Lacaractérisationdeβ(τ)nécessitedoncl’estimationdetrois
paramètres:k,θetR0.
Troisduréesdelatenceontététestées:0,1et2jours.Après
l’exécutiondumodèle,uneanalysedesensibilitéaétéréalisée
afindedéterminerlaformedeβ(τ)s’ajustantlemieuxaux
donnéesdenombresd’infectionsobservéesdanschaque
groupecontact.Unseultypedefonctionsembleêtrecohérent
aveclesinfectionsobservéespendantlesdifférentscontacts:
lafonctiondetypelognormal(k=2,5;θ=0,34)avecunelatence
de1jour.Legraphiquedelafonctionreprésentantlepotentiel
infectieuxβ(τ)(formelognormal)estreprésentéàlafigure2,
superposéauxrésultatsbiologiques.Lemodedecette
fonctionestsituéà9JPI.β(τ)estinferieurà0,001au‐delàde
48JPI,laprobabilitédetransmissionduvirusestdonc
négligeableau‐delàdecettedate.Letauxdereproductionde
base,R0,pouruneinfectionparlevirusduSDRPaétéestimé
enintégrantβ(τ)surtoutelapériodeinfectieuse:
∞
2.6 1,8 3,3.
Letempsmoyendegénérationd’unnouvelindividuinfectieux
parunindividuinfectieuxpeutaussiêtrecalculé,
/
14.5 14,4 14,6.
Lescorrélationsentrel’évolutiondupotentielinfectieuxetles
paramètresvirologiquesetimmunologiquesontétécalculées
surtoutelapériodeinfectieuse,surlaphased’accroissement
uniquement(≤9jours)etsurlaphasedécroissante
uniquementdupotentielinfectieux(>9jours).
L’évolutiondel’infectiositéestprincipalementcorréléeàla
chargegénomiqueviraledanslesangetlaphasedécroissante
dupotentielinfectieuxestfortementcorréléeà
l’augmentationdelaquantitéd’anticorpstotaux.
3. DISCUSSION
3.1. Paramètresvirologiquesetsérologiquesdesporcs
inoculés
Lacinétiquedeschargesgénomiquesviralesdanslesangdes
porcsestcohérenteaveclesdescriptionsdisponiblesdansla
littérature(Molinaetal.,2008).Aprèsuneaugmentation
rapidedelachargegénomique,lepicestatteintdeux
semainesaprèsl’infectionpuisunediminutionprogressiveest
observéejusqu’à90JPIenviron.Lachargegénomiquevirale
excrétéedanslemucusnasalaugmentetrèsrapidement
conformémentauxprécédentesétudes(Ruizetal.,2009),elle
estmaximaleà2JPIpuisellediminueprogressivementjusqu’à
48JPIoùelleestnulle.
Laséroconversiondecertainsporcsaétéobservéedès7JPIet
unesemaineplustardtouslesanimauxontséroconverti,ce
quiestenaccordaveclesprécédentesrecherchesconduites
surcevirus(Yoonetal.,1995;Diazetal.,2005).Laquantité
d’anticorpsaugmenteensuitepuissestabiliseàpartirde56
JPI.Contrairement,àd’autresétudesoùlesanticorps
neutralisantsapparaissenttardivement(Yoonetal.,1995),ils
sontdétectésicidèsla2èmesemaineaprèsl’inoculationpour
certainsporcspuispourtous,à21JPIsaufunquin’enapas
présentéavant28JPI.Cetteapparitionplusprécocedes
anticorpsneutralisantsdansnotreétudepourraits’expliquer
parunedifférencedesensibilitédelaméthodededétection,
desdifférencesliéesàlasoucheduviruset/ouàlavoie
d’inoculationemployée,ainsiquelaraceetl’âgedesanimaux.
Letitreenanticorpsneutralisantsrestenéanmoins
relativementbas(maximumdutitreenlog10de1,8à77JPI)
conformémentàlalittérature(Darwichetal.,2010).
Aucunedifférencesignificativen’aétéobtenueentrele
groupeICetISCpourlesparamètresvirologiqueset
sérologiquesétudiésindiquantquelestressengendrépar
l’introductiondenouveauxanimauxn’apaseud’influencesur
lesparamètresétudiés.
3.2. Lepotentielinfectieuxestiméàpartirdesporcscontacts
Lenombred’animauxinfectésprimairesatoutd’abord
augmentéjusqu’àatteindre87,5%d’animauxsensibles
infectésà14JPIpuisildiminuerapidementetaucunanimal
n’aétéinfectélorsducontactà42JPI.Etantdonnéqu’une
seuleinfectionprimaireestrecenséeà28JPI,uncontactune
semaineplustardà35JPIauraitétéinformatif.Ilaurait
probablementpermisd’affinerladateoùlesporcsn’excrètent
plusdeparticulesinfectieusesenquantitésuffisantepour
infecterdesindividussensibles,d’autantplusqu’ilsexcrètent
dugénomeviralejusqu’à48JPI.Différentesdonnéesontété
analyséesafindedifférencierlesinfectionsprimairesdes
secondairesvoiretertiaires:lesrésultatsdesérologie,de
l’excrétionvirale,delachargegénomiqueviraledanslesang
etleslésionsmacroscopiquesobservéesenautopsies.
Cependant,lesrésultatslesplusinformatifsproviennentdes
écouvillonsnasauxprélevéstousles3joursetdonnantainsila
dateàpartirdelaquellelesporcscommencentàexcréterle
virus.Touslesanimauxinoculésontexcrétédugénomeviral
dès2JPIetletauxdecontactentrelesporcsinoculésetles
porcscontactspeutraisonnablementêtreconsidérécomme
uniforme.Iladoncétésupposéquelesanimauxinfectés
primairesétaientceuxquiexcrétaientdugénomeviraldès
3JPC.Chaqueanimaleriecontenaitdeuxparcsdequatreporcs
avecuneséparationdepolyéthylèneentreeux.Cependant,le
groupe28JPIn’afaitl’objetqued’uneseuleinfectionprimaire
(dansunseulparc)etlesporcsquin’étaientpassituésdansle
mêmeparconttoutdemêmefiniparêtreinfectés.Ceci
suggèreunecontaminationd’unparcàl’autreavecune
possibilitédetransportparvoieaériennesurunecourte
distancesansqu’ilsoitpossibledel’attester.
L’adaptationdel’algorithmeutiliséparAndraudetal.(2009)à
nosdonnéesdenombresd’infectionsprimairesdanschaque
groupecontactnousapermisd’estimerlepotentielinfectieux
d’animauxinfectésparlevirusduSDRPenfonctiondutemps
depuisinfection.Ladistributiondupotentielinfectieuxconduit
àuneduréemoyenned’infectiositéde14,8jours,unpic
d’infectiositéà9JPIetunarrêtau‐delàde48JPI.Cesrésultats
suggèrentuneduréemoyennedelapériodeinfectieuseplus
courtequelesrésultatsobtenuspard’autresauteursquiont
décrituneexcrétionviraleallantaumoinsjusqu’à56JPI
(Terpstraetal.,1992)voire156JPI(Willsetal.,1997).Les
différencesmajeuresparrapportauxétudescitées
précédemmentreposentsurunecaractérisationfinede
l’évolutiondecepotentielinfectieuxenfonctiondutemps,qui
nepeutrésolumentêtreconsidérécommeconstantetqui
n’estpasstrictementsuperposéàlavirémieetàl’excrétion
parvoienasale.Cesestimationsvalentpourlasoucheque
nousavonsutilisée(lignageEuropéen),desdifférences
importantespouvantêtreattenduesavecdessouchesde
lignageNord‐Américainparexemple.
L’augmentationrapidedupotentielinfectieuxde1à9JPIse
superposeavecl’accroissementdelachargegénomiquevirale
danslesang,dansunemoindremesureaveclachargevirale
excrétéedanslemucusnasalquidébuteplusprécocement.La
corrélationentrelepotentielinfectieuxetlacharge
génomiqueviraledanslesangestàcetitremeilleuresurtoute
2012. Journées Recherche Porcine, 44.