97-2014

République Algérienne Démocratique et Populaire
Ministère de l'enseignement supérieur et de la recherche scientifique
Université Constantine 1
Faculté des Sciences de la Nature et de la Vie
Département de Microbiologie
Mémoire
En vue de l'obtention du diplôme de Master en Microbiologie Générale
Option : Microbiologie Générale et Biologie Moléculaire des Microorganismes
Étude sur les Bactériophages et leur
isolement à partir des eaux usées de la station
d’épuration de Chelghoum El-Aid
Présenté par:
Benbouaziz Asma et Satour Asma
Soutenu le 01 juillet 2014
Jury de soutenance:
Président : Sekhri-Arafat N. Maitre de Conférences Université de Constantine 1
Encadreur: Boubekri K. Maitre de Conférences Université de Constantine 1
Examinatrice: Bouzeraib L. Maitre Assistante Université de Constantine 1
Année Universitaire
2013-2014

i
Remerciements
En premier lieu, nous tenons à manifester notre louange à Dieu par
aisance et excellence de nous avoir donné la volonté et la santé pour
pouvoir achever ce travail, veuille-t-Il nous guider toujours dans le
droit chemin.
Nous tenons à remercier vivement Dr Boubekri Karima d'avoir dirigé
ce travail et surtout pour sa collaboration et ses conseils précieux.
Nous n'omettrons jamais d'exprimer toutes nos gratitudes à tout le
staff de la station d'épuration de Chelghoum EL aid de la wilaya de
Mila, qui n'ont épargné aucun effort pour que nos travaux se termine
dans les bonnes conditions.
Nos plus sincères remerciements
Aux enseignants de la filière du la microbiologie générale ainsi que
tout le
personnel du département et de la faculté des sciences et de la nature
de
l'université de Mentouri Constantine 1 et
A toute l'équipe du laboratoire de microbiologie et biologie
moléculaire en particulier Mme Nabila et Mme Samia
Nous terminons ces remerciements en saluant vivement les membres
du jury pour l'honneur qu'ils nous ont fait en acceptant de juger ce
travail. Que tous ceux qui nous ont aidés trouvent ici l'expression de
notre Gratitude

Avant tous
, je dédie ce travail à l'ame de ma tante Zakia Que
Dieu,
dans sa grande miséricorde
choix dans son royaume céleste
D'un cœur plein d'amour et de fierté, je dédie ce modeste travail à mes
deux bougies qui brulent pour
m'est la plus chère au monde : ma mère qui m’a élevé, éduqué et sacrifié
toutes les belles années de sa vie pour moi, et à mon père qui n'a jamais
cessé de combattre pour me voir réussir un jour, que dieu les protège
A mon cher
A mes sœurs : Oumaima, Zaineb, Anfel et Bouchra
A toute la famille BENBOUAZIZ & BENCHELLI
A mes tantes : Fahima et Sabrina
A mes amies : Anfel,
D
A
Toute ma promotion 2éme année master (2013/2014) et à tous mes
A
toutes les personnes qui m'ont aidé, soutenu et contribué de près ou
de loin à la réalisation de ce
, je dédie ce travail à l'ame de ma tante Zakia Que
dans sa grande miséricorde
la garde et lui alloue une place de
choix dans son royaume céleste
D'un cœur plein d'amour et de fierté, je dédie ce modeste travail à mes
deux bougies qui brulent pour
m'éclairer le chemin, à la personne qui
m'est la plus chère au monde : ma mère qui m’a élevé, éduqué et sacrifié
toutes les belles années de sa vie pour moi, et à mon père qui n'a jamais
cessé de combattre pour me voir réussir un jour, que dieu les protège
pour nous.
A mon cher
frère: Mohamed charaf eddine
A mes sœurs : Oumaima, Zaineb, Anfel et Bouchra
A toute la famille BENBOUAZIZ & BENCHELLI
A mes tantes : Fahima et Sabrina
A ma chère Asma
D
jihed,
Mouna et en particulier ma binôme Asm
Toute ma promotion 2éme année master (2013/2014) et à tous mes
enseignants.
toutes les personnes qui m'ont aidé, soutenu et contribué de près ou
de loin à la réalisation de ce
travail.
BENBOUAZIZ
ii
, je dédie ce travail à l'ame de ma tante Zakia Que
la garde et lui alloue une place de
D'un cœur plein d'amour et de fierté, je dédie ce modeste travail à mes
m'éclairer le chemin, à la personne qui
m'est la plus chère au monde : ma mère qui m’a élevé, éduqué et sacrifié
toutes les belles années de sa vie pour moi, et à mon père qui n'a jamais
cessé de combattre pour me voir réussir un jour, que dieu les protège
Mouna et en particulier ma binôme Asm
a
Toute ma promotion 2éme année master (2013/2014) et à tous mes
toutes les personnes qui m'ont aidé, soutenu et contribué de près ou
BENBOUAZIZ
ASMA

iii
DEDICACE
Avec un énorme plaisir, un cœur ouvert et une immense
Joie, que je dédie mon travail a mes très chers parents qui
m’ont soutenus et encouragés toute au long de ma vie.
À mes très chères sœurs Khadîdja, Manel
Et mes frères Oussama et Wassim.
A mes grands-parents et à toute
Ma Famille, chacun avec son nom.
À mes amis surtout mes très chèrs : Asma, Ghalia, Houssem.
Merci mes parents, je souhaite que vous soyez fiers de moi.
Satour Asma

iv
Table des matières
Introduction .............................................................................................1
Revue Bibliographique..............................................................................3
Description des bactériophages et de la phagothérapie...................................................3
1. Présentation...................................................................................................................3
2. Structure et classification .............................................................................................3
3. Plusieurs types d’invasion de la cellule bactérienne ....................................................3
3-1. Principe du cycle chronique (phages filamenteux)................................................5
3-2. Principe du cycle lysogénique (phages tempérés) .................................................5
3-3. Principe et étapes du cycle lytique (phages virulents)...........................................5
4. Les techniques de détection et de quantification des virus de procaryotes.................6
4-1. La technique des plages de lyse..............................................................................6
4-2. La microscopie électronique en transmission (MET) ...........................................6
4-3. La microscopie à épifluorescence (ME).................................................................8
4-4. La cytométrie en flux .............................................................................................9
4-5. Les techniques d’amplification de gène.................................................................9
5. La phagothérapie ........................................................................................................10
5-1. La thérapie phagique ...........................................................................................10
5-2. Protocoles de phagothérapie ................................................................................11
6. Les bactériophages pour une décontamination sélective...........................................11
7. Avantages ....................................................................................................................11
8. Limites.........................................................................................................................12
Matériels et méthodes ............................................................................14
1. Présentation de la Station d’épuration de Chelghoume El-Laid ...........................14
2. prélèvement des échantillons ......................................................................................14
3. La flore totale aérobie mésophile ...............................................................................15
4. La technique de plage de lyse .....................................................................................15
5. Identification phénotypique des isolats ......................................................................16
5-1. Examen microscopique : Il a été effectué sur un frottis bactérien, préparé à partir des
isolats en cultures pures, puis fixé et coloré par la méthode de Gram. ............................16
5-2. Test Biochimiques:.................................................................................................17
Résultats et discussion.............................................................................19
Conclusion et perspectives.......................................................................36