Shigella DES - Pôle de Biologie Pathologie Génétique

phylogenèse des bactéries établies après analyse comparée
des séquences de l’ARNr 16S
Professeur Michel Simonet, année universitaire 2015-2016

entérobactéries
arbre établi à partir des séquences du facteur d’élongation Tu
(International Journal of Systematic & Evolutionary Microbiology, 2005)
! des bacilles aérobies-anaérobies
! sans exigence culturale particulière
! cytochrome oxydase -
! catalase +
! nitrate-réductase +
! fermentant le glucose
γ-protéobactéries

Shigella
" des bactéries génétiquement très proches d’ Escherichia coli
1.5% de divergence nucléotidique entre E. coli K12 et S. flexneri !!
"
Kiyoshi Shiga
1871-1957
isole le bacille de la dysentérie en 1897
"

Chaudhuri & Henderson, Infection, Genetics and Evolution 2012, 12, 214–226
Shigella, un pathovar d’Escherichia coli
arbre établi après analyse des séquences
génomiques disponibles dans GenBank

Shigella!Escherichia
Kligler-Hajna
des bacilles immobiles
fermentant le glucose sans production de gaz
ne fermentant pas le lactose, ni le saccharose, ni la salicine
ne produisant pas d’hydrogène sulfuré, ni d’uréase
ne produisant pas de lysine décarboxylase
n’utilisant pas le citrate de Christensen ( ≠ Alcalescens-Dispar)
" formant 4 espèces : dysenteriae, boydii, flexneri et sonnei
fermentation du mannitol
Caractères spécifiques d ’ espèce
mannitol - = S. dysenteriae
mannitol + = S. flexneri, S. boydii, S. sonnei
ODC - = S. dysenteriae, S.flexneri, S. boydii
ODC + = S. sonnei
production d’une ornithine décarboxylase
Caractères spécifiques de genre