de santé les plus courantes dans le monde : Elles
représentent 40 % de toutes les infections nosocomiales et 80 % de toutes les
infections urinaires nosocomiales.1 Si elles ne sont pas traitées correctement, les
infections urinaires à germes multiples peuvent évoluer vers des complications
Reçue : 15 mars 2021
Accepté : 16 juillet 2021
Publié : 24 juillet 2021
Infection et résistance aux médicaments 2021:14 2883-2894
2883
© 2021 Oumer et al. Ce travail est publié et autorisé par Dove Medical Press Limited. Les termes complets de cette licence sont disponibles à l'adresse
https://www.dovepress.com/terms. php et intègrent la licence Creative Commons Attribution - Non Commercial (unported, v3.0) (http://creativecommons.org/licenses/by-
nc/3.0/). En accédant au site
vous acceptez par la présente les conditions. Les utilisations non commerciales de l'œuvre sont autorisées sans autre permission de Dove Medical Press Limited, à condition que l'œuvre soit correctement
attribuée. Pour obtenir l'autorisation d'utiliser cette œuvre à des fins commerciales, veuillez consulter les paragraphes 4.2 et 5 de nos conditions (https://www.dovepress.com/terms.php).

Dovepress
Oumer et al
comme la cystite, la pyélonéphrite, la bactériémie à Gram
négatif, l'endocardite ( ), l'ostéomyélite vertébrale,
l'arthrite septique et la méningite chez tous les patients.2 et
qui entraînent un inconfort pour le patient, avec un taux de
surmortalité de 23 décès pour 1000 patients hospitalisés et
des surcoûts de 1000 $/cas, c'est-à-dire des coûts
supplémentaires par infection acquise à l'hôpital.3
On estime que 10 à 12 % des patients hospitalisés et 4
% des patients dans la communauté ont des sondes
urinaires en place à un moment donné.4 Le sexe féminin,
l'âge avancé, la durée du séjour à l'hôpital, l'immunité
affaiblie, l'ouverture d'un système fermé, la comorbidité de
la maladie et les mesures (c'est-à-dire le diabète sucré, la
maladie rénale et l'utilisation d'antibiotiques systémiques)
et les techniques aseptiques subop- timales sont des
facteurs de risque de CAUTI.5,6
Les bactéries peuvent pénétrer dans la vessie lors de
l'insertion du cathéter, par la lumière du cathéter ou par
l'extérieur du cathéter. Les organismes infectieux les plus
courants sont Escherichia coli, les espèces de Klebsiella,
les espèces de Proteus, les espèces d'Enterococcus, les
espèces de Pseudomonas, les espèces d'Enterobacter et les
espèces de Serratia.7 La résistance aux antimicrobiens
parmi les pathogènes urinaires a été un problème croissant
au cours des dernières décennies ; il y a eu des
changements significatifs dans l'antibiogramme des isolats
bactériens CAUTI de et des rapports sur la propagation de
la résistance parmi eux.8 La combinaison des bactéries
multirésistantes (MDR) émergentes et de la défense offerte
par la formation de biofilms devrait rendre le traitement
avec des antibiotiques systémiques de plus en plus difficile
à réaliser.9,10 Les CAUTI sont un problème de santé
majeur ; il est très important de comprendre les facteurs de
risque, l'incidence des isolats bactériens, la formation de
biofilms et les profils de sensibilité aux antimicrobiens
chez les patients porteurs de cathéters pour traiter et gérer
correctement les CAUTI, car ces données font défaut dans
la région étudiée.
Méthodes
Conception de l'étude, cadre et population
Une étude transversale en établissement a été menée de
mars à décembre 2019 à l'hôpital général d'Arba Minch
(AMGH), dans le sud de l'Éthiopie. La population étudiée
était les patients cathétérisés qui sont restés sur un cathéter
pendant plus de 48 h et qui présentaient des signes et des
symptômes d'infections urinaires à l'AMGH au cours de la
période d'étude. Les critères d'inclusion sont les patients
ayant reçu un cathéter pendant plus de 48 heures et
présentant au moins deux des signes et symptômes
suivants d'infections urinaires : fièvre, sensibilité sus-
pubienne, douleur ou sensibilité de l'angle costo-vertébral ,
urgence urinaire, fréquence urinaire et dysurie.11 Selon les
Centers for Disease Control and

Oumer et al
Dovepress
Selon les critères des CDC, les patients sont
considérés comme souffrant d'une infection urinaire
aiguë symptomatique s'ils présentent une bactériurie
significative (≥105 cfu/ mL) accompagnée d'au moins
deux signes et/ou symptômes d'infection urinaire
aiguë (parmi les suivants : fièvre, sensibilité sus-
pubienne, douleur ou sensibilité de l'angle costo-
vertébral, urgence urinaire, pollakiurie et dysurie) et
d'une sonde urétrale à demeure en place depuis plus
de deux jours. Les patients étaient exclus s'ils (a)
avaient des antécédents récents d'infection urinaire
(dans les 6 mois), (b) étaient sous traitement
antimicrobien pour une infection urinaire ou sous
médicaments immunosuppresseurs (dans les 2
semaines),
(c) avoir une culture d'urine positive avec une
numération bactérienne significative le jour de la
pose de la sonde urinaire, (d) ceux qui ont été sondés
en dehors de l'hôpital, (e) ceux qui étaient
inconscients ou souffraient de troubles cognitifs, (f)
ceux qui ont été sondés avec une sonde autre que la
sonde de Foley (g) isola- tion d'une croissance
polymicrobienne dans les cultures, (h) ont refusé de
participer ou ont été renvoyés ou transférés dans
d'autres hôpitaux avec une sonde maintenue.
Collecte de données et
investigations en
laboratoire
Les données sociodémographiques ont été recueillies à
l'aide d'un questionnaire pré-testé et bien conçu dans le
cadre d'un entretien en face à face. Les données médicales
des patients, telles que les comorbidités, les raisons de
l'admission, le service d'admission, la durée de
l'hospitalisation, la durée du cathétérisme, la raison du
cathétérisme et le lieu d'insertion du cathéter, ont été tirées
des dossiers médicaux des patients (complétés par des
entretiens avec les patients). Un examen clinique a été
effectué sur chaque participant en mettant l'accent sur les
signes et symptômes compatibles avec une infection
urinaire (qui comprennent au moins deux des signes et/ou
symptômes suivants : fièvre, douleur ou sensibilité sus-
pubienne, douleur ou sensibilité de l'angle costo-vertébral,
dysurie, mictions urgentes ou fréquentes et douleur ou
sensibilité sus-pubienne). Les patients sondés qui sont
restés plus de 48 heures avec au moins deux des signes
et/ou symptômes suivants d'infections urinaires : fièvre,
sensibilité sus-pubienne, douleur ou sensibilité de l'angle
costo-vertébral, urgence urinaire, fréquence urinaire et
dysurie ont été inclus dans cette étude.
Un échantillon d'urine propre (10-20 ml) a été recueilli
à l'aide d'un récipient stérile à large ouverture muni d'un
bouchon à vis avant l'insertion du cathéter. Chez les
patients ayant un cathéter de courte durée (<7 jours), les
échantillons d'urine ont été prélevés par l'orifice du
cathéter en utilisant une technique aseptique (désinfection
avec de l'alcool à 70 %) ou, en l'absence d'orifice, en
ponctionnant la tubulure du cathéter.
2884 https://doi.org/10.2147/IDR.S311229
DovePress
Infection et résistance aux médicaments
2021:14

Dovepress
Oumer et al
avec une aiguille et une seringue après le clampage (l'urine
du cathéter est prélevée dans ce cas car le risque de
contamination est faible). Chez les patients porteurs d'une
sonde à demeure de longue durée (> 7 jours), l'échantillon
d'urine a été prélevé après le remplacement de la sonde à
partir de la sonde fraîchement posée. Tous les
prélèvements ont été effectués immédiatement avant le
début de la thérapie antimicrobienne. Les échantillons
d'urine ont été immédiatement transportés au laboratoire
de microbiologie et de parasitologie de l'université d'Arba
Minch pour des analyses microbiologiques.
Les échantillons d'urine ont été inoculés simultanément sur
Les milieux de culture inoculés ont été incubés dans une
atmosphère aérobie à 37°C pendant 24 h. Après une nuit
d'incubation, la croissance bactérienne sur les milieux
respectifs a été inspectée visuellement et classée en fonction
de l'existence d'une croissance bactérienne sur les milieux
respectifs. Les milieux de culture inoculés ont été incubés en
atmosphère aérobie à 37°C pendant 24 heures. Après une
nuit d'incubation, la croissance bactérienne sur les milieux
respectifs a été inspectée visuellement et classée en fonction
de la présence d'une bactériurie significative. Cependant, si
aucune croissance n'était détectée, les plaques de culture
étaient réincubées pendant 24 heures supplémentaires avant
que la culture ne soit considérée comme négative.
Une bactériurie significative a été considérée si une culture
pure
à une concentration ≥105 unités formatrices de colonies
(UFC)/mL et, pour les cultures contenant deux
organismes, nous n'avons sous-cultivé que l'organisme
prédominant, car il est peu probable que l'organisme en
plus petit nombre soit à l'origine de la maladie. Si les deux
organismes étaient présents à plus de 10 000 UFC/mL,
nous avons sous-cultivé les deux organismes. La
persistance du même organisme sur des cultures d'urine
répétées a été considérée comme un agent pathogène
même si le nombre de colonies était faible (c'est-à-dire
<10 000 UFC/ mL). Tous les isolats ont été identifiés à
l'aide de la morphologie des colonies et de tests
biochimiques.12,13
Des tests de sensibilité aux antimicrobiens ont été
réalisés
sur la base de la méthode de diffusion du disque de Kirby
Bauer, conformément aux lignes directrices du Clinical
and Laboratory Standard Institute (CLSI).14 Une
suspension homogène équivalente à 0,5 norme
McFarland a été préparée à partir d'une culture pure d'une
nuit des isolats bactériens respectifs et inoculée sur des
plaques d'agar Mueller Hinton. Les plaques inoculées ont
été laissées à température ambiante pour sécher pendant 3
à 5 minutes et un ensemble de disques antibiotiques a été
placé sur les plaques. Les disques antibiotiques suivants
ont été utilisés avec leurs concentra- tions respectives :
pénicilline (10 μg), ampicilline (10 μg), gentamicine (10
μg), ciprofloxacine (5 μg), tétracycline (30 μg),
érythromycine (15 μg), vancomycine (30 μg), chloram-
phénicol (30 μg), norfloxacine (10 μg), nitrofurantoïne
(300 μg), céfoxitine (30 μg) et ceftriaxone (30 μg) pour
les bactéries Gram- positives et ampicilline (10 μg),
pipéracilline (100 μg) pour les bactéries Gram- positives.