escherichia coli - BEEP-IRD

UNIVERSITE CHEIKH ANTA DIOP DE DAKAR
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FACULTE DE SCIENCES
ET TECHNIQUES
ECOLE INTER-ETATS DES SCIENCES
ET MEDECINE VETERINAIRE
Année 2006 N°06
SURVEILLANCE DE LA RESISTANCE AUX ANTIBIOTIQUES
DES SOUCHES DE SALMONELLA SPP
ET ESCHERICHIA COLI ISOLEES DE LA VIANDE
DE POULET DE CHAIR AU SENEGAL
MEMOIRE DE
DIPLOME D’ETUDES APPROFONDIES
DE PRODUCTIONS ANIMALES
Présenté et soutenu publiquement le 27 juillet 2006
à 10 heures à l’EISMV
Par
Khar Coumba Ndoffène DIOUF
Né le 28 Juillet 1978 à Kaolack (Sénégal)
MEMBRES DU JURY
PRESIDENT M. Louis Joseph PANGUI Professeur à l’EISMV
MEMBRE M. Bhen Sikina TOGUEBAYE Professeur à la FST
CO-DIRECTEUR DE MEMOIRE M. Malang SEYDI
Professeur à l’EISMV
DIRECTRICE DE MEMOIRE Mme Rianatou Bada ALAMBEDJI
Maître de conférences agrégé à l’EISMV

DEDICACES
Je dédie ce mémoire
- Cheikh Ahmadou Bamba qui est un bienfait accordé par Dieu à tous les Hommes
- Cheikh Abdou Khadre Mbacké : on pleure à juste titre des seigneurs défunts que
pleure la terre comme les cieux
- Cheikh Saliou Mbacké santé et longue vie
- Sérigne Abdou Samade, un miracle de Serigne Touba. Santé et longue vie.
- Mes grands parents (In Mémorium) que la paix et la satisfaction d’Allah soient sur
vous
- Mon père (In Mémorium) aucune expression ne pourrait être assez belle pour
traduire notre grand Amour. Que le bon Dieu vous accorde son Paradis. Amen !
- Ma mère Bamby Diouf vous ne ménagiez aucun effort pour nous voir réussir.
Trouvez ici la concrétisation de vos efforts, l’expression de notre éternelle et
profonde gratitude.
- Adama Mbodj, papa Diène, Mamour Diouf, Diala Samakhé et Tening Ndour. Vous
avez toujours été à mes côtés pendant les moments difficiles pour me porter du
réconfort. Vous nous avez traité comme vos propres enfants.
- Mon oncle Hamadou Diouf votre générosité, votre sens de l’humanité et votre
hauteur d’âme font de vous un grand homme. Plus qu’un oncle, vous êtes un père
pour moi.
- Mon frère Ibrahima Diène, recevez ici ma profonde reconnaissance
- Mes frères et sœurs : Adama, Modou et Ibou, trouvez dans ce travail le fruit d’une
longue collaboration
- Mes cousins et cousines, vous m’avez toujours traité avec considération tous mes
respects.

REMERCIEMENTS
Je voudrais par ces remerciements manifester ma gratitude et mes reconnaissances à
tous ceux qui de près ou de loin ont contribué à la réussite de ce modeste travail.
- L’EISMV pour avoir financé ce travail
- Monsieur Sène, technicien au laboratoire de MIPI, pour sa gentillesse et sa
disponibilité
- Tout le personnel du laboratoire d’HIDAOA, à madame Dièye, madame Mar,
Nalla Bâ, Amadou Lamine Koné, Dr Sylla et Dr Musabyemarya
- Tout le personnel du laboratoire de bactériologie médicale de l’Institut Pasteur
de Dakar, Fatou Kiné Loum, Rokhaya, Rougui, Yamilé, Assane Djiby,
Madame Sankharé et Yves.
- Dr Garin, chef du laboratoire de la biologie médicale de l’Institut Pasteur de
Dakar, pour son dynamisme et sa gentillesse
- Tous les enseignants du DEA de Productions Animales
- Madame Mariam Diouf, documentaliste à l’EISMV
- Aïssatou Fofana, je ne regrette pas de t’avoir connu
- Toute la quatrième promotion du DEA-PA, particulièrement, à Ousmane
DIATTA toute ma fidélité.
A NOS MAITRES ET JUGES
A NOTRE MAITRE ET PRESIDENT DE JURY

LE PROFESSEUR LOUIS JOSEPH PANGUI
Votre culture diversifiée et votre large expérience ne vous ont pas empêché de rester
l’homme simple, ouvert et tolérant.
Soyez assuré de notre profonde gratitude.
A NOTRE MAITRE ET JUGE
LE PROFESSEUR BHEN SIKINA TOGUEBAYE
Malgré vos multiples préoccupations, vous nous avez fait l’honneur d’accepter de
rehausser de votre présence la soutenance de ce mémoire.
La présence d’une personnalité de renommée internationale est pour nous un
privilège exceptionnel.
Soyez assuré de notre profonde reconnaissance.
A NOTRE MAITRE ET CO-DIRECTEUR DE MEMOIRE
LE PROFESSEUR MALANG SEYDI
La clarté de votre enseignement, votre constante disponibilité, votre sympathie
doublée de compétence nous ont séduit.
Soyez assuré, cher maître, l’expression de notre grande admiration.
A NOTRE MAITRE ET DIRECTRICE DE MEMOIRE LE MAITRE DE
CONFERENCES AGREGE
MADAME RIANATOU BADA ALAMBEDJI.
La chance que vous nous avez donnée en nous confiant ce travail nous a permis de
découvrir une personnalité dont la gentillesse, la simplicité et la passion pour sa
discipline n’ont d’égales que la rigueur. Soyez assuré, cher Maître, l’expression de
notre grande admiration et de reconnaissance.

TABLE DES MATIERES
INTRODUCTION…………………………………………………..…………….1
PREMIERE PARTIE : SYNTHESE BIBLIOGRAPHIQUE.
Chapitre I : Panorama de la production de poulets de chair au Sénégal….….2
I-1 : Systèmes de production avicole………………………………………...2
I-2 : Niveau de production et de consommation de la viande de volailles…..3
I-3 : Contraintes pathologiques………………………………………...…….3
I-3-1 prophylaxie sanitaire…………………………………………….3
I-3-2 prophylaxie médicale……………………………………………3
Chapitre II : Utilisation des antibiotiques dans les élevages avicoles……….….4
II-1- Définition et Généralités………………………………………….…….4
II-2- Types d’utilisation des antibiotiques en aviculture………………….…4
II-3- Conséquences……………………………………………………..……5
Chapitre III : Résistance bactérienne aux antibiotiques et conséquences……..6
III-1 Généralités sur l’antibiorésistance………………………………...……6
III-1-1- Résistance par acquisition de plasmides……………………...7
III-1-2-Résistance par acquisition de transposons et d' intégrons…….7
III-2- Épidémiologie et évolution de l’antibiorésistance…………………….7
III-2-1- Evolution de l'antibiorésistance chez les Escherichia coli……8
III-2-2- Évolution de l'antibiorésistance chez les salmonelles………...8
III-3 Conséquences…………………………………………………………...9
DEUXIEME PARTIE : ETUDE EXPERIMENTALE
Chapitre I : Matériel et Méthodes ………………………………………….…..10
1-Matériel ………………………………………………………………………...10
1-1 Cadre d’étude……………………………………………………….….10
1-2 Matériel de prélèvements…………………………………………….....10
1-3 Matériel de laboratoire………………………………………………….10
2- Méthodes d’analyse…………………………………………………………….11
2-1 Echantillonnage ……………………………………………………..…11
2-2 Prélèvements et enquête…………………...……………………………11
2-3 Analyses microbiologiques…………………………………...………...11