Exploration des acteurs et des mécanismes de réparation de l’ADN chez les Archaea hyperthermophiles BIOLOGIE & SANTÉ 2011 ARCHAEAL DNA REPAIR Biologie & santé 2011 Percer les secrets d'un microorganisme marin, champion de la réparation de l'ADN Les Archaea hyper-thermophiles sont des micro-organismes marins capables de vivre et de se reproduire dans des milieux riches en métaux lourds, qui n’offrent ni lumière, ni oxygène, par des températures de plus de 80°C. Elles constituent, pour les biologistes et les généticiens, un excellent modèle d’étude des mécanismes de réparation de l’ADN, car le leur subit d’importants dommages dans les conditions extrêmes imposées par leur environnement. Si elles existent depuis près d’un milliard d’années, elles intéressent les scientifiques depuis la fin des années 70, période à laquelle a commencé l’exploration des sources hydro-thermales qui constituent un de leur habitat. Elles ouvrent aujourd’hui des perspectives à la recherche fondamentale en génétique, mais aussi à la mise au point de nouvelles applications biotechnologiques. Pyrococcus abyssi Pyrococcus abyssi a été isolée à partir d’une source hydrothermale profonde. Son génome est disponible. L’une de ces archea, Pyrococcus abyssi, est au cœur du projet ARCHAEAL DNA REPAIR. Micro-organisme procaryote, donc dépourvu de noyau cellulaire, sa taille ne dépasse pas un micromètre. Elle partage avec les eucaryotes et les bactéries un certain nombre de caractéristiques dont l’étude comparée permettra des avancées sur la fonction, la structure et l’origine des protéines impliquées dans la réplication et la réparation de l’ADN. Labélisé par le Pôle Mer Bretagne, ARCHAEAL DNA REPAIR a obtenu un soutien financier de l’Agence Nationale de la Recherche au titre de son appel à projets "Programmes nonthématiques". Résultats Principaux -Mise en place d’un programme de recherche interdisciplinaire sur la stabilité génomique dans des conditions extrêmes. - Caractérisation de nouveaux complexes macromoléculaires impliqués dans la réparation de l’ADN par des approches génétiques, biochimiques, biophysiques et de biologie structurale. - Identification du complexe Ribonuclease HII-replication clamp (PCNA) qui chez l’homme participe à l’élimination des ribonucléotides incorporés. - Identification d’une nouvelle famille d’endonucléases présentes chez les Archaea et Mycobacteria. Perspectives -Etudes des bases moléculaires de maladies auto-inflammatoires impliquant des mutations sur les gènes rnase HII (e.g. AicardiGoutieres syndrome). -Analyse in vivo, en temps réel, de la réplication et de la réparation de l’ADN à l’aide des techniques de pointe en microscopie. -Une récente étude de marché que nous avons commandité préconise le développement de nouvelles applications pour protéger et/ou amplifier l’ADN utilisant les nouvelles molécules issues du projet ARCHAEAL DNA REPAIR . Références MARINE-EXPRESS: taking advantage of high throughput cloning and expression strategies for the post-genomic analysis of marine organisms (2010). Groisillier A, Hervé C, Jeudy A, Rebuffet E, Pluchon PF, Chevolot Y, Flament D, Geslin C, Morgado IM, Power D, Branno M, Moreau H, Michel G, Boyen C, Czjzek M. Microb Cell Fact. 9:45. Nouvelles molécules issues d’Archaea pour améliorer la protection et l’amplification de l’ADN" Brevet Européen N° EP 10015541.5 déposé le 10 décembre 2010. Copropriétaires : IFREMER / UBO / CNRS Structure and function of a novel endonuclease acting on branched DNA substrates. Ren B, Kühn J, Meslet-Cladiere L, Briffotaux J, Norais C, Lavigne R, Flament D, Ladenstein R, Myllykallio H. EMBO J. 2009 Aug 19;28(16): 2479-89. A novel proteomic approach identifies new interaction partners for proliferating cell nuclear antigen. Meslet-Cladiére L, Norais C, Kuhn J, Briffotaux J, Sloostra JW, Ferrari E, Hübscher U, Flament D, Myllykallio H. J Mol Biol. 2007 Oct 5;372(5):1137-48. CONTACT : [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] 162