La tumorothèque et la banque de muscle : des ressources - AP-HM

La tumorothèque et la banque de muscle :
des ressources biologiques au service des patients et des chercheurs
Présentation générale
Finalité de soins et finalité de recherche : quelles différences ?
Mise en place des circuits de collecte
Cession des échantillons
Contacts
Schéma général de fonctionnement
Valorisation de la tumorothèque et de la banque de muscles de l'AP-HM
(document PDF)
Présentation générale
La biobanque de l'AP-HM (responsable médical : Pr D. FIGARELLA-BRANGER)
assure la réception, le stockage et la cession des échantillons cryoconservés (la
cryoconservation permettant une meilleure conservation de certains constituants
cellulaires) et prélevés dans le cadre des soins. Elle abrite la tumorothèque et la
banque de muscles de l'AP-HM.
La biobanque de l'AP-HM a été créée suite à l'appel d'offre DHOS Tumorothèque
2002. Elle est autorisée depuis 2008 sous le numéro 2008-70, puis 2013-1786 par
le Ministère d'Enseignement Supérieur et de la Recherche, pour céder des
prélèvements dans le cadre de projets de recherche.
Cette tumorothèque a une double vocation, cryoconservation dans le cadre du soin (
finalité sanitaire

) et comme centre de ressources biologiques (finalité de recherche ).
Dans le cadre du soin, outre la cryoconservation des prélèvements concernant les
patients de l'AP-HM, elle a également la mission de cryoconserver des
prélèvements provenant de structures hors AP-HM et ceci dans le cadre de
conventions pré-établies entre les structures régionales concernées et l'AP-HM.
La biobanque de l'AP-HM travaille en partenariat avec les filières de soins. Elle est
dotée d'un comité scientifique et travaille en étroite collaboration avec la Direction
de la Recherche et de l'Innovation .
La biobanque de l'AP-HM a été certifiée ISO 9001 du 31 mars 2010 à 2013
(responsable assurance qualité, Mme Karine ACHACHE). Une nouvelle démarche
de certification est en cours dans un cadre plus large de certification de plusieurs
CRB de l'AP-HM.
Sous l'impulsion du cancéropôle PACA , une tumorothèque virtuelle proposant un
catalogue des échantillons stockés dans les trois tumorothèques labellisées de
PACA (tumorothèque de l'AP-HM, tumorothèque de l'institut Paoli-Calmettes et
tumorothèque du centre hospitalier de Nice et du centre Antoine Lacassagne) et
cessibles pour la recherche a été créée. Elle est interrogeable à distance grâce à une
plateforme Web : www.biobank-paca.com .
Les principales collections cryopréservées sont représentées par la
neurooncologie, l'O.R.L., les pathologies urologiques et thoraciques et les sarcomes.
Finalité de soins et finalité de recherche :
quelles différences ?
Les prélèvements sanitaires sont ceux qui feront l'objet de techniques moléculaires
pour la détection de biomarqueurs (biomarqueurs diagnostiques, pronostiques ou
prédictifs de la réponse à certaines thérapeutiques). Ces analyses génèrent un
compte-rendu qui permettra d'aider le clinicien dans le choix du traitement le plus
approprié pour le patient ( bénéfice individuel direct ). Du fait des progrès des
techniques moléculaires, de nombreux marqueurs qui nécessitaient un prélèvement
cryoconservé peuvent actuellement être recherchés sur des prélèvements fixés et
conservés dans les services d'Anatomie Pathologique. Ainsi le listing des tumeurs
qui doivent être conservées à visée sanitaire, et certaines règles de bonnes
pratiques font l'objet de révisions régulières par des comités d'experts sous l'égide
de l'Institut National du Cancer (INCa), www.e-cancer.fr .
Bien que prélevés dans le cadre du soin, certains prélèvements pourront être
utilisés pour la recherche ( requalification) et pourront être cédés à des équipes de
recherche pour la réalisation de travaux qui ne génèrent pas de compte-rendu et

n'ont pas un intérêt direct pour le patient mais permettront à terme de progresser
dans la compréhension des maladies et de trouver par exemple de nouveaux
traitements. Il s'agit d'un bénéfice indirect, collectif, pour faire progresser la
science. Seuls les prélèvements pour lesquels les patients ont signé un
consentement et qui sont en quantité suffisante pourront être utilisés à des fin de
recherche.
Formulaire d'information et de consentement - Adulte (document PDF)
Formulaire d'information et de consentement - Enfant (document PDF)
Fiche de traçabilité des prélèvements pour mise en CRB (document PDF)
Le cancéropôle PACA diffuse régulièrement des plaquettes d'information à l'usage des
patients
Mise en place des circuits de collecte
La cryoconservation à des fins de recherche exige des conditions de qualité suffisante
des échantillons, associées à des exigences éthiques (comme la récupération des
consentements). Ainsi, toute filière de soin souhaitant mettre en place un nouveau
circuit de collecte doit en informer le responsable médical de la biobanque et un
contrat est alors rédigé entre les deux parties, précisant les engagements de
chacun.
Tout prélèvement destiné à la biobanque doit être accompagné du consentement
du patient et de la fiche de traçabilité n°éditique TLF097.
Cession des échantillons
Les demandes de cession dans le cadre de projet de recherche sont examinées par
le comité scientifique de la tumorothèque après vérification de la disponibilité des
échantillons et rédaction d'un projet de recherche par le demandeur. La cession des
échantillons peut se faire dans un délai de 30 jours. Dans le cadre de cession hors
AP-HM un contrat entre les deux parties est signé. Pour les cessions à visée
sanitaire une procédure simplifiée est disponible.
Lors du déstockage, les contrôles qualité font l'objet de contrats entre la biobanque et

le service d'anatomie pathologique et de neuropathologie d'une part pour le contrôle
morphologique et entre la biobanque et le service de transfert d'oncologie biologique
d'autre part pour la réalisation de produits dérivés (ADN) le cas échéant.
Les formulaires de cession (intra AP-HM) et les formulaires de consentement sont
disponibles sur intranet dans les dossiers publics Outlook :
Dossiers publics > Tous les dossiers publics > Centre de Ressources Biologiques AP-
HM > Biobanque ? Tumorothèque et Banque de muscles.
Contacts
Pr Dominique FIGARELLA-BRANGER, responsable médical : dominique.figarella-
[email protected]
Karine ACHACHE, responsable qualité : [email protected]
Soutsakhone TONG, responsable technique :
[email protected] ,
[email protected]
Émilie DENICOLAÏ, référent scientifique des cessions
Schéma général de fonctionnement

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