Déterminisme génétique du cancer du côlon, du sein et de l`ovaire

LA REVOLUTION DU SEQUENCAGE
DE NOUVELLE GENERATION
(NEW GENERATION SEQUENCING, NGS)
Exome humain 160,000 exons = 30 Mb (1.2% du génome humain)
Profondeur du séquençage 100x
3000 Mb = 3 Gb
Séquençage Sanger sur amplicons : 500 pb
X 1 000 000
Génome humain = 3 Gb

EXOMES CONSTITUTIONNELS: DONNÉES STABILISÉES
Par exome:
34 Mb : 1.2% du génome total
20000 SNV (Single Nucleotide Variation)
500 SNVs rares (fréquence <0.1%) non répertoriés dans les bases de données
1 SNV de novo avec impact biologique
Majorité des SNVs à impact biologique survenus < 10000 ans

Risque de maladie
100%
40%
60%
80%
Nombre de variations génétiques 100
Déterminisme
Oligogénique
Age
Déterminisme
Multigénique
Déterminisme
monogénique
Tolérance biologique
RELECTURE DE LA COMPLEXITE
DU DETERMINISME GENETIQUE DES MALADIES HUMAINES
15
Mutations rares
voire privées
// //

RELECTURE DE LA COMPLEXITE
DU DETERMINISME GENETIQUE DU CANCER

Cancer colon, 32 ans
Cancer colon, 62 ans
Cancer colon, 36 ans
Wt/mt
BENEFICE MEDICAL DU DIAGNOSTIC
DES FORMES HEREDITAIRES DE CANCER COLORECTAL
Wt/ Wt Wt/mt
Lever une angoisse illégitime
et une surveillance médicale injustifiée
chez les sujets non porteurs
Wt/mt
Surveillance adaptée
chez les porteurs
1/500
Mutation MSH2