COMPÉTENCES SONIA GIUBERGIA PhD Microbiologiste, R&D Bilingue Anglais et Italien Français intermédiaire (B1) 29 ans Permis de conduire B 06 07 91 91 90 [email protected] 9 rue Philippeville, 69004 Lyon fr.linkedin.com/in/sonia-giubergia orcid.org/0000-0002-7376-7486 OBJECTIF PROFESSIONNEL Mettre à profit mon expérience dans la recherche en microbiologie et mes compétences dans les domaines de la gestion de projet dans un poste d’ingénieur de recherche, contribuant à la croissance de l’entreprise. Disponible immédiatement sur la région lyonnaise. INTERETS Backpacking, cuisine italienne, DIY (couture, bricolage), concerts de musique rock, reggae et traditionelle, cirque contemporain, yoga REFERENCES Prof. Lone Gram DTU Bioengineering • Université Technique du Danemark [email protected] +45 45 25 25 86 Ass. Prof. Kristian Fog Nielsen Plateforme de métabolomique microbienne • DTU Bioengineering • Université Technique du Danemark [email protected] +45 45 25 26 02 Techniques •Developper des protocoles experimentaux •Traiter et analyser des données •Analyser et resoudre des problèmes •Travailler en conformité avec les lignes directrices des autorités réglementaires •Microbiologie traditionnelle: developpement de milieux de culture, culture bacteriénne, tests phénotypiques, Biolog, API •Disciplines modernes: logiciel “CLC genomics workbench”, génomique (purification de l’ADN, assemblage et annotation des génomes, analyse des données, multi locus sequence analysis, analyse phylogénetique), transcriptomique (purification de l’ARN, Bioanalyzer, analyse des données), protéomique (purification des protéines, SDS-page, zymogrammes, préparation d’échantillons pour LC-MS/MS), métabolomique (extraction des cultures pour HPLC-MS, fractionnement des extracts, analyse des données) •Préparation d’échantillons pour microscopie électronique à balayage Gestion de projet •Planifier, organiser et piloter le travail •Prendre des initiatives et des décisions - sens des responsabilités •Respecter les contraintes de temps et de qualité •Travailler indépendamment et en équipe dans des environnements multiculturels et internationaux (5 ans de travail à l’étranger) Management •Enseigner aux autres •Encadrer des étudiants (supervision de 2 étudiants en thèse Bac+3 et 4 étudiants en projet spécial) •Organiser et evaluer le travail Communication •Interagir avec l’équipe technique •Presenter à l’oral, à la fois pour un public spécialiste et non spécialiste (participation à conférences internationales et festivals des sciences) •Rédiger documentations techniques (auteur principal de 3 articles de recherche et un chapitre de livre) EXPERIENCES PROFESSIONNELLES 2013-2016 Chercheuse en microbiologie • Novo Nordisk Foundation Centre for Bio-sustainability • Université Technique du Danemark, Danemark •developpement de procedures experimentelles pour la découverte de composés bioactifs d’origine bactérienne •caractérisation de nouvelles espèces bactériennes 2011 Assistante de recherche • Helmholtz Centre for Infection Research, Braunschweig, Allemagne •étude des mécanismes impliqués dans la virulence des bactéries isolées de produits laitiers 2010 Assistante en assurance qualité • Marco Antonetto Farmaceutici, Turin, Italie •exécution des analyses microbiologiques et physico-chimiques sur les matières premières et sur les produits finis (lignes directrices de la pharmacopée italienne) FORMATION 2013-2016 Doctorat en Microbiologie • Novo Nordisk Foundation Centre for Biosustainability • Université Technique du Danemark, Danemark Projet: “Marine Vibrionaceae as a reservoir for bioprospecting and ecology studies”. Titulaire d’une bourse de recherche “Marie Curie” de l’Union Européenne 2009-2011 M.Sc. en Biotechnologie Industrielle • Université de Turin, Italie 2006-2009 B.Sc. en Biotechnologie • Université de Turin, Italie FORMATION SUPPLÉMENTAIRE 2014 Analytical Microbial Natural Product Chemistry • Département de bio-ingénierie • Université Technique du Danemark, Danemark 2013-2014 Bio-business and Innovation Platform • Copenhagen Business School, Danemark 2013 Introduction to Community Systems Microbiology • Département de biotechnologie, chemie et génie enviromental • Université d’Aalborg, Danemark LISTE DES PUBLICATIONS ARTICLES DE RECHERCHE •Giubergia S., Phippen C., Nielsen K.F. et Gram L., 2017. Growth on chitin impacts the transcriptome and metabolite profiles of antibiotic producing Vibrio coralliilyticus S2052 and Photobacterium galatheae S2753. mSystems 2 (1) e00141-16 doi: 10.1128/mSystems.00141-16 •Giubergia S., Schleissner C., de la Calle F., Pretsch A., Pretsch D., Gram L. et Schmidt Thøgersen M., 2016. Screening microorganisms for bioactive compounds. Chapitre du livre “The marine microbiome - an untapped source of biodiversity and biotechnological potential”. Springer international Publishing Switzerland doi: 10.1007/978-3-319-33000-6_13 •Giubergia S., Phippen C., Gotfredsen C.H., Nielsen K.F. et Gram L., 2016. Influence of niche-specific nutrients on secondary metabolism in Vibrionaceae. Applied and Environmental Microbiology 82(13): 4035-4044 doi: 10.1128/AEM.00730-16 •Giubergia S., Machado H., Mateiu R.V. et Gram L., 2016. Vibrio galatheae sp. nov., a member of the family Vibrionaceae isolated from a mussel. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 66: 347-352 doi: 10.1099/ijsem.0.000723 •Machado H., Giubergia S., Mateiu R.V. et Gram L., 2015. Photobacterium galatheae sp. nov., a bioactive bacterium isolated from a mussel in the Solomon Sea. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 65: 4503-4507 doi: 10.1099/ijsem.0.000603 •Pessione A., Lamberti C., Cocolin L., Campolongo S., Grunau A., Giubergia S., Eberl L., Riedel K. et Pessione E., 2012. Different protein expression profiles in cheese and clinical isolates of Enterococcus faecalis revealed by proteomic analysis. Proteomics 12 (3): 431-447 doi: 10.1002/pmic.201100468 POSTERS ET CONTRIBUTIONS ORALES •Giubergia S., Phippen C., Nielsen K.F. et Gram L. On the antibacterial properties and genome mining of Vibrio strains. Présentation orale. International Conference on Microbial Communication. 13-16 avril 2015, Jena, Allemagne •Giubergia S., Phippen C., Nielsen K.F. et Gram L. Importance of substrate in bio-prospect screening strategies for marine bacteria. Poster. International Conference on Natural Product Biotechnology. 18-20 novembre 2014, Inverness, Royame-Uni •Giubergia S., Månsson M., Møller K.A., Dorrestein P.C. et Gram L. Secondary metabolite production of Photobacterium halotolerans is influenced by co-culture with Pseudoalteromonas ruthenica. Présentation orale. Congress of the Danish Microbiology Society. 18 novembre 2013, Copenhague, Danemark •Månsson M., Giubergia S., Møller K.A., Dorrestein P.C. et Gram L. Influence of natural substrates and co-occurring bacteria on the production of secondary metabolites by Photobacterium halotolerans. Poster. 8th European Congress on Marine Natural Products. 15-20 septembre 2013, La Toja, Galicia, Espagne