Analyses de biologie moléculaires réalisées à la PGMC

Analyses de biologie moléculaire disponibles à la Plateforme de Génétique Moléculaire des Cancers d'Aquitaine
Service de Biologie des Tumeurs - CHU Haut-Levêque - Bordeaux - Pr Merlio
Pr Merlio : 05-57-65-66-40 - [e-mail]
Pr Dubus : 05-57-65-60-11 - Pierre.Du[email protected]
bordeaux2.fr
Dr Cappellen - 05-57-65-66-35 - david.cappellen@u-
bordeaux2.fr
Service d'hématologie - CHU Haut-Levêque - Bordeaux - Pr Mahon Pr Mahon : 05-55-57-15-84 - francois-
[email protected]x.fr
Dr Lippert : 05-57-65-64-78 - eric.lippert@chu-
bordeaux.fr
Unité de Pathologie Moléculaire - CLCC Bergonié - Bordeaux - Dr I Soubeyran
Dr I Soubeyran : 05-56-33-33-19 -
[email protected]rg
Dr Mac Grogan : 05-56-33-33-23 -
[email protected]
Pr Coindre : 05-56-33-33-29 - [e-mail]
Service d'hématologie - CLCC Bergonié - Bordeaux - Dr Durrieu Dr Durrieu : 05-56-33-33-42 - [e-mail]
Pathologie Test : gène / marqueur Contact
TUMEURS SOLIDES
CANCER DU POUMON
Mutations EGFR
Service de Biologie des Tumeurs - CHU - Pr Merlio
Unité de Pathologie Moléculaire - CLCC - Dr I Soubeyran
Mutations Kras
Translocation EML4-ALK1
Mutation BRAF
Mutation HER2
CANCER COLORECTAL Mutation Kras Service de Biologie des Tumeurs - CHU - Pr Merlio
Unité de Pathologie Moléculaire - CLCC - Dr I Soubeyran
Mutation BRAF
Instabilité microsatellitaire Unité de Pathologie Moléculaire - CLCC - Dr I Soubeyran
CANCER DE L'ESTOMAC Amplification du gène HER2 Service de Biologie des Tumeurs - CHU - Pr Merlio
Unité de Pathologie Moléculaire - CLCC - Dr I Soubeyran

CANCER DU SEIN Amplification du gène HER2 Unité de Pathologie Moléculaire - CLCC - Dr Mac Grogan
TUMEURS GYNECOLOGIQUES Mutation FOXL2 (tumeur de la granulosa adulte) Unité de Génétique Tumorale - CLCC - Dr Mac Grogan
Réarrangement JAZF1 (sarcome stroma endométrial)
GLIOBLASTOME Méthylation de MGMT Service de Biologie des Tumeurs - CHU - Pr Merlio
TUMEURS DU SPECTRE
HNPCC Instabilité microsatellitaire Unité de Pathologie Moléculaire - CLCC - Dr I Soubeyran
Mutations BRAF
MELANOME Mutation c-KIT Service de Biologie des Tumeurs - CHU - Pr Merlio
Mutation BRAF
CANCER DE LA THYROIDE RET/PTC1 - RET/PTC3 (carcinome papillaire) Service de Biologie des Tumeurs - CHU - Pr Merlio
Unité de Pathologie Moléculaire - CLCC - Dr I Soubeyran
Mutation BRAF (carcinome papillaire)
GIST Mutation c-KIT (exons 9, 11, 13 et 17) Unité de Pathologie Moléculaire - CLCC - Pr Coindre
Mutation PDGFRA (exons 12, 14 et 18)
SARCOMES
Amplification MDM2/CDK4 (liposarcome bien
différencié et dédifférencié)
Unité de Pathologie Moléculaire - CLCC - Pr Coindre
Unité de Pathologie Moléculaire - CLCC - Pr Coindre
Mutation CTNNB1 (tumeur desmoide)
EWSR1/FLI1 - EWSR1/ERG (PNET)
SSI8/SSX1 - SSI8/SSX2 (synovialosarcome)
PAX3/FKHR - PAX7/FKHR (rhabdomyosarcome
alvéolaire)
EWSR1/WT1 (tumeur desmoplastique à cell rondes)
FUS/DDIT3 - EWSR1/DDIT3 (liposarcome myxoïde)
EWSR1/ATF1 (sarcome à cell claires)
EWSR1/NR4A3 - TAF1168/NR4A3 - TCF12/NR4A3 -
TFG/NR4A3 (chondrosarcome myxoïde des tissus
mous)
COL1A1/PDGFB (dermatofibrosarcome de Darier et
Ferrand)
FUS/CREB3L2 - FUS/CREB3L1 (sarcome
fibromyxoïde de bas grade)
Réarrangement ALK1 (tumeur myofibroblastique
inflammatoire)
ETV6/NTRK3 (fibrosarcome congénital)
CGH array

ONCO-HEMATOLOGIE
LAL/LAM -diagnostic
Détection BCR-ABL
Service d'hématologie - CHU - Pr Mahon
MLL-AF4
E2A-PBX1
TEL-AML1
SIL-TAL
NUP214-ABL
PML-RARA
AML1-ETO
CBFbêta-MYH11
DEK-CAN
Mutation FLT3 (ITD)
Mutation NPM
ITD MLL
Mutation CEPBA
LAL/LAM- suivi maladie
résiduelle Quantification BCR-ABL (p190, p210) Service d'hématologie - CHU - Pr Mahon
LEUCEMIES (LAL/LAM/LMC) Caryotype conventionnel +/- FISH Service d'hématologie - CHU - Pr Mahon
LMC - diagnostic Détection BCR-ABL Service d'hématologie - CHU - Pr Mahon
LMC - suivi maladie résiduelle Quantification BCR-ABL Service d'hématologie - CHU - Pr Mahon
LMC Mutation ABL * Service d'hématologie - CHU - Pr Mahon
SYNDROMES
MYELODYSPLASIQUES Caryotype conventionnel +/- FISH Service d'hématologie - CHU - Pr Mahon
SMP non LMC
Mutation JAK2 V617F
Service d'hématologie - CHU - Pr Mahon
Mutation exon 12 JAK2 *
Autres mutations *
Caryotype conventionnel +/- FISH
Detection TEL-PDGFRbêta *
LLC / SYNDROMES
LYMPHOPROLIFERATIFS *
Caryotype conventionnel Service d'hématologie - CHU - Pr Mahon
Anomalies de nombre et de structure (FISH) Service d'hématologie - CHU - Pr Mahon
Service d'hématologie - CLCC - Dr Durrieu

LYMPHOMES
Clonalité T (TCR  , ) Service de Biologie des Tumeurs - CHU - Pr Merlio
Clonalité B (IgH, Igk)
Clonalité B (IgH) Unité de Pathologie Moléculaire - CLCC - Dr I Soubeyran
Anomalies nombre et structure (FISH)
BCL2, BCL6, MALT1, MYC Service de Biologie des Tumeurs - CHU - Pr Merlio Unité de Pathologie Moléculaire - CLCC - Dr I Soubeyran
Quantification cycline D1 Service de Biologie des Tumeurs - CHU - Pr Merlio
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