Sensibilité et résistance aux antibiotiques

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Dr J.P. Rasigade
Faculté de Médecine Lyon-Sud Charles Mérieux
Septembre 2016
Clinique et grands syndromes
Pathogènes et physiopathologie :
syndrome cholériforme
syndrome dysentérique
Principes de prise en charge
individuelle et collective
Clinique et grands syndromes
Pathogènes et physiopathologie :
syndrome cholériforme
syndrome dysentérique
Principes de prise en charge
individuelle et collective
ATTEINTE DIGESTIVE
Rotavirus
Norovirus
80%
20%
Vibrio cholerae
Shigella
Campylobacter
Yersinia
Salmonella
C. difficile
VIRUS
Hépatite A
BACTERIES
Listeria
S. Typhi
M. tuberculosis
Brucella
PARASITES
ATTEINTE EXTRA-DIGESTIVE

Volume excessif de selles liquides > 350 ml/24h
avec pertes hydro-électrolytiques

Piège
◦ selle liquide ≠ diarrhée
◦ signes digestifs d’accompagnement
 enfant +++ (atteinte ORL)
 sepsis: pneumopathie, pyélonéphrite, paludisme…

Dans le monde
◦ 4ème cause de mortalité / 2ème cause de morbidité
Mécanisme
toxinogène
Mécanisme
entéro-invasif
toxine préformée ou
produite in situ agit sur
les entérocytes
invasion / destruction de
l’épithélium
+ inflammation
Syndrome cholériforme
Syndrome dysentérique
selles aqueuses
pas / peu de fièvre
selles glairo-sanglantes
fièvre
Clinique et grands syndromes
Pathogènes et physiopathologie
syndrome cholériforme
syndrome dysentérique
Principes de prise en charge
individuelle et collective
TOXINE PRODUITE IN SITU
La bactérie adhère à l’épithélium et produit
localement la toxine
On peut rechercher la bactérie dans les selles
Escherichia coli entérotoxinogène (tourista)
Vibrio cholerae
Clostridium difficile
La toxine est présente dans l’aliment contaminé
On ne recherche pas la bactérie dans les selles
Staphylococcus aureus
Bacillus cereus
Clostridium perfringens
TOXINE PREFORMEE


Adhésion à l’épithélium digestif
Synthèse de toxine
◦ perturbe le métabolisme des entérocytes
◦ excès de sécrétion aqueuse

ENTEROTOXINE
E. coli ETEC
Vibrio cholerae
Thermostable
Thermolabile
Augmentation GMPc Augmentation AMPc

Incubation 1 à 5 jours
Pertes hydriques importantes, vomissements

Inde +++, Asie, Afrique, Amérique du Sud

Morphologie : bacille Gram négatif incurvé



Toxine synthétisée in-situ
Cas particulier :
◦ infection liée aux soins
◦ diarrhée post-antibiotiques

PAS DE CONTAMINATION
ALIMENTAIRE

Transmission inter-humaine
 règles d’hygiène

Bactériologie :
◦ bacille Gram Positif anaérobie
◦ spores (forme de résistance)

Diagnostic sur demande
spécifique :
◦ recherche de toxine par PCR
ou immunochromatographie

Staphylococcus aureus
◦ Crème patissière

Bacilleus cereus
◦ Plats préparés, traiteurs (riz +++)

Clostridium perfringens
◦ Viandes en sauce

Agents de toxi-infection alimentaire collective
(TIAC)
◦ cas groupés, symptômes similaires, même repas
◦ nécessite une enquête de l’ARS



Syndrome cholériforme
Mécanisme non toxinogène : adhésion à
l’épithélium puis effacement des villosités
Agent de TIAC (rare)
Clinique et grands syndromes
Pathogènes et physiopathologie
syndrome cholériforme
syndrome dysentérique
Principes de prise en charge
individuelle et collective


Adhésion aux entérocytes
Invasion et destruction des cellules
◦ Inflammation  fièvre
◦ Glaires, sang et pus retrouvés dans les selles

Dose infectante élevée (>106 bactéries)
◦ Campylobacter
◦ Salmonella
◦ Yersinia enterocolitica
◦ E. coli entéroinvasif

Dose infectante faible (10 bactéries)
◦ Shigella dysenteriae

Aliments contaminés pas assez cuits
VOLAILLES
OEUFS
PORC
CAMPYLOBACTER
SALMONELLES
YERSINIA

La diarrhée n’est pas au premier plan des
symptômes
◦ Bactériémie avec sepsis sévère
◦ Signes neurologiques

Salmonelles majeures :
S. Typhi et Paratyphi A, B, C

Bactéries résistent à la phagocytose après
passage de la muqueuse digestive  gagnent la
circulation sanguine


Toxine shiga (S. dysenteriae) ou shiga-like (E. coli
entérohémorragique, EHEC)
Toxine bloque l’ARN ribosomal  mort cellulaire
COLITE HEMORRAGIQUE
MICROANGIOPATHIE THROMBOTIQUE
ATTEINTE RENALE

Types particuliers d’E. coli :
◦ Classiquement O157:H7 (steacks hachés)
◦ Récemment O104:H4 (graines germées)

Diagnostic par PCR sur demande spécifique

Difficulté : isoler un pathogène au milieu d’une
flore variée

J0 : Examen direct : flore / leucocytes / mucus

Culture et isolement du pathogène
J1/J2 : Identification biochimique
+/- sérotypage
J2/J3 : Antibiogramme



Examen direct
Sang +/- pus
Shigella+++
Mucus +/- sang
Salmonella+++
Campylobacter
Yersinia
C.difficile
Virus
Fécal puis eau de riz
Virus+++
Toxine S. aureus
Toxine C. perfringens
Vibrio cholerae
Bactérie
Source
Aliment
Incubation
Selle
E. coli
homme
animal
eau aliment
variable
variable
coquillage, viande
hachée, œufs, eau
0.5 à 2
jours
variable
Salmonella
homme
animal
Shigella
homme
interhumaine
1 à 2 jours
sang /
leucos
Yersinia
porc
viande
1 à 5 jours
variable
Vibrio
homme eau
contaminée
eau, aliment,
coquillage, homme
1 à 5 jours
liquide, eau
de riz
Campylobacter
animal
volaille
1 à 3 jours
sang
Clinique et grands syndromes
Pathogènes et physiopathologie :
syndrome cholériforme
syndrome dysentérique
Principes de prise en charge
individuelle et collective
Déshydratation > 8% du poids corporel
Fièvre mal tolérée / sepsis
Décompensation de co-morbidité
Vomissements incoercibles
Age < 3 mois
Isolement social
HOSPITALISATION
 Réhydratation
 ATB
indiqués devant
◦ Shigella
◦ Gravité
 Si
ATB :
◦ Azithromycine
◦ Céphalosporine 3ème génération
◦ Fluoroquinolone (adulte)

DECLARATION ARS OBLIGATOIRE SI
◦ TIAC
◦ Fièvre typhoïde / paratyphoïde
◦ Choléra


Voir www.invs.sante.fr/surveillance/mdo/
DECLARATION INVS
◦ SHU

Voir www.invs.sante.fr/surveillance/shu/

Vaccination disponible S. Typhi (voyage)

Prévention du péril fécal (hygiène)
Prévention des TIAC : surveillance des aliments
(services d’hygiène, services vétérinaires)




Contamination alimentaire ? Prise d’antibiotique ?
Syndrome cholériforme
◦
◦
◦
◦
Mécanisme entérotoxinogène et entéropathogène
Diarrhée liquide, pas ou peu de fièvre
Pas de leucocytes dans les selles
Toxine bactérienne, E. coli, V. cholerae
Syndrome dysentérique
◦
◦
◦
◦
Diarrhée avec pus, mucus, sang
Fièvre
Leucocytes dans les selles
Shigella, Salmonella, Campylobacter, Yersinia, E. coli

Coproculture (bactérie , toxines CD) +/- hémoculture
Réhydratation +++
ATB non systématiques sauf Shigella ou forme sévère

Déclaration à l’ARS : TIAC, fièvre typhoïde, choléra


◦ fluoroquinolones, C3G, azithromycine
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