Inventaire des populations de macroinvertébrés d

Rapport de stage
Inventaire des populations de
macroinvertébrés d’eau douce, au sein de la
réserve naturelle de l’Île du Girard
Réalisé par Florian BASSET
Master 1 Sciences de l’environnement 2013

Sommaire
Remerciement 5
Présentation de l’organisme d’accueil 9
Introduction 7
Matériels et méthodes 8
Choix et descriptions des stations
.....10
Stratégie d’échantillonnage 10
Matériel
11
Prélèvements 11
Identification 11
Détermination du PH
11
Analyses statistiques 12
Analyse de l’effort d’échantillonnage 12
Calcul des différents indices 12
Etude des traits physiologiques 13
Résultats 14
Effort d’échantillonnage 14
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Structure de la communauté de macroinvertébrés 15
Etude des traits physiologiques 16
Analyse du PH de l’eau 17
Discussion 18
Effort d’échantillonnage 18
Structure des communautés de macroinvertébrés et impact des
caractéristiques des stations 18
Conclusion 20
Bibliographie 21
Sitographie 23
Annexes 24
Résumé 28
Figure 1: Courbe de raréfaction sur l'ensemble du Vieux Doubs. La zone grisée correspond
aux marges d’erreurs..............................................................................................................14
Figure 2: Courbe de raréfaction pour chacune des station. (Station 1 en bleu, station 2 en
rouge, station 3 en noir, station 4 en vert, station 5 en rose, station 6 en orange. Les zones
grisées correspondent aux marges d’erreurs.).......................................................................14
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Figure 1: Courbe de raréfaction sur l'ensemble du Vieux Doubs..............Erreur:sourcedela
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Figure 1: Courbe de raréfaction sur l'ensemble du Vieux Doubs. La zone grisée correspond
aux marges d’erreurs..............................................................................................................14
Figure 2: Courbe de raréfaction pour chacune des station. (Station 1 en bleu, station 2 en
rouge, station 3 en noir, station 4 en vert, station 5 en rose, station 6 en orange. Les zones
grisées correspondent aux marges d’erreurs.).......................................................................14
Tableau 1 Richesse, abondance et diversité dans les différentes stations de prélèvements.14
Tableau 2 Rapport Gammaridae sur Asellidae en fonction des différentes stations..............15
Tableau 3: Etude du degré de trophie des différentes stations..............................................16
Tableau 4: Etude de la valeur saprobiale sur l'ensemble des prélèvements..........................16
Tableau 5: Moyenne des Ph, sur les différentes stations.......................................................17
Annexe 1: Exemple de courbes de hauteur d’eau tiré du site Vigie-Crue. Les lignes
horizontales représentent les crues historiques......................................................................23
Annexe 2: Carte des différents écosystèmes et des prélèvements effectués sur l'île du
Girard......................................................................................................................................25
Annexe 3: Décompte des taxa dans les différentes stations..................................................26
Vieux Doubs Aval barrage (F.D).............................................................................................27
Vieux Doubs amont barrage (F.D)..........................................................................................27
Vieux Doubs Aval gué des Seignes (F.B)...............................................................................27
Vieux Doubs Amont gué des Seignes (F.B)...........................................................................27
Vieux Doubs gué des Moizes (F.T).........................................................................................27
Bassin île sud (G.B)................................................................................................................27
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Remercîments
Je remercie tout particulièrement Frédéric Topin de m’avoir accueilli dans ses locaux et de
m’avoir offert cette opportunité de stage. Merci également de m’avoir accompagné, d’avoir
partagé ses connaissances et son expérience, et de m’avoir conseillé tout au long de la
réalisation de ce rapport.
Merci à Marion Fury pour ses conseils, ses waders qui m’ont évitées la noyade, ainsi que
d’avoir partagée son bureau avec moi.
Egalement un grand merci à Loïc Bollache et Stéphane Garnier pour m’avoir consacré du
temps et permis de trouvé un exemplaire d’un livre.
Merci à Thomas Saucède d’avoir répondu à mes mails aussi rapidement.
Merci à Fanny Dens pour les nombreux covoiturages et les discussions animées à propos de
Kanamé.
Je tiens également à remercier Chi pour tous les moments de détente qu’elle m’a offert
pendant la rédaction de ce rapport.
Merci enfin à ma Flo pour son soutien, son aide et surtout tous les bons moments passés
ensemble. L’tchoc !
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