Analyses de biologie moléculaires réalisées à la PGMC

Analyses de biologie moléculaire disponibles à la Plateforme de Génétique Moléculaire des Cancers d'Aquitaine
Service de Biologie des Tumeurs - CHU Haut-Levêque - Bordeaux - Pr Merlio
Service d'hématologie - CHU Haut-Levêque - Bordeaux - Pr Mahon
Unité de Pathologie Moléculaire - CLCC Bergonié - Bordeaux - Dr I Soubeyran
Service d'hématologie - CLCC Bergonié - Bordeaux - Dr Durrieu
Pathologie
CANCER DU POUMON
CANCER COLORECTAL
CANCER DE L'ESTOMAC
Test : gène / marqueur
TUMEURS SOLIDES
Mutations EGFR
Mutations Kras
Translocation EML4-ALK1
Mutation BRAF
Mutation HER2
Mutation Kras
Mutation BRAF
Instabilité microsatellitaire
Amplification du gène HER2
Pr Merlio : 05-57-65-66-40 - [email protected]
Pr Dubus : 05-57-65-60-11 - [email protected]
Dr Cappellen - 05-57-65-66-35 - [email protected]
Pr Mahon : 05-55-57-15-84 - [email protected]
Dr Lippert : 05-57-65-64-78 - [email protected]
Dr I Soubeyran : 05-56-33-33-19 [email protected]
Dr Mac Grogan : 05-56-33-33-23 [email protected]
Pr Coindre : 05-56-33-33-29 - [email protected]
Dr Durrieu : 05-56-33-33-42 - [email protected]
Contact
Service de Biologie des Tumeurs - CHU - Pr Merlio
Unité de Pathologie Moléculaire - CLCC - Dr I Soubeyran
Service de Biologie des Tumeurs - CHU - Pr Merlio
Unité de Pathologie Moléculaire - CLCC - Dr I Soubeyran
Unité de Pathologie Moléculaire - CLCC - Dr I Soubeyran
Service de Biologie des Tumeurs - CHU - Pr Merlio
Unité de Pathologie Moléculaire - CLCC - Dr I Soubeyran
CANCER DU SEIN
TUMEURS GYNECOLOGIQUES
GLIOBLASTOME
TUMEURS DU SPECTRE
HNPCC
MELANOME
CANCER DE LA THYROIDE
GIST
SARCOMES
Amplification du gène HER2
Mutation FOXL2 (tumeur de la granulosa adulte)
Réarrangement JAZF1 (sarcome stroma endométrial)
Méthylation de MGMT
Instabilité microsatellitaire
Mutations BRAF
Mutation c-KIT
Mutation BRAF
RET/PTC1 - RET/PTC3 (carcinome papillaire)
Mutation BRAF (carcinome papillaire)
Mutation c-KIT (exons 9, 11, 13 et 17)
Mutation PDGFRA (exons 12, 14 et 18)
Amplification MDM2/CDK4 (liposarcome bien
différencié et dédifférencié)
Mutation CTNNB1 (tumeur desmoide)
EWSR1/FLI1 - EWSR1/ERG (PNET)
SSI8/SSX1 - SSI8/SSX2 (synovialosarcome)
PAX3/FKHR - PAX7/FKHR (rhabdomyosarcome
alvéolaire)
EWSR1/WT1 (tumeur desmoplastique à cell rondes)
FUS/DDIT3 - EWSR1/DDIT3 (liposarcome myxoïde)
EWSR1/ATF1 (sarcome à cell claires)
EWSR1/NR4A3 - TAF1168/NR4A3 - TCF12/NR4A3 TFG/NR4A3 (chondrosarcome myxoïde des tissus
mous)
COL1A1/PDGFB (dermatofibrosarcome de Darier et
Ferrand)
FUS/CREB3L2 - FUS/CREB3L1 (sarcome
fibromyxoïde de bas grade)
Réarrangement ALK1 (tumeur myofibroblastique
inflammatoire)
ETV6/NTRK3 (fibrosarcome congénital)
CGH array
Unité de Pathologie Moléculaire - CLCC - Dr Mac Grogan
Unité de Génétique Tumorale - CLCC - Dr Mac Grogan
Service de Biologie des Tumeurs - CHU - Pr Merlio
Unité de Pathologie Moléculaire - CLCC - Dr I Soubeyran
Service de Biologie des Tumeurs - CHU - Pr Merlio
Service de Biologie des Tumeurs - CHU - Pr Merlio
Unité de Pathologie Moléculaire - CLCC - Dr I Soubeyran
Unité de Pathologie Moléculaire - CLCC - Pr Coindre
Unité de Pathologie Moléculaire - CLCC - Pr Coindre
Unité de Pathologie Moléculaire - CLCC - Pr Coindre
ONCO-HEMATOLOGIE
LAL/LAM -diagnostic
LAL/LAM- suivi maladie
résiduelle
LEUCEMIES (LAL/LAM/LMC)
LMC - diagnostic
LMC - suivi maladie résiduelle
LMC
SYNDROMES
MYELODYSPLASIQUES
SMP non LMC
LLC / SYNDROMES
LYMPHOPROLIFERATIFS *
Détection BCR-ABL
MLL-AF4
E2A-PBX1
TEL-AML1
SIL-TAL
NUP214-ABL
PML-RARA
AML1-ETO
CBFbêta-MYH11
DEK-CAN
Mutation FLT3 (ITD)
Mutation NPM
ITD MLL
Mutation CEPBA
Service d'hématologie - CHU - Pr Mahon
Quantification BCR-ABL (p190, p210)
Service d'hématologie - CHU - Pr Mahon
Caryotype conventionnel +/- FISH
Détection BCR-ABL
Quantification BCR-ABL
Mutation ABL *
Service d'hématologie - CHU - Pr Mahon
Service d'hématologie - CHU - Pr Mahon
Service d'hématologie - CHU - Pr Mahon
Service d'hématologie - CHU - Pr Mahon
Caryotype conventionnel +/- FISH
Service d'hématologie - CHU - Pr Mahon
Mutation JAK2 V617F
Mutation exon 12 JAK2 *
Autres mutations *
Caryotype conventionnel +/- FISH
Detection TEL-PDGFRbêta *
Caryotype conventionnel
Anomalies de nombre et de structure (FISH)
Service d'hématologie - CHU - Pr Mahon
Service d'hématologie - CHU - Pr Mahon
Service d'hématologie - CHU - Pr Mahon
Service d'hématologie - CLCC - Dr Durrieu
Clonalité T (TCR  , )
Clonalité B (IgH, Igk)
LYMPHOMES
Clonalité B (IgH)
Unité de Pathologie Moléculaire - CLCC - Dr I Soubeyran
Anomalies nombre et structure (FISH)
BCL2, BCL6, MALT1, MYC
Service de Biologie des Tumeurs - CHU - Pr Merlio
Unité de Pathologie Moléculaire - CLCC - Dr I Soubeyran
Quantification cycline D1
* Contacter le service concerné
Service de Biologie des Tumeurs - CHU - Pr Merlio
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