1. Les variations génétiques 1.1 Les mutations chromosomiques 1.2

1
Génétique PCEM 2006
Thomas Bourgeron
Cours N°1
Les variations génétiques
et la relation génotype /phénotype
Cours N°2
La ségrégation et l’identification
des gènes des maladies
Programme PCEM 2006
1. Les variations génétiques Définitions:
Allèle: Séquence différente
d’un même gène A (a1, a2,…an)
Génotype:
Homozygote: Même allèle sur les
deux chromosomes a1/a1
Hétérozygote: Des allèles
différents sur les deux
chromosomes a1/a2
Phénotype: Apparence
(expression physiologique
dépendante des gènes et de
l’environnement)
Johannsen, Bateson
(début du XXème siècle)
Définition!
Pour le scientifique:
Mutation: changement par rapport à la séquence de référence
Polymorphisme: variation de la séquence d’un gène dans la
population
Pour le médecin:
Mutation: variation rare impliquée dans la maladie
Polymorphisme: variation fréquente qui n'est pas impliquée dans la
maladie
Les variants rares ne sont pas toujours délétères !
Les polymorphismes fréquents ne sont pas toujours sans
conséquence biologique (variants de susceptibilité) !
1.1 Les mutations chromosomiques
1.2 Les mutations géniques
1.3 Mutations somatiques et
germinales
1.4 La variabilité génétique dans les
populations
2
1.1 Mutations chromosomiques
Anomalies du nombre de chromosome (aneuploïdie)
Altération de la structure des chromosomes
(remaniements chromosomiques)
Euploïdie
46, XX 46, XY
1.1.1 Anomalies du nombre de
chromosomes :aneuploïdie
3
Trisomie Avortements spontanés Naissances
1-3 1,4% 0
4-5 0,6% 0
6-12 3,7% 0
13-15 4,8% 0,02%
16-18 9,8% 0,02%
19-20 0,4% 0
21-22 5,2% 0,13%
Chromosomes sexuels
XYY 0,03% 0,05%
XXY 0,03% 0,05%
XO 9,0% 0,009%
XXX 0,14% 0,05%
Polyploidie:
Triploid 8,5% 0
Tetraploid 9,7% 0
Total: 46,5% 0,34%
1.1.2 Anomalie de la structure
des chromosomes (remaniements
chromosomiques)
Chromosome en anneau
Délétions chromosomiques Duplications chromosomiques
Insertions chromosomiques Translocations chromosomiques
4
1.1 Les mutations chromosomiques
1.2 Les mutations géniques
2.3 Mutations somatiques et
germinales
Mutation faux sens
TGG TCC AUG GCA TTC TAT
Met ala phe tyr …..
TGG TCC AUG GCA TAC TAT
Met ala Tyr tyr …..
TGGTCCAUGGCATTC……….
Mutation non sens
TGG TCC AUG GCA TTC TAT
Met ala phe tyr …..
TGG TCC AUG GCA TTC TAA
Met ala phe stop
TGG TCC AUG GCA TTC
Met ala phe
TGG TCC AUG GCA TTC
Met ala phe
T
TGG TCC AUG TGC ATT C
Met Cys ile
Insertion/Délétion
Mutations par amplification de triplet Répétition CAG (Huntington)
Anticipation
__Patient___ Répétitions Age du début
Grand père 42 57 ans
Père 56 35 ans
Fils 87 23 ans
Control Pré-mutations Atteints
4 to 35 31 to 38 40 to 100
5
Répétition de trinucléotides dans le
syndrome de l'X fragile 1.3 Mutations somatiques et germinales
1.4 La variabilité génétique dans les
populations humaines
1.4.1 La PCR
1.4.2 Les SNPs
1.4.3 Les microsatellites
1.4.1 La PCR
http://allserv.rug.ac.be/~avierstr/principles/pcr.html
Polyrisation / dénaturation
X 35
cycles
Polyrisation / dénaturation
Polyrisation / dénaturation
Polyrisation / dénaturation
Polyrisation / dénaturation
Polyrisation / dénaturation
Polyrisation / dénaturation
Polyrisation / dénaturation
Polyrisation / dénaturation
Polyrisation / dénaturation
Polyrisation / dénaturation
Polyrisation / dénaturation
Polyrisation / dénaturation
Polyrisation / dénaturation
Polyrisation / dénaturation
Polyrisation / dénaturation
Polyrisation / dénaturation
Polyrisation / dénaturation
Polyrisation / dénaturation
Polyrisation / dénaturation
Kary Mullis, Nobel 1993
1 cellule: 2 copies du gène
2 ->4 -> 8 -> 16 -> 32 -> 64 -> 128 -> ->
2 copies X 235= 68 719 476 736 copies
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