SP2a : Étude des interactions Génotype*Milieu au niveau national

SP2a
SP2a : Étude des interactions Génotype*Milieu au niveau national
■ OBJECTIF
La France présente une grande diversité de conditions pédoclimatiques et par conséquent des systèmes d’élevage très
variés. Pourtant, les schémas de sélection actuels en bovins laitiers considèrent que les meilleurs reproducteurs sont
les mêmes quel que soit le milieu. L’objectif de ce sous-projet est d’étudier les interactions Génotype*Milieu au niveau
national sur les caractères laitiers (Lait, Matière Grasse, Matière Protéique, Taux Butyreux, Taux Protéique) et
ère
fonctionnels (Score Cellulaire et Réussite à la 1 Insémination) pour les trois principales races bovines laitières
(Normande, Montbéliarde, Holstein).
■ DÉFINITION DES INTERACTIONS GÉNOTYPE*MILIEU
Une des hypothèses sous-jacentes à la présence
d’interactions Génotype*Milieu est que le contrôle d’un
caractère se fait par des gènes en partie différents
selon le milieu dans lequel il est exprimé. Par
conséquent, la valeur génétique d’un animal pourrait
dépendre du milieu dans lequel il évolue. La Figure 1
ci-dessous présente les 3 formes de relation possibles
entre la valeur génétique de 3 animaux aux génotypes
différents (de différentes couleurs) et le milieu décrit
par une variable continue en abscisse.
• absence d’interaction : les animaux ont la même
valeur génétique quel que soit le milieu. C’est la
situation considérée aujourd’hui ;
• interaction sous forme d’effet d’échelle : le
classement des animaux est le même quel que soit le
milieu mais les différences entre animaux sont
exacerbées dans certains milieux ;
• interaction sous forme de reclassement : le
classement des animaux n’est pas le même selon le
milieu.
Valeur génétique
Figure 1 : Les différentes formes d’interactions Génotype*Milieu (valeur génétique de 3 animaux en fonction du milieu)
10
pas d'interaction
10
5
5
0
0
interaction sous forme
d'effet d'échelle
10
interaction sous forme de
reclassement
5
0
Descripteur continu du milieu
Situation considérée
actuellement
Indicateur d’effet
d’échelle :
Indicateur de
reclassement:
Héritabilité différente
selon les milieux
Corrélations
génétiques entre
milieux différentes de 1
SP2a : Étude des interactions Génotype*Milieu au niveau national
■ UNE ÉTUDE DE GRANDE ENVERGURE AVEC UNE DÉFINITION INNOVANTE DU MILIEU
Cette étude a permis d’actualiser nos connaissances
sur les interactions Génotype*Milieu en France qui
dataient des années 80 : elle a été menée sur les 3
grandes races laitières françaises (Normande,
Montbéliarde, Holstein), avec des effectifs d’animaux
et d’élevages importants (jusqu’à 250 000 animaux en
Holstein). L’innovation principale est la définition du
milieu à partir des profils Troupeau x Jour de Contrôle
(TJC) des élevages qui représentent la part de la
production des animaux permise uniquement par les
conditions d’élevage du jour.
■ RÉSULTAT : MISE EN ÉVIDENCE D’UN EFFET D’ÉCHELLE
• Pas d’interaction sous forme de reclassement :
les corrélations génétiques pour un même caractère
entre différents milieux sont très proches de 1 quels
que soient la race et le caractère. Les schémas de
sélection actuels sont donc pertinents.
• Une interaction sous forme d’effet d’échelle : des
gradients d’héritabilité ont été observés dans les 3
races pour les caractères laitiers et fonctionnels
(Tableau 1). Plus le profil TJC a un niveau élevé –
c'est-à-dire plus la conduite permet de produire
beaucoup –, plus l’héritabilité du caractère est
importante. Les différences de valeurs génétiques
entre animaux sont exacerbées dans les milieux les
plus intensifs. Le Tableau 1 montre notamment que
l’écart-type génétique pour la production laitière passe
de 769 à 914 kg entre les milieux peu intensifs et
intensifs.
Tableau 1 : Écart type génétique et héritabilité de différents caractères en fonction du milieu pour la race Holstein
Type de milieu
Caractère
Lait 305j (kg)
Milieu peu intensif
Écart type
Héritabilité
génétique
769
0,40
Milieu moyennement intensif
Écart type
Héritabilité
génétique
894
0,45
Milieu intensif
Écart type
Héritabilité
génétique
914
0,47
Matière Grasse 305j (kg)
30,6
0,39
34,5
0,43
35,1
0,45
Matière Protéique 305j (kg)
20,4
0,32
24,1
0,36
24,7
0,39
Taux Butyreux 305j (g/kg)
3,87
0,78
3,92
0,78
3,93
0,80
Taux Protéique 305j (g/kg)
1,58
0,64
1,58
0,64
1,61
0,67
■ CONCLUSION - PERSPECTIVES
Cette étude montre que malgré la diversité des milieux sur le territoire français, il n’existe pas d’interaction
Génotype*Milieu sous forme de reclassement : les meilleurs reproducteurs sont les mêmes quel que soit le milieu.
Les schémas de sélection actuels sont donc pertinents. Il existe tout de même une interaction sous forme d’effet
d’échelle. Des réflexions sont actuellement en cours pour mieux prendre en compte cet effet pour le conseil en
élevage et dans les modèles d’évaluation génétique.
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