JC. Sabourin

La tumorothèque virtuelle
 La tumorothèque virtuelle du
canceropôle Nord-Ouest est composée
de deux outils informatiques
 Un Système de Gestion de Tumorothèque
 Un outil de tumorothèque virtuelle
4èmes Journées Scientifiques – 5 et 6 mai 2011 – Deauville
Le système de gestion de
tumorothèque
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Le Système de Gestion de Tumorothèque
 Un système unique pour les établissements
du CNO : TD Biobank de Technidata®
TD Biobank permet une gestion de qualité tout en
tenant compte des aspects traçabilité des
échantillons et prélèvements
TD Biobank permet également d’assurer les
activités de gestion de collections en respectant
les principes d’éthique et les impératifs du
management de la qualité
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Le Système de Gestion de Tumorothèque
 Gestion et suivi des ressources biologiques
Traçabilité (du prélèvement jusqu’à la cession)
Stockage (aide au placement ; réservation de
place)
Gestion des réseaux et des projets de recherche
Requêtes multicritères et génération de courriers
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Le Système de Gestion de Tumorothèque
• Information
patient
• Filiation
• Traçabilité des
actions
• Traçabilité des
emplacements
de stockage
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Le Système de Gestion de Tumorothèque
• Espace de
stockage du site
courant
• Réservation de
boites pour un
protocole, une
collection
• Ouvrir une boite
• Propriété d’une
ressource : click
droit
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Le Système de Gestion de Tumorothèque
 Valorisation des collections
Suivi des demandes d’échantillons
Edition de catalogues
Aide pour le retour d’information au patient
Annotation des collections en lien possible
avec le dossier patient (clinique, génétique,
généalogique, morphologique…)
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Le Système de Gestion de Tumorothèque
 Une assurance de qualité
Gestion des consentements
Gestion des non-conformités
Historique des ressources biologiques
(donneurs, prélèvements, échantillons,
aliquots, produits…)
Alertes (gestion des stocks, gestion des
demandes)
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Le Système de Gestion de Tumorothèque
 Base de données ergonomique à
l’utilisation intuitive
Paramétrable et évolutive
Interopérable
Aide à la saisie (listes déroulantes,
thésaurus…)
Génération de requêtes
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Le Système de Gestion de Tumorothèque
Valorisation de l’information médicale
Modeleur de fiche d’annotations biocliniques
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Le Système de Gestion de Tumorothèque
• Sélection et
mixage de
requêtes
• Choix des
critères de
requête
• Choix des
variables à
exporter
• Prévisualisation
des résultats
• Barre de statut
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La tumorothèque virtuelle
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La tumorothèque virtuelle
La Tumorothèque Virtuelle est un
catalogue consultable sur Internet et qui
regroupe sous un format commun, définit
par l’INCa, des collections d'échantillons
biologiques provenant de patients atteints
de
cancer,
permettant
ainsi
aux
chercheurs d ’ identifier des groupes
d ’ échantillons homogènes pour la
réalisation de projets scientifiques en
cancérologie
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La tumorothèque virtuelle
 La Tumorothèque Virtuelle repose sur les
dernières technologies web ainsi qu’une
base de données Oracle
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La tumorothèque virtuelle
 La description de l’échantillon (et sa
recherche) s’appuie sur la classification
internationale de l’OMS - CIM 10 - CIM O
et la classification française ADICAP
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La tumorothèque virtuelle
Deux modes d’accès sont proposés aux
utilisateurs :
 Une recherche utilisant la Classification
Internationale des Maladies de l’OMS
La recherche multicritères est composée de
formulaires d’interrogations sur l’intégralité des
items du catalogue de l’INCa (personnalisable par
le super administrateur). Les classifications CIM10, CIM-O et ADICAP pourront être utilisées dans
cette recherche
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La tumorothèque virtuelle
 La recherche par arborescence de la
classification CIM10 consiste à naviguer dans les
chapitres et sous-chapitres de la classification,
avec pour chaque niveau le nombre de
prélèvements correspondants dans la base
Un graphique est généré dynamiquement pour
afficher la répartition des prélèvements au sein
des différents chapitres
Pour cette recherche le diagnostic principal est
utilisé
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La tumorothèque virtuelle
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La tumorothèque virtuelle
 Une recherche multicritères
Ce dernier type de requête est basé sur un
moteur de recherche intuitif et rapide qui
permet aux chercheurs de sélectionner parmi
les ressources biologiques disponibles des
échantillons répondant à des critères
médicaux (type de cancer, taille de la tumeur
…) pour ensuite en faire la demande auprès
des sites possédant les prélèvements
recherchés
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La tumorothèque virtuelle
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La tumorothèque virtuelle
Caractéristiques de la solution
Fusion des données d'import dans une même
base de données (Oracle)
Accès Internet (Internet Explorer, Mozilla)
Accès sécurisé (type HTTPS/SSL) pour
l'import et les fonctions de gestion
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 Proposition de différents profils de connexion :
 connexion publique
 connexion authentifiée (utilisateur simple, utilisateur
simple avec droit d’import, administrateur
d’établissement, super administrateur)
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La tumorothèque virtuelle
 Accès hautement sécurisé :
Identification des utilisateurs par tumorothèque
Affectation des rôles des utilisateurs en fonction de
leur groupe et de leur responsabilité
Cryptage des NIP pour un total anonymat des NIP
sur le serveur.
Procédures d’import et d’export de données pour
les différents établissements
 Multi langue (anglais et français)
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 Retrouver la TVCNO dès cet été à
l’adresse suivante :
www.biobank-no.org
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