MABioVis M A Vis

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LaBRI
MABioVis
Modèles et
Algorithmes pour
la Bioinformatique et la
Visualisation
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• Bilan 2009 — 2014 • CoBalt • EVADoMe • Perspec;ves 2
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Bilan
MABioVis 2009 — 2014
• 10% du poten;el LaBRI –  Effec;fs et produc;on • Projet émergent puis équipe en 2005 [...] la capacité du LaBRI à cul3ver l’émergence scien3fique à travers des projets transversaux [...]
Rapport AERES, mai 2010
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MABioVis 2009 — 2014
MABioVis ISPED
CBiB
INRA
Borde
aux 1
Le LaBRI environnement référen3el des informa3ciens sur le site bordelais
Rapport AERES, mai 2010
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MABioVis – Des travaux en
phase avec le monde
« extérieur »
• Business Intelligence –  Profils / comportements clients (exposé EVADoMe) –  SoTware visualiza;on • Sciences humaines et sociales –  Innova;on sociale, poli;que publique, stratégie des entreprises et développement territorial • Biologie et santé –  Pathologies spécifiques (exposé CoBalt) –  Evolu;on cellulaire / génomique –  Neurosciences 7
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Evolution 2009 —2014
• Rapport d’évalua;on 2009 / 2013 (mi-­‐parcours) –  qualité des travaux en bio-­‐informa;que / originalité des travaux sur la visualisa;on dans le paysage français –  [aller vers une] meilleure connaissance en biologie, partagée par tous les membres de l'équipe –  groupe de travail commun à toute l’équipe –  rapprochement des deux thèmes « bio » –  renforcer les cadres de cehe équipe, en par;culier du côté de la bio-­‐informa;que mais pas seulement 8
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Perspectives
MABioVis – Défis
scientifiques
• Modélisa;on –  Adapta;on des modèles pour tenir compte de volumes importants de données • Fouille –  Distribu;on des données et des algorithmes –  Adapta;on des méthodes d’analyse et d’explora;on • Visual analy;cs –  Hétérogénéité, caractère mul;varié des données –  Assurer l’interac;vité du processus de fouille et d’analyse visuelle 43
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MABioVis – Des travaux en
phase avec le monde
« extérieur »
• Biologie et Santé
–  Inscrip;on des travaux dans la structura;on de l’environnement local (LabEx BRAIN, SIRIC BRIO, ISPED, biologie synthé;que, cluster TIC Santé) • SHS –  Par;ciper à la structura;on de l’environnement local (droit — COMPTRASEC, économie — GRETHa, géographie — ADESS, infocom — MICA) • Développer un pôle de compétences en phase avec le ;ssu socio-­‐économique régional et na;onal –  Data science & engineering –  En lien avec les ac;ons de forma;on 44
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MABioVis – SWOT
• Expérience pluridisciplinaire avérée –  Biologie et santé –  SHS • Impact –  Transfert / Spin-­‐off (SIMBALS) –  Standard interna;onaux –  Logiciels académiques 45
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MABioVis – SWOT
• Poten;el humain limité –  Par;cipa;on à la structura;on des pôles de compétences –  Sollicita;ons répétées du monde industriel et des partenaires académiques • Synergie intra-­‐équipe –  Redondance de compétences entre membres vs travaux parallèles –  Renforcer la gouvernance au niveau « équipe » –  Encadrement insuffisant 46
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• Pour plus d’informa;ons http://mabiovis.labri.fr/
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