MABioVis M A Vis
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LaBRI MABioVis Modèles et Algorithmes pour la Bioinformatique et la Visualisation MABioVis • Bilan 2009 — 2014 • CoBalt • EVADoMe • Perspec;ves 2 LaBRI LaBRI Bilan MABioVis 2009 — 2014 • 10% du poten;el LaBRI – Effec;fs et produc;on • Projet émergent puis équipe en 2005 [...] la capacité du LaBRI à cul3ver l’émergence scien3fique à travers des projets transversaux [...] Rapport AERES, mai 2010 4 LaBRI MABioVis 2009 — 2014 MABioVis ISPED CBiB INRA Borde aux 1 Le LaBRI environnement référen3el des informa3ciens sur le site bordelais Rapport AERES, mai 2010 5 LaBRI MABioVis 6 LaBRI MABioVis – Des travaux en phase avec le monde « extérieur » • Business Intelligence – Profils / comportements clients (exposé EVADoMe) – SoTware visualiza;on • Sciences humaines et sociales – Innova;on sociale, poli;que publique, stratégie des entreprises et développement territorial • Biologie et santé – Pathologies spécifiques (exposé CoBalt) – Evolu;on cellulaire / génomique – Neurosciences 7 LaBRI MABioVis Evolution 2009 —2014 • Rapport d’évalua;on 2009 / 2013 (mi-­‐parcours) – qualité des travaux en bio-­‐informa;que / originalité des travaux sur la visualisa;on dans le paysage français – [aller vers une] meilleure connaissance en biologie, partagée par tous les membres de l'équipe – groupe de travail commun à toute l’équipe – rapprochement des deux thèmes « bio » – renforcer les cadres de cehe équipe, en par;culier du côté de la bio-­‐informa;que mais pas seulement 8 LaBRI LaBRI Perspectives MABioVis – Défis scientifiques • Modélisa;on – Adapta;on des modèles pour tenir compte de volumes importants de données • Fouille – Distribu;on des données et des algorithmes – Adapta;on des méthodes d’analyse et d’explora;on • Visual analy;cs – Hétérogénéité, caractère mul;varié des données – Assurer l’interac;vité du processus de fouille et d’analyse visuelle 43 LaBRI MABioVis – Des travaux en phase avec le monde « extérieur » • Biologie et Santé – Inscrip;on des travaux dans la structura;on de l’environnement local (LabEx BRAIN, SIRIC BRIO, ISPED, biologie synthé;que, cluster TIC Santé) • SHS – Par;ciper à la structura;on de l’environnement local (droit — COMPTRASEC, économie — GRETHa, géographie — ADESS, infocom — MICA) • Développer un pôle de compétences en phase avec le ;ssu socio-­‐économique régional et na;onal – Data science & engineering – En lien avec les ac;ons de forma;on 44 LaBRI MABioVis – SWOT • Expérience pluridisciplinaire avérée – Biologie et santé – SHS • Impact – Transfert / Spin-­‐off (SIMBALS) – Standard interna;onaux – Logiciels académiques 45 LaBRI MABioVis – SWOT • Poten;el humain limité – Par;cipa;on à la structura;on des pôles de compétences – Sollicita;ons répétées du monde industriel et des partenaires académiques • Synergie intra-­‐équipe – Redondance de compétences entre membres vs travaux parallèles – Renforcer la gouvernance au niveau « équipe » – Encadrement insuffisant 46 LaBRI MABioVis • Pour plus d’informa;ons http://mabiovis.labri.fr/ 47 LaBRI
