Titre de la présentation Date/lieu ITMO
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ITMO Cancer Titre de la présentation Date/lieu (éventuellement) CEA CHRU CNRS CPU INRA INRIA INSERM INSTITUT PASTEUR IRD CEA CHRU CNRS CPU INRA INRIA INSERM INSTITUT PASTEUR IRD 1 ITMO Cancer Hétérogénéité tumorale et microenvironnement de in silico et in vivo / ex vivo modèles basés sur des données réelles et des ressources biologiques .... ... à la recherche translationnelle pour définir les meilleures stratégies thérapeutiques pour soigner plus de patients CEA CHRU CNRS CPU INRA INRIA INSERM INSTITUT PASTEUR IRD Objectifs de l’aap • élargir notre compréhension de l’apparition, du développement et des résistances au thérapies des cancers et innover dans les domaines du diagnostic et proposer des approches thérapeutiques intégratives pour éviter les risques de rechute aujourd’hui élevés. • une meilleure compréhension des interactions de la tumeur et des composantes de l’écosystème tumoral. Analyse de l’hétérogénéité génétique et cellulaire de la tumeur et de son environnement, dont le stroma, le système vasculaire, le système immunitaire. • couvre les aspects fondamentaux et translationnels. • promouvoir la mise en œuvre d’une masse critique en termes de ressources et de compétences nécessaires à la conduite de tels projets de recherche. La nature interdisciplinaire requiert une coopération nationale entre des équipes issues de différents champs thématiques, tels la biologie cellulaire, la modélisation mathématique, la génétique et l’épigénomique, la mécanobiologie ... afin de pouvoir traiter les sujets de façon intégrée. CEA CHRU CNRS CPU INRA INRIA INSERM INSTITUT PASTEUR IRD 3 From Knowledge to Clinical benefit Toward Combination Strategies with Curative Potential Padmanee Sharma and James P. Allison, Cell, 2015 CEA CHRU CNRS CPU INRA INRIA INSERM INSTITUT PASTEUR IRD 4 Calandrier Oct 2014 Go/No: evaluation par le Plan Cancer (Aviesan/INCa) SAB recommendation: Go…. • Mars 2015:definition des objectifs du programme par committee ad hoc (chairman: president du SAB) • Avril 2015 : lancement d’un questionnaire Aviesan: recencemant des equipes interessées • 23 September 2015: CRCL symposium: presentation de l’aap CEA CHRU CNRS CPU INRA INRIA INSERM INSTITUT PASTEUR IRD 5 Analyse sur 133 réponses Questionnaire envoyé aux 800 équipes inscrites sur la plate forme de l’ITMO cancer : • • • • • Votre thématique de recherche Vos domaines de compétences Votre spécialité(ex: biologiste, mathématicien, etc Mots clefs de votre programme de recherche Vos besoins en compétences complémentaires pour mener votre projet dans le contexte multidisciplinaire • Résumé du programme de recherche CEA CHRU CNRS CPU INRA INRIA INSERM INSTITUT PASTEUR IRD 6 133 Equipes différentes ont renseigné le questionnaire au 18 sep (162 au 30 octobre) • • • • • • Votre thématique de recherche Vos domaines de compétences Votre spécialité(ex: biologiste, mathématicien, etc Mots clefs de votre programme de recherche Vos besoins en compétences complémentaires pour mener votre projet dans le contexte multidisciplinaire Résumé du programme de recherche • Renseigné à 100% , 75%exploitable • Renseigné 100%, exploitable • Renseigné à 100%, exploitable • 100% • 80% (10% non déclarés car souhaitent mettre leur compétence au service de la communauté • 85% L’ensemble des informations rend les données exploitables CEA CHRU CNRS CPU INRA INRIA INSERM INSTITUT PASTEUR IRD 7 thématiques de recherche , compétences control épigénétique système nerveux neurodeveloppement 8 7 Ingénierie cellulaire et micro tissulaire cellules souches targeted drug delivery , drug design, vectorisation non virale imagerie (RMN, IRM, micro imagerie vibrationnelle, nanotechnologies , nouveaux agents de contraste …..) biomarkers et cibles therapeutique 5 3 6 microsystemes-microfluidique modèles in situ de cancer exosomes génomique fonctionnelle 2 Essais cliniques précoces Essais de médecine de précision Epidémiologie génétique micro environnement (immunitaire , fibroblaste, mitochondries, 9 microtubules , vasculaire , cellule épithéliale, angiogenèse , stroma resistence 4 metastase 4 immunothérapie modélisation mecanotransduction gène suppresseur de tumeur (wint) réseaux d'interactions cellulaires microbiote biologie des systèmes métabolisme Les tumeurs concernées 1 12 4 2 3 4 2 2 foie lymphome sein hemato SNC poumon pancréas ovaire Toutes les thématiques nécessaires pour répondre à l’aap sont représentées CEA CHRU CNRS CPU INRA INRIA INSERM INSTITUT PASTEUR IRD 8 Votre spécialité(ex: biologiste, mathématicien, etc 80 71 70 60 50 • un excès de biologiste, • un manque de mathématicien, clinicien, bioinformaticien 40 30 20 10 7 8 5 2 7 3 8 3 0 CEA CHRU CNRS CPU INRA INRIA INSERM INSTITUT PASTEUR IRD 9 40 besoins en compétences complémentaires pour mener un projet dans le contexte multidisciplinaire 35 35 30 25 20 26 20 13 15 10 9 10 5 1 5 2 6 3 1 0 Des besoins en informaticiens mathématiciens cliniciens supérieurs à l’existant dans la communauté ayant renseigné le questionnaire cellulaire , animaux, préclinique , xénogreffe interaction moléculaire, interaction cellulaire, immunologiste analyse d'image , logiciel , réseaux moléculaires CEA CHRU CNRS CPU INRA INRIA INSERM INSTITUT PASTEUR IRD 10 Comparaison des compétences et des besoins de compétences complémentaires 80 competences 71 70 60 competences complementaires Inadéquation entre compétences et besoins en compétences complémentaires 50 40 35 • Il manque des mathématiciens des bio informaticiens et des cliniciens. • Faire appel à d’autres mathématiciens (INRIA? ) et cliniciens (recensés à l’INCA? ) 26 30 20 20 10 13 7 2 8 10 9 5 3 31 5 2 5 6 8 3 1 0 CEA CHRU CNRS CPU INRA INRIA INSERM INSTITUT PASTEUR IRD 11 tutelles d'appartenance Centre anticancéreux EPST EPIC CRCT CRCM, IPC IGR IGBMC CHU, APHP CHU Grenoble Claudius Regaud Jacques Monod IRCAN IRCM IGMM ICO Paul Papin CURIE COCHIN CEA INSERM CNRS INRA UNSA INRIA Agrobiotech CEA CHRU CNRS CPU INRA Université : Toulouse Rennes Aix Marseille Lille Nice Auvergne Caen Poitiers Diderot Descartes Lyon Montpellier Nantes Bordeaux Bourgogne Grenoble Rouen Paris sud UPMC INRIA INSERM INSTITUT PASTEUR IRD 12 WP1 Multidisciplinary ProgramS Pathology Isolated teams Immunology WP 4 Cell Biology Governance, Education OMICS Mecanno Biology Systems Biology Network 2 Network 1 Translational oncology Invivo/exvivo modeling WP2 Knowledge/Knowhow sharing WP3 Resources sharing PLAN CANCER SAB CEA CHRU CNRS CPU INRA INRIA INSERM INSTITUT PASTEUR IRD 13 Calandrier suite • Decembre 2015: ouverture application (Lettre d’Intention) • Fevrier 2016 :deadline depôt (LI) • Financé par le “Plan Cancer”, 7-10 million €/an (aap epigenetique, bilogie des systemes, volet “cellulaire” de l’aap maths physique • Mars 2016 : selection des projets par un conseil scientifique (CS) multidisciplinaire international et recommendations pour optimiser les projets • Avril 2016: deadline depot de project complet • Juillet 2016: eval CS • Gestion INSERM • Septembre 2016: publication des résultats CEA CHRU CNRS CPU INRA INRIA INSERM INSTITUT PASTEUR IRD 14 • L’exploration des interactions bidirectionnelles des cellules tumorales et de leur microenvironnement tumoral susceptibles de freiner ou favoriser la progression tumorale ; • La reprogrammation du microenvironnement tumoral, notamment les cellules mésenchymateuses, endothéliales et les cellules immunitaires; • L’influence de microbiote sur l’architecture du stroma tumoral ; • Les mécanismes intégrés aboutissant à la transition épithéliomésenchymateuse (EMT like) et la transition inverse mésenchymoépithéliale (MET like) • La modélisation des voies de signalisation impliquées dans les échanges bidirectionnels entre les cellules tumorales et le microenvironnement ; • La modélisation de l’hétérogénéité de la tumeur à partir de données in vivo ou de modèles 3D, dans la contrainte du microenvironnement de la tumeur primaire et/ou des métastases ; • Le développement de méthodes prédisant l'efficacité, la résistance au traitement ou la récidive de la tumeur selon le degré d’interaction de la tumeur dans son microenvironnement • L’Évaluation des traitements (combinaisons, de nouvelles stratégies, schéma d'administration) ciblant les événements somatiques sousclonale de la ou son microenvironnement CEAtumeurCHRU CNRS CPU INRA INRIA • traiter les sujets de façon intégrée, • avec une masse critique en termes de ressources et de compétences • et de nature interdisciplinaire INSERM INSTITUT PASTEUR IRD 15 CEA CHRU CNRS CPU INRA INRIA INSERM INSTITUT PASTEUR IRD 16 Call for Proposals 2016 Biology and Basic Sciences for Cancer Research: PLBIO launched to: • enable the completion of original projects; • strengthen multidisciplinary collaborations; • develop research in emerging areas; • support young and talented investigators. • • • functional validation of signalling pathways identified in sequencing programs ; studies on the genesis, control and tumour escape to strengthen primary and tertiary prevention (tumour microenvironment, metabolic alterations, immunology, inflammation and infection) molecular characterisation of behavioural and environmental risks on the occurrence and progression of tumours (molecular epidemiology, toxicology, development of experimental models of analysis, etc.). CEA CHRU CNRS CPU INRA INRIA INSERM INSTITUT PASTEUR IRD 17 Session 2007 2008 2009 2010 2011 2012 2013 2014 2015 TOTAL Funding (in €M) 14,4 13,5 13,5 20,8 14,4 15,9 15,1 19,9 17,2 144,7 106 145 342 241 203 191 208 284 267 1987 40 30 27 43 30 32 33 38 34 307 37,70 % 20,70 % 7,90 % 17,80 % 14,78 % 16,75 % 15,80 % 13,40 % 12,73% 15,45% Results : Submitted proposals Selected projects Selection rate CEA CHRU CNRS CPU INRA INRIA INSERM INSTITUT PASTEUR IRD 18 CEA CHRU CNRS CPU INRA INRIA INSERM INSTITUT PASTEUR IRD 19 Call for proposals 2016 « Program for Translational Cancer Research » a link, an interface between basic and clinical fields. Two (2) co-funding partners: INCa + Ministry of Health (DGOS) • patient-oriented and focused on immediate application or in the course of further developments scientific research aiming at validating an initial hypothesis by answering to a specific, clearly defined question, using appropriate methodological tools. • must create a real multidisciplinary approach involving coordination between the different teams • must bring together, as a minimum, a basic or pre-clinical research scientific team and a hospital clinical team (inclusion of a team expert in methodology, biostatistics or bioinformatics is CEA CHRU CNRS CPU INRA INRIA INSERM INSTITUT PASTEUR IRD recommended) 20 Call for Translational research Year Submitted proposals Successful proposals Funding (M€) Selection rate (%) 2007 56 14 3,7 25,0% 2009 147 24 9,8 16,3% 2010 83 16 6,5 19,3% 2011 118 12 5,1 10,2% 2012 163 26 8,9 16,0% 2013 163 20 8,8 12,3% 2014 138 16 8,5 11,6% Total 868 128 51,5 14,7% CEA CHRU CNRS CPU INRA INRIA INSERM INSTITUT PASTEUR IRD 21 Focus cancer pédiatrique : axe majeur du plan cancer , coordonné Réalisé • Reconnaissance d’un groupe coopérateur cancer de l’enfant • Création de 6 clips (financement arc et ligue) • A venir en 2016 • Mise en place d’un essai (« smart » suite phrc « mappyacts »): concerne les tumeurs à la rechute (100 tumeurs par an sur 3 an) • Dans le cadre d’Accès : essai (phase exploratoire) de molécules de labo pharma sur anomalies (arc complète phrc ) • Immunothérapie si pas d’anomalies • Programme d’action intégrée de recherche transla (PAIR) : 5M CEA CHRU CNRS CPU INRA INRIA INSERM INSTITUT PASTEUR IRD 22 CEA CHRU CNRS CPU INRA INRIA INSERM INSTITUT PASTEUR IRD 23
