Mémoire DU vPDF

UNIVERSITÉ DE PICARDIE JULES VERNE
POUR LE DIPLÔME D’UNIVERSITÉ EN «
Caractérisation
de la flore typique des vases et marais salés
de la réserve naturelle nationale d’Arès et de Lège Cap
- É
tude des difficultés liées à l’exercice de détermination
Tuteur : Jean-Marie Dupont
Jury : Guillaume Decocq,
Président, Anne
Jean-
Marie Dupont et Arnaud Mouly
UNIVERSITÉ DE PICARDIE JULES VERNE
–
UFR DE PHARMACIE
SOCIÉTÉ BOTANIQUE DE FRANCE
MÉMOIRE
POUR LE DIPLÔME D’UNIVERSITÉ EN «
BOTANIQUE DE TERRAIN
Soutenu le 26/09/2019
Par Pablo Massart
de la flore typique des vases et marais salés
de la réserve naturelle nationale d’Arès et de Lège Cap
tude des difficultés liées à l’exercice de détermination
Président, Anne
-Marie Mollet, Déborah Closset-
Klopp, Elisabeth Dodinet,
Marie Dupont et Arnaud Mouly
UFR DE PHARMACIE
BOTANIQUE DE TERRAIN
»
de la flore typique des vases et marais salés
de la réserve naturelle nationale d’Arès et de Lège Cap
-Ferret
tude des difficultés liées à l’exercice de détermination
floristique -
Klopp, Elisabeth Dodinet,

Crédit photographique : Pablo Massart (sauf mention contraire)
Photographie en page de garde : Végétation à Suaeda maritima. Réalisée fin septembre 2017 dans la
réserve naturelle nationale des prés salés d’Arès et de Lège Cap-Ferret.

SOMMAIRE
Introduction ...................................... 1
I. Contexte scientifique .......................................................................................................................... 1
II. Objectifs de l’étude ............................................................................................................................. 1
III. Aire et objet de l’étude ....................................................................................................................... 2
A. La réserve naturelle nationale des prés salés d’Arès et de Lège Cap-Ferret .................................. 2
B. La végétation des vases et marais salés .......................................................................................... 2
Matériel et méthodes ............................ 4
I. Travail de documentation ................................................................................................................... 4
II. Relevés et observations réalisés sur le terrain .................................................................................... 5
A. Protocole de relevé et dispositif RNN-BIOGECO pour le suivi temporel de la flore et des
végétations de la réserve ................................................................................................................ 5
B. Ressources utilisées pour les déterminations floristiques .............................................................. 6
III. Travail de synthèse .............................................................................................................................. 7
A. Présentation des grands ensembles de végétation ........................................................................ 7
B. Fiches descriptives des taxons sélectionnés ................................................................................... 8
C. Outils supplémentaires d’aide à la détermination floristique ........................................................ 9
Résultats ......................................... 10
I. Présentation des grands ensembles de végétation .......................................................................... 10
A. Végétations de la haute-slikke ...................................................................................................... 11
B. Végétations du bas-schorre ........................................................................................................... 13
C. Végétations du moyen-schorre ..................................................................................................... 15
D. Végétations du haut-schorre ......................................................................................................... 17
II. Fiches descriptives des taxons typiques des vases et marais salés de la réserve ............................. 20
III. Outils supplémentaires d’aide à la détermination floristique .......................................................... 32
Discussion ....................................... 36
I. Taxons et groupes de taxons particulièrement complexes .............................................................. 36
A. Le groupe Spergula L. .................................................................................................................... 36
B. Le genre Limonium Miller .............................................................................................................. 37
C. Le genre Salicornia L. ..................................................................................................................... 38
II. Autres remarques concernant certaines difficultés ou lacunes au niveau des déterminations
floristiques ......................................................................................................................................... 39
Conclusion ...................................... 41

1
INTRODUCTION
I. Contexte scientifique
Un dispositif de suivi temporel de la flore et des végétations des vases et marais salés de la
réserve naturelle nationale des prés salés d’Arès et de Lège Cap-Ferret a été mis en place en 2011
grâce à un partenariat entre la réserve et l’Unité Mixte de Recherche Biodiversité, Gène et
Communautés (Université de Bordeaux/INRA ; ci-après BIOGECO). En 2017, dans le cadre d’un
contrat avec ce laboratoire de recherche, j’ai participé à la seconde campagne de terrain visant à
compléter le travail d’acquisition de données floristiques. Suite à celle-ci, j’ai pu effectuer une
analyse partielle de ces données et apporter certains résultats qui ont permis la production d’une
cartographie précise des végétations de la réserve pour l’année 2017 (Beguet et al., 2018). Enfin, dans
le cadre d’un stage de 6 mois en 2018 – toujours à BIOGECO – j’ai pu rédiger une synthèse
approfondie sur ce suivi (Massart, 2019).
Les différents axes de l’étude étaient les suivants :
- Revoir la typologie des végétations élaborée en 2011 (nouvelles fiches descriptives des végétations
et correspondance aux typologies européennes et phytosociologiques) ;
- Apporter une réflexion sur la méthodologie scientifique adoptée dans le cadre de ce suivi ;
- Comparer, après homogénéisation des données, les résultats des campagnes 2011 et 2017 (par
traitements statistiques des données – automatiques et manuels – ainsi que par leurs
représentations spatiales) ;
- Comparer ces données récentes à des données plus anciennes (1985 pour les plus datées);
- Interpréter les résultats en fonction des paramètres suivants : biais observateurs et protocole,
histoire du site, gestion et usages au niveau du site, dynamiques naturelles des espèces et des
végétations (successions, invasions…) ;
- Proposer des perspectives et des améliorations méthodologiques pour le suivi.
II. Objectifs de l’étude
Dès le début de cette mission pour le laboratoire Biogeco, j’avais envisagé de consacrer mon
projet de DU à l’étude de la flore typique des vases et marais salés de cette réserve naturelle.
Entre 2017 et 2018, j’ai pu concilier les deux projets ayant sensiblement le même objet d’étude, tout
en affinant les objectifs de ce mémoire en fonction des résultats et nouvelles problématiques qui
émanaient peu à peu du premier travail.
Lors de cette première étude, l’expérience de terrain ainsi que les analyses statistiques des
données m’ont notamment permis de mettre en évidence diverses sources d’erreurs possibles quant
à la détermination de certains taxons contactés lors de ces campagnes. Outre les contraintes liées au
dispositif d’échantillonnage, les convergences morphologiques des nombreux taxons spécifiques à
ces milieux sous influence tidale expliquent en particulier les difficultés rencontrées au niveau des
déterminations floristiques ; j’ai choisi de consacrer mon mémoire à cette problématique.
Ce travail permet en premier lieu d’établir un bilan au niveau taxonomique pour ce site
d’étude, et pourra dans le même temps servir d’outil d’aide à la réalisation du suivi de la flore et des
végétations de la réserve naturelle.
Après avoir exposé les méthodes utilisées dans le cadre de cette étude, seront un à un
présentés les taxons typiques des vases et marais salés de la réserve. Ces derniers seront décrits sur
la base de caractères morphologiques généraux mais aussi en mettant l’accent sur les critères de
terrain permettant de les identifier facilement et de les distinguer de certains taxons pouvant
particulièrement prêter à confusion. Par ailleurs, la présentation de ces fiches descriptives sera
articulée selon des sous-ensembles de végétation, eux-mêmes brièvement décrits (haut-schorre,
moyen-schorre, bas-schorre, haute-slikke).

2
III. Aire et objet de l’étude
A. La réserve naturelle nationale des prés salés d’Arès et de Lège Cap-
Ferret
La réserve naturelle nationale des prés salés d’Arès et de Lège Cap-Ferret, établie depuis
1983, se situe sur le littoral atlantique dans le département de la Gironde (33), à hauteur de l’angle
nord du Bassin d’Arcachon (figure 1). Le site s’étend sur le Domaine Public Maritime (DPM) et les
communes d’Arès et de Lège Cap-Ferret, sur près de 400 ha.
La réserve présente d’une part des milieux naturels sous influence marine (vasières, marais
salés, prairies et pelouses salées) et d’autre part des habitats forestiers typiques du plateau landais
(dune boisée, fourrés, forêt de feuillus et de pins maritimes), ainsi que différents milieux en interface
(ourlets dunaires, fourrés de Baccharis halimifolia…). La réserve naturelle se situe en aval du canal
des Etangs dont les eaux se jettent dans le bassin d’Arcachon. Ces eaux du canal ainsi que les
résurgences d’eau douce issues de la présence des nappes phréatiques induisent l’existence de
milieux plus ou moins saumâtres au sein du site. Celui-ci arbore donc une grande diversité d’habitats
et d’espèces végétales et animales qui confère ainsi une valeur patrimoniale très importante. Les
neuf habitats naturels d’intérêt communautaires (voir Plan de gestion 2016-20201), la forte
biodiversité ainsi que les espèces animales et végétales ayant un statut de protection permettent à la
réserve d’être classée dans le réseau Natura 2000.
B. La végétation des vases et marais salés
Avec ses 200ha de vases et marais salés, cette réserve naturelle présente la plus vaste étendue
du littoral aquitain concernant ces types de milieux naturels.
Cet ensemble de végétations halophytiques, composé de plantes capables de tolérer la salinité
et l’asphyxie racinaire (plus sévère au niveau des substrats vaseux), est en premier lieu structurée
selon une zonation typique allant des milieux les plus bas, sous l’influence fréquente des marées
(slikke), vers les milieux plus élevés, où l’influence des marées y est moins importante (haut-schorre).
On rencontre ainsi, au sein de ces écosystèmes, des espèces végétales hautement spécialisées
(adaptées à ces contraintes), et distribuées géographiquement et topographiquement d’une manière
très particulière.
1 Pdg Tome I, Diagnostic environnemental, consultable sur le site du Conservatoire du Littoral.
Figure 1 : Position géographique de la réserve naturelle nationale des prés salés d’Arès et de Lège Cap-Ferret (notée
« RNN ») au sein du Bassin d’Arcachon et de la région Nouvelle-Aquitaine (sources : « www.geoportail.gouv.fr »)