Différentes souces de l`acétyl CoA

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Energétique cellulaire
B- Différentes sources de lʼacétyl-CoA
Glucides
Lipides
Protéines
Digestion et absorption
Glucides simples
(surtout glucose)
Acides gras
+ glycérol
Acides aminés
Pyruvate
Acétyl-CoA
Chaî
Chaîne respiratoire
Cycle de
l’acide
citrique
xH
yATP
2 CO2
Acétyl CoA est la forme activé de l'acétate.
C'est un carrefour métabolique.
Pour le glucose, on a une étape intermédiaire par le pyruvate.
A partir des lipides, dégradation des acides gras qui donnent de l'acetylCoA
protéines, par dégradation donnent des acides aminés, normalement ce ne sont pas
AcLes
pyruvique
SH
des sources d'énergie. On aE2-L
une
dégradationHSCoA
des protéines lorsque on a une régime hyper
CH3-CO-COOH
TDP-E1
S~ CO CH3
protéique, ou quand
on fait un jeun.
L'acetylCoA est dégradé dans un cycle: cycle de Krebs pour former des composés qui
c
a
vont rejoindre
la chainebrespiratoire.
"
I- Décarboxylation oxydative du pyruvate en
acétylCoA
CH -C ~ SCoA
CO2
CH3-CHOH-TDP
S
E2-L
SH
E2-L
3
O
H
E1
Lʼacétyl-CoA nʼest produit
queS dans la Smitochondrie
: Nécessité pour le pyruvate dʼetre
Réaction trè
très complexe
Acé
Acétyltyl-CoA
transporté
du cytoplasme
vers lad mitochondrie
: transporteur spécifique MCT.
avec de multiples
étapes
Complexe
de
la
pyruvate
deshydrogénase
:
3
protéines
enzymatiques et 5 coenzymes :
a) Réaction de dé
décarboxylation
E3-FAD
E3-FADH2
(Thiamine diphosphate)
b)- E1-TDF
Réaction d’
d’oxydation
c) - Formation
de l ’acé
CoA
acétyltyl-(Acide
E2-Lipoamide
lipoique lié
à
lʼenzyme)
e
d) Réoxydation de la dihydrolipoamide
NAD+
E3-FAD
NADH + H+
e) - Transfert
des e- sur NAD+
Ainsi que le NAD+ et le HS-CoA (à lʼétat libre)
! Réaction irré
irréversible repré
représentant le lien entre la glycolyse et le cycle de Krebs
1
Ac pyruvique
SH
CH3-CO-COOH
E2-L
TDP-E1
CO2
CH3-CHOH-TDP
Réaction trè
très complexe
avec de multiples étapes
a)
b)
c)
d)
e)
c
b
a
HSCoA
S~ CO CH3
S
E2-L
E1
SH
E2-L
S
CH3-C ~ SCoA
O
SH
d
Acé
Acétyltyl-CoA
Réaction de dé
décarboxylation
E3-FAD
E3-FADH2
Réaction d’
d’oxydation
Formation de l ’acé
acétyltyl-CoA
e
Réoxydation de la dihydrolipoamide
NAD+
NADH + H+
Transfert des e- sur NAD+
! Réaction irré
irréversible repré
représentant le lien entre la glycolyse et le cycle de Krebs
On a le pyruvate, première réaction de décarboxylation: transfert du radical dicarboné sur
le complexe E1-TDP.
1
Libération de CO2.
Réaction d'oxydation, qui fait intervenir transfert de l'unité dicarboné sur l'acide lipoïque.
(qui devient sous forme réduite).
L'unité dicarbonée devient un acétyl.
Transfert de l'actyl sur le Coenzyme A. on conserve cette liaison a haut potentiel
d'hydrolyse, et on libère E2 lipoamide sous forme réduite. L'acetylCoA est libérée, il faut
ensuite ré-oxyder la lipoamide, au dépend du FAD lié a E3: on régénère le complexe E2.
Enfin, transfert des électrons sur le NAD+: fourniture de NADH + H+
Cette réaction a deux intérêts:
➔ " formation de NADH, composé réduit qui va permettre de former de l'ATP sur la chaine
respiratoire.
➔ " Formation d'un groupement acéthyl sous forme activé (acetyl CoA) qui pourra être
transféré, et qui va rentrer dans le cycle de krebs.
II- Béta oxydation des acides gras
II1- !Introduction
-Oxydation des
acides gras
en acé
étylac
tyl-CoA
: sources
des
acides
gras
Introduction: source des acides gras
II - !-Oxydation des acides gras en ac
O
O
R2
C
CH2
O
O
C
O
C
CH
CH2
R1
3 H2O
CH2OH
CHOH
O
R3
Triglycé
Triglycéride ou TG
1°- Activation sous forme d’acyl-CoA
+ 3 AG
CH2OH
Glycé
Glycérol
2°- Transfert des A. gras du cytosol d
3°- Oxydation proprement dite
•TG
exogè
exogènesgras proviennent des tryglycérides d'origine exogène ou endogène
les
acides
- Emulsification par les sels biliaires
- lipase pancré
pancréatique
- lipoproté
lipase des capillaires
sanguins
lipoprot
pour
leséinetriglycérides
endogène,
on a une emulsification dans l'intestin par les sels biliaire
puis
pancréatique qui libère des acides gras et du glycérol
* TGlipase
endogè
endogènes
- triglycé
éride lipase
-sensible
tissu adipeux
triglyc
hormono
TG
+ 3H2O
=hormonoglycérol
+ du
3AG
(activation par adré
adrénaline et glucagon par la cascade de l’
l’AMPc)
AMPc)
+ lipoprotéine
lipase
des capillaires sanguins.
Exemple d’
d’un ac gras à longue chaî
chaîne: C16:0 (acide palmitique)
•TG exogè
exogènes
- Emulsification par les sels biliaires
- lipase pancré
pancréatique
II --lipoproté
! -Oxydation
descapillaires
acides sanguins
gras en acé
acétyltyl-CoA
éine lipase des
lipoprot
Introduction: source des acides gras
* TG endogè
endogènes
II - ! -Oxydation des acides gras en acé
acéty
O
- triglycé
triglycéride lipase hormonohormono-sensible du tissu adipeux
CHla
(activation
par
cascade de l’
adr
l’AMPc)
AMPc)
Triglycérides
endogènes
Ré1naline3etHglucagon
C adré
O
2OH
CH2 O par
O
2
R2
1°- Activation sous forme d’acyl-CoA
CHOH
tissus
C O adipeux
CH
O
+ 3 AG
2°- Transfert
des A. gras du cytosol dans
mobilisés
par la tryglycéride lipase,
par le glucagon
dan
CH OH hormono sensible car elle est activé
CH O C R
ou l'AMPc.
Glycé
Glycérol
2
3
2
Triglycé
Triglycéride ou TG
Exemple d’
d’un ac gras à longue chaî
chaîne: C16:0 (acide palmitique)
Activation
sous forme dʼacyl-CoA
•TG 2exogè
ènes
exog
- Emulsification
par les sels sous
biliairesforme
1°- Activation
d’acyl-CoA
- lipase pancré
pancréatique
HS-CoA
- lipoproté
lipoprotéine
O lipase des capillaires sanguins
O
R C
+ ATP
* TG endogè
endog
O- ènes
R
3°- Oxydation proprement dite
II - ! -Oxydation des acides gras en ac
O
C
R
C
S-CoA
+ AMP
AMP
2 Pi -sensible du tissu adipeux
- triglycé
triglycéride lipase hormonohormono
AcylCoA
Acyl-de
(activation
par adré
glucagon
l’
adrénaline
l’AMPc)
AMPc)
Acyl-adé
énylate par la cascade
Acylet
ad
Acide
gras
Enzyme: AcylAcyl-CoA synthé
synthétase (ME de la mitochondrie)
1°- Activation sous forme d’acyl-CoA
2°- Transfert des A. gras du cytosol da
d
3°- Oxydation proprement dite
Réaction
d'activation de l'acylCoA qui demande de l'énergie, intervention de l'ATP et du
Réaction globale :
coenzyme A.
pour former le RCOAMP, au dépend de
II - ! -Oxydation des acides gras en acé
acéty
1°- Activation
forme d’acyl-CoA
l'AMP
qui estsous
hydrolysé
sous forme de pyrophosphate.
! L’équivalent
ADP sont O
consommé
’équivalent de 2 ATP en
consommés
HS-CoA
Le composé
RCOAMP
(composé
intermédiaire)
,
récupère
le coenzyme A qui remplace
O
O
C
C
R l'AMP,
R C S-CoA + AMP
1°- Activation sous forme d’acyl-CoA
+ ATP
on
obtientRl'acyl-CoA.
AMP
O2 Pi d'acy-CoA.
Puis formation
AcylAcyl-CoA
2°- Transfert
dan
Acyladé
Acyl-synthétase,
adénylate
Acide gras
Enzyme:
acyl-CoA
qui
est au niveau de la membrane externe
de la des A. gras du cytosol dans
mitochondrie.
Enzyme: AcylAcyl-CoA synthé
synthétase (ME de la mitochondrie)
ExempleAc.
d’
ac+gras
longue
chaî
d.’un
chaîne: C16:0
gras
HS+ ATP
acyl-CoA +palmitique)
+ 2Pi
Ac
HS-àCoA
acyl(acide
Activation:
condensation
de l'AMP
surAMP
l'acide
gras,
3°- Oxydation proprement dite
Réaction globale :
Ac.
Ac. gras + HSHS-CoA + ATP
acylacyl-CoA + AMP + 2Pi
! L’équivalent
’équivalent de 2 ATP en ADP sont consommé
consommés
On consomme une molécule d'ATP, formation d'une molécule d'AMP. On a deux Pi libérés.
On a besoin de deux liaisons a haut potentiels d'énergie: L'équivalent de deux molécules
d'ATP en ADP sont consommés.
II- Transfert des acides gras du cytosol dans la mitochondrie
Acide gras
3°- Oxydation proprement dite
CoA
ATP
MEMBRANE
EXTERNE
O
CYTOSOL
2Pi + AMP
a) R CH2 CH2 CH2 C
ACYL-CoA
SYNTHETASE
AcylAcyldeshydro
deshydr
FAD
Acyl-CoA
Acyl-carnitine HSCoA
FADH2
carnitine
CARNITINE
ACYL-CARNITINE
TRANSLOCASE
MEMBRANE
INTERNE
CARNITINE
ACYL-TRANSFERASE II (CATII)
H
Acyl-carnitine
carnitine
HSCoA
O
b) R CH2 C C C
2
MATRICE
MITOCHONDRIALE
Acy
CoA
S
CARNITINE
ACYL-TRANSFERASE I (CAT1)
1
H
S
" 2 -E
CoA
H2O
"2-En
hydr
hyd
Acyl-CoA
!-OXYDATION
Il faut transformé l'acyl-CoA.
Membrane externe: L'alcoran synthétase (car met en jeu l'ATP contrairement a une
synthase). Permet de transformer l'acide gras en AcylCoA. Ce dernier se retrouve dans
OH H
c)
R
CH2
C
3
H
C
2
O
C
1
S
CoA
L-3-OH-acyl-CoA
Classification des acides gras
H
NAD+
nom de l’acide gras
L-3-OHOH-acyl
nombre de
carbones
l'espace intermembranaire, Il n'est pas capable de traverser la membrane interne, il
s'associe à la carnitine, transfert de la carnitine sur l'acyl, qui donne de l'acyl carnitine
coenzyme A, puis est pris en charge par une translocase, elle se retrouve au niveau de la
matrice, libération de la carnitine par une carnitine aceyl tranferase.
1- Oxydation proprement dite
Suite de réactions, oxydation, hydratation, oxydation et réaction de clivage (thiolyse).
a- Oxydation qui porte sur le C2
Enzyme: acyl-CoA deshydrogénase + FAD (on récupère du FADH2)
3°- Oxydation proprement dite
double liaison entre le C2 et le C3
O
gras
a) R CH2 CH2 CHAcide
C S CoA
2
Acyl-CoA
3°- Oxydation proprement dite
CoA
ATP
AcylAcyl-CoA
deshydrogé
deshydrogénase
FAD
2Pi + AMP
ACYL-CoA FADH2
SYNTHETASE
MEMBRANE
EXTERNE
O
H
O
CYTOSOL
a) R CH2 CH2 CH2 C
AcylAcyl-CoA
deshydrogé
deshydrogén
FAD
"2-Enoyl-CoA
b) R CH2 C CAcyl-CoA
Enoyl
C S CoAAcyl-carnitine
HSCoA
2
H
1
FADH2
carnitine
H2O
CARNITINE
ACYL-CARNITINE
CARNITINE
"2-Enoyl-CoA
Enoyl
TRANSLOCASE
ACYL-TRANSFERASE II (CATII)
MEMBRANE
INTERNE
H
hydratase
MATRICE
MITOCHONDRIALE
Acyl-CoA
CoA
S
CARNITINE
ACYL-TRANSFERASE I (CAT1)
Acyl-carnitine
O
b) R CH2 C C C
2
1
S
"2-EnoylEnoyl-
CoA
H
HSCoA
b- Réaction d'hydratation au niveau de la double liaison, la composé formé qui est le L H3O
carnitine
OH acyl CoA.
Acyl-CoA
enzyme: delta2 Enoyl CoA hydratase
2
"2-EnoylEnoyl-C
hydratas
!-OXYDATION
c- Nouvelle
oxydation, portant sur le C3, formation de L 3 céto acyl CoA
Classification des acides gras saturés
enzyme:L 3 OH acyl CoA deshydrogénase avec NADH
nom de l’acide gras
OH H
O
CH2 C C C
c) Rbutyrique
Acide
3
2
1
Acide caproïque
H
Acide caprylique
Acide caprique
Acide laurique
nombre de
carbones
longueur de la
chaîne
CoA
4
L-3-OH-acyl-CoA
S
NAD+
Acide myristique
Acide palmitique
O
Acide sté
stéarique
Acide
d) arachidique
R CH C
2
Acide béhénique
Acide lignocérique
Acide cérotique
O
CH2
C
C
nom de l’acide gras
L-3-OH-acyl
OHmoyenne
CoACoA-deshydrogé
deshydrogénase
14
16
18
longue
S 20CoA
22
CoA-SH
24
26
3-cétoto-acylacyl-CoA
très longue
(3(3-cétoto-acylacyl-CoA) thiolase
O
O
R’
8
10
12
NADH + H+
S
CoA + CH3
AcylAcyl-CoA
(amputé
(amputé de 2 C)
C
Classification des acides gras sat
courte
6
H
S
CoA
Acé
Acétyltyl-CoA
nombre de
carbones
Acide butyrique
Acide caproïque
4
6
Acide caprylique
Acide caprique
Acide laurique
8
10
12
Acide myristique
Acide palmitique
Acide sté
stéarique
Acide arachidique
14
16
18
20
Acide béhénique
Acide lignocérique
Acide cérotique
22
24
26
3 molécules: l'acétyl CoA et
d- Puis clivage (thiolyse) avec une thiolase on récupère deux
l'acétyl-CoA amputé de deux C (= forme activé de l'acyl).
On fait une suite successive de cette suite de réaction.
Connaître l'acide palmitique (C16) et l'acide stéarique (C18)
A partir de ces acides gras, on a avoir une série de libération d'acetyl CoA
long
m
tr
Classification des acides gras saturés
nombre de
carbones
longueur de la
chaîne
Acide butyrique
Acide caproïque
4
6
courte
Acide caprylique
Acide caprique
Acide laurique
8
10
12
moyenne
Acide myristique
Acide palmitique
Acide sté
stéarique
Acide arachidique
14
16
18
20
longue
Acide béhénique
Acide lignocérique
Acide cérotique
22
24
26
très longue
nom de l’acide gras
Ex: 7 tours de spires pour un composé qui est un C16, on obtient 8 acétyl-CoA.
C16 (palmitoylpalmitoyl-CoA)
CoA)
3
Equation globale de la ! -oxyd
Acétyl-CoA
C14
Acétyl-CoA
Palmitoyl-CoA + 7 CoASH + 7 FAD + 7
C12
Acétyl-CoA
C10
Acétyl-CoA
8 Acétyl-CoA + 7 FADH2 + 7 N
C8
Acétyl-CoA
C6
Acétyl-CoA
C4
TOTAL:
7 tours de spire
Acétyl-CoA
Acé
Acétyltyl-CoA
Au niveau du C4(dernier tour): on obtient deux acetyl-CoA.
Pour le calcul énergétique: on va calculer le nombre de NADH et de FAD produit.
A chaque tour de spire un FAD et un NAD intervient.
globale
de la ! -oxydation
4°- Bilan éEquation
nergé
:
nergétique
Équation globale de la béta oxydation pour C16:
Bilan énergé
nergétique de la dé
dégradation d'une m
Pour chaque tour de spire :
Palmitoyl-CoA
+ 7 CoASH
+ 7 FAD + 7 NAD+ + 7 H2O
1 FADH2 et 1 NADH
+ H+
*A partir du palmitate (C16): 106 ATP
8 Acétyl-CoA + 7 FADH2 + 7 NADH + 7 H+
Activation
7 passages à travers la !-oxydation:
• 7 FADH2 + 7 NADH + 7 H+
• 8 acétyl-CoA dégradés dans cycle de Krebs et chaîne respiratoire
*A partir du sté
stéarate (C18): 120 ATP
Activation
8 passages à travers la !-oxydation:
• 8 FADH2 + 8 NADH + 8 H+
7 FAD
7 NAD
Isocitrate deshydrogénase
"-Cétoglutarate deshydrogénase
Succinyl-CoA synthétase
Succinate deshydrogénase
Malate deshydrogénase
8 NAD
8 NAD
–
8 FAD
8 NAD
TOTAL
Bilan énergé
nergétique de la dé
dégradation d'une molé
molécule de palmitate
Nombre de
NADH ou de
Activation du palmitate
Acyl-CoA deshydrogénase
!-OH-acyl-CoA deshydrogénase
!La respiration mitochondriale produit 1,5 AT
• 9 acétyl-CoA dégradés dans cycle de Krebs et chaîne respiratoire
Différentes étapes ou enzymes
Nombr
NADH o
FADH2 fo
Différentes étapes ou enzymes
Nombre
d'ATP formés
par FADH2 oxydé et 2,5 ATP par NADH oxy
C4
TOTAL:
7 tours de spire
Acétyl-CoA
Acé
Acétyltyl-CoA
2- Bilan énergétique
4°- Bilan énergé
nergétique :
Bilan énergé
nergétique de la dé
dégradation d'une mol
Pour chaque tour de spire :
1 FADH2 et 1 NADH +
Nombre de
NADH ou d
FADH2 form
Différentes étapes ou enzymes
H+
Equation globale de la ! -oxydation
Equation
globale
la ! -oxydation
*A partir du
palmitate (C16):
106de
ATP
Activation
7 passages à travers la !-oxydation:
Palmitoyl-CoA
+ 7 CoASH + 7 FAD + 7 NAD+ + 7 H2O
H+
• 7 FADH2 + 7 NADH + 7
• 8 acétyl-CoA dégradés dans cycle de Krebs et chaîne respiratoire
7 FADH
*A partir 8duAcétyl-CoA
sté
ATP 2
stéarate (C18):+120
+ 7 NADH + 7 H+
Activation
8 passages à travers la !-oxydation:
• 8 FADH2 + 8 NADH + 8 H+
Activation du palmitate
Acyl-CoA deshydrogénase
!-OH-acyl-CoA deshydrogénase
7 FADH2
7 NADH
Isocitrate deshydrogénase
"-Cétoglutarate deshydrogénase
Succinyl-CoA synthétase
Succinate deshydrogénase
Malate deshydrogénase
8 NADH
8 NADH
–
8 FADH2
8 NADH
TOTAL
!La respiration mitochondriale produit 1,5 ATP
• 9 acétyl-CoA dégradés dans cycle de Krebs et chaîne respiratoire
par FADH2 oxydé et 2,5 ATP par NADH oxydé
A partir du palmitate (C16), étape d'activation, puis 7 passages a travers la béta oxydation,
formation de 8 acétyl CoA, qui sont dégradés dans le cycle de krebs et la chaine
respiratoire. J'obtiens 106ATPsi on par a partir du palmitoide CoA : on ne tient pas compte
de l'activation du palmitate et des -2 ATP.
Bilan énergé
nergétique de la dé
dégradation d'une molé
molécule de palmitate
Nombre
Nombre de
NADH ou de d'ATP formés
FADH2 formés à partir d'ADP
Différentes étapes ou enzymes
Activation du palmitate
Acyl-CoA deshydrogénase
!-OH-acyl-CoA deshydrogénase
7 FADH2
7 NADH
-2
10,5
17,5
Isocitrate deshydrogénase
"-Cétoglutarate deshydrogénase
Succinyl-CoA synthétase
Succinate deshydrogénase
Malate deshydrogénase
8 NADH
8 NADH
–
8 FADH2
8 NADH
20
20
8
12
20
TOTAL
106
!La respiration mitochondriale produit 1,5 ATP
par FADH2 oxydé et 2,5 ATP par NADH oxydé.
A partir du stéarate (C18) → 120 ATP
Formation de 9 Acetyl CoA.
4
Bilan énergé
nergétique de la dé
dégradation d'une
Bilan énergé
nergétique de la dé
dégradation d'une molé
molécule de sté
stéarate
Nombre
Nombre de
NADH ou de d'ATP formés
FADH2 formés à partir d'ADP
Différentes étapes ou enzymes
Activation du stéarate
Acyl-CoA deshydrogénase
!-OH-acyl-CoA deshydrogénase
-
-2
8 FADH2
Glucose -> 2 pyruvate
12
20
8 NADH
Isocitrate deshydrogénase
"-Cétoglutarate deshydrogénase
Succinyl-CoA synthétase
Succinate deshydrogénase
Malate deshydrogénase
Nombre
NADH ou
FADH2 for
Différentes étapes ou enzyme
Glycolyse
22,5
22,5
9 NADH
9 NADH
Décarboxy- Complexe de la pyruvate
lation du deshydrogénase
pyruvate
9
–
9 FADH2
9 NADH
13,5
22,5
TOTAL
-
Glycéraldéhyde-3-phosphate
deshydrogénase
Cycle de
Krebs
120
!La respiration mitochondriale produit 1,5 ATP
2 NADH
Isocitrate deshydrogénase
"-Cétoglutarate deshydrogénase
Succinyl-CoA synthétase
Succinate deshydrogénase
Malate deshydrogénase
par FADH2 oxydé et 2,5 ATP par NADH oxydé.
2 NADH
cytosoliq
2 NADH
2 NADH
–
2 FADH
2 NADH
TOTAL
Bilan énergé
nergétique de la dé
dégradation d'une molé
molécule de glucose
Nombre de
NADH ou de
FADH2 formés
Différentes étapes ou enzyme
Nombre d'ATP formés
à partir d'ADP
Navette
* Rendement énergétique de la glycolyse aérobie:
Glycérol-P
glucose
-> 2 pyruvate
2
32Glucose
ATP formés
Glycolyse
Glycéraldéhyde-3-phosphate
2 NADH
Navette
malate/
aspartate
3
ENERGETIQUE CELLULAIR
2
5
A - ROLE CENTRAL DE L ’ATP
deshydrogénase
cytosoliques
* Rendement
énergétique de la !-oxydation
des acides gras:
stéarate
: 120deATP
DécarboxyComplexe
la pyruvate
lationpalmitate:
du deshydrogénase
106 ATP
pyruvate
2 NADH
5
5
Isocitrate deshydrogénase
2 NADH
2 NADH
"-Cétoglutarate deshydrogénase
Cycle de Succinyl-CoA synthétase
–
Krebs
2 FADH2
Succinate deshydrogénase
* Rendement
énergétique par atome2de
C:
NADH
Malate deshydrogénase
5
5
2
3
5
5
5
2
3
5
30
32
• glucides : 5,3 ATP formés/C (32/6)
TOTAL
• ac. gras : 6,6 ATP formés/C
B - DIFFERENTES SOURCES DE L ’ACE
AC
I - Décarboxylation oxydative du pyr
II - !-oxydation des acides gras
III - Formation et utilisation des corp
IV - Dégradation des acides aminés
C - CYCLE DE KREBS
(106/16) pour le palmitate
D – PHOSPHORYLATION OXYDATIVE
6,7 du
ATPglucose
formés/C en
(120/18)
pour le stéarate
La dégradation
pyruvate
donne deux ATP.
Au cours de la glycolyse, on obtient du NADH cytosolique. On utilise la navette malate
asparate qui donne du NADH mitochondrial (non pas au niveau du cytosol) ou la navette
glycérol P qui donne du FADH2. Il faut un transporteur (navette du glycérol phosphate)
donc formationENERGETIQUE
de 3 ATP,CELLULAIRE
ou la navette malate aspartate on a du NADH au niveau de la
mitochondrie donc 5 ATP.
1 FADH2
=
1,5
ATP
A - ROLE CENTRAL DE L ’ATP
1 NADH = 2,5 ATP
Suivant la navette utilisée on a pas le même nombre d'ATP formé.
B - DIFFERENTES SOURCES DE L ’ACETYLACETYL-CoA
I - Décarboxylation oxydative du pyruvate
Rendement
énergétique
II - !-oxydation
des acidesde
grasla glycolyse aérobie (dégradation complète du glucose)
- Formation
et utilisation
des corps
→ 32IIIATP
formés
si on prend
unecétoniques
des deux navettes.
IV - Dégradation des acides aminés
Rendement
énergétique
de la béta oxydation des acides gras
C - CYCLE DE
KREBS
Stéarate : 120 ATP
D
–
PHOSPHORYLATION
OXYDATIVE
Palmitate : 106 ATP
Le rendement énergétique d'un acide gras est plus important car l'acide gras est une
molécule réduite. On les compare en prenant un meme nombre de carbone par composé.
Rendement énergétique par atome de C (pour un atome de carbone) :
- Glucides: 5,3 ATP/C (32/6)
5
- Acides gras:
Pour le palmitate: 6,6ATP/C (106/16)
Pour le stéarate: 6,7ATP/C (120/18)
Le rendement est meilleur pour un acide gras, car il est entièrement réduit alors que le
glucose est un composé déjà oxydé.
Pour les glucides, le rendement énergétique est plus faible parce que le rendement
énergétique d'un composé est d'autant plus important que ce composé est a l'état réduit.
(on a donc plus d'étapes d'oxydations). On va avoir une réserve énergétique très
importante pour les lipides et faible pour les glucides (en particulier le glycogène).
III- Formation et utilisation des corps cétoniques
Lorsqu'on a de l'acétyl CoA qui provient de la béta oxydation des acides gras, il se
condense avec l'oxaloacétate pour donner du cytrate afin de rentrer dans le cycle de
krebs.
En cas de jeun, on va avoir un déficit en oxaloacétate (peut provenir du glucose et du
pyruvate), on ne va pas pouvoir faire fonctionner le cycle de krebs. Les acetyl CoA vont
s'accumuler et donc ils vont suivre la voie des corps cétoniques, aboutir a la formation de
3 composés. Les acétyl coA venant de la dégradation des acides gras va sʼaccumuler, va
encombrer le cycle de Krebs essentiellement au niveau du foie qui va alors transformer
cet acétyl CoA en des composés que lʼon appellent corps cétoniques de manière soit les
éliminés soit les exportés vers les autres tissus.
C'est la cétogenèse, ou formation des corps cétoniques.
III - Formation et utilisation des corps cé
cétoniques
Formations de :
- acétoacétate
cé
cétogenè
togenèse est la formation des « corps cé
cétoniques »
- D 3Lahydroxybutyrate
- acétone (volatils)
CH3
* Acétoacétate
!
C
"
COO-
CH2
1
O
* D-3
3-hydroxybutyrate
CH3
CHOH
* Acétone
CH3
C
CH2
COO-
CH3
2
3
volatil
O
On a un équilibre dʼoxydoréduction entre ces composés.
Formation des corps cétoniques essentiellement dans les mitochondries hépatiques
le cycle de krebs Acé
esttoac
débordé,
il ne peut pas prendre tout les acétylCoA. Pour se
étylCoA
Acétoacé
déparasserOdes acétyl CoA il faut faire réagir des acétyl CoA.
+
H
O
CoA
CH
S
C
Condensation de deux
acétyl CoA par une
thiolase (réaction inverse de la dernière étape
Hydroxyméthylglutaryl-CoA
synthase
2
(HMG-CoA synthase)
de l'oxydation
oxydation)
des acides gras). Condensation d'une troisième molécule
CoA
H S (béta
d'acetyl CoA par une HMG CoA synthase, on obtient un composé, un dicarboxylique
O
OH
(avec 5C) , acide glutarique(HMG
CoA)
2
3
-O C
2
CH2
CH2
C
C
S
CoA
CH3
3-HydroxyHydroxy-3-méthylglutarylthylglutaryl-CoA (HMG
(HMG--CoA)
CoA)
3
Hydroxyméthylglutaryl-CoA lyase
(HMG-CoA lyase)
O
O
-O C
2
CH2
C
CH3
Acé
Acétoacé
toacétate
+
CH3
C
S
CoA
Acé
Acétyltyl-CoA
6
H2O + CH3
O
O et utilisation des corps
III - Formation
cé
cétoniques
CH3
+
CoA
S
C
CH3
1
HS
CoA
-O C
2
CH2
O
!
O
CH
3
CH2
C
C
"
CH2
COO-
Acé
Acétoacé
toacétyltyl-CoA
* D-3
3-hydroxybutyrate
CH3
3-HydroxyHydroxy-3-méthylglutary
1
3
CH2 COO
CHOH
volatil
O
O
-O C
2
CH2
C
Acé
Acétoacé
toacétylCoA
O
S
CoA
HS
CoA
-O C
2
CH2
Hydroxyméthylglutaryl-CoA synthase
(HMG-CoA synthase)
2
O
OH
CH2
C
C
S
CoA
CH3
3-HydroxyHydroxy-3-méthylglutarylthylglutaryl-CoA (HMG
(HMG--CoA)
CoA)
3
Hydroxyméthylglutaryl-CoA lyase
(HMG-CoA lyase)
O
O
-O C
2
CH2
C
CH3
Acé
Acétoacé
toacétate
+
CH3
C
S
CH3
Acé
Acétoacé
toacétate
Réaction de clivage avec une enzyme, HMG CoA lyase. On obtient de l'acétoacétate et de
l'acetylCoA. Formation du corps cétonique par une étape intermédiaire qui est la
formation d'HMG CoA.
C
Hy
(H
2
R*éaction
inverse de la 4e étape de laCH
!-oxydation
C CH3des acides gras3
Acétone
3
H2O + CH3
CH2
C
CH3
S O CoA
C
Hyd
(HM
2
OH
Thiolase
(acétyl-CoA acétyltransférase)
HSCoA
CH3
CoA
Acé
Acétyltyl-CoA
Acé
Acétyltyl-CoA
La cé
cétogenè
togenèse est la formation des « corps cé
cétoniques »
* Acétoacétate
S
C
CoA
S
C
Acé
Acétoacé
toacétyl
O
Formation dans la mitochondrie hé
hépatique des corps cé
cétoniques
CoA
Acé
Acétyltyl-CoA
OMSG
- oxalique (2C)
6
- malonique (3C)
- succinite (4C)
- glutarique (5C)
"
Formation de corps cétoniques : acétoacétate et acétyl CoA
équilibre entre l'acétoacétate et le D3 OH butyrate puisque c'est le composé réduit de
l'acétoacétate. Il est en équilibre dʼoxydo-réduction. Ici cʼest une oxydation.
L'acétoacétate peut être décarboxyler pour donner de l'acétone.
+
C
O
-O C
2
CH2
Acé
Acétoacé
toacétate
CH3
C
CO2
3-OH-butyrate
deshydrogénase
NADH + H+
O
CH3
C
O
NAD+
CH2 C
-O C
2
CH3
Utilisation des corps cé
cétoniques dans les tissus extra
Acé
Acétoacé
toacétate
CH3
Acétone
-OCO
2C 2 CH2
CH3 D-3
3-OH-butyrate
3-OH-butyrate
NADH + H+
CHOH
deshydrogénase
O
NAD+
Les corps cé
cétoniques traversent la membrane mitocho
mitoch
puis la membrane plasmique pour rejoinde la circula
Utilisation des corps cé
cétoniques dans les tis
Ils sont:
- soit utilisé
utilisés par les tissus pé
périphé
riphériques: muscles squ
coeur et rein; cerveau en cas de jeû
jeûne prolongé
prolongé.
- soit excré
étéscorps
si la production
est trè
(cé
excrLes
très élevé
levlaéemembran
(cétonur
cé
cétoniques traversent
puis la membrane plasmique pour rejoinde l
CH
UtilisationCHdesC corps
cétoniques dans les tissus extra hépatiques
Acétone
Ils sont:
Les corps cétoniques traversent la membrane mitochondriale puis le membrane
plasmique
- soit utilisé
utilisés par les tissus pé
périphé
riphériques: mu
pour rejoindre la Ocirculation
sanguine.
C CH
CH D-3
CHOH
3-OH-butyrate
coeur et rein; cerveau en cas de jeû
jeûne prolon
prolo
- Soit Ils sont utilisés par les tissus périphériques : muscles squelettiques,
cœur
et
- soit excré
é
t
é
s
si
larein,
production est trè
excr
très élevé
levée
cerveau en cas de jeun prolongé. Le cerveau utilise avec une préférence le glucose mais
NADH
+
H+
il peut utiliserAcé
3-OH-butyrate
étoacé
étate + cétoniques.
Acdes
toaccorps
CONCLUSION
+
- Si ils sont produits en grande quantité,
ils sont excrétés au niveau du rein, on a donc une
O
NAD+
cétonémie dans le sang
une
cétonurie dans les urines et élimination
d'acétone
dans
lesunité
-O C et
Le foie convertit
les acides
gras en
unités acé
acétyltyl-CoA
CH
CH C S CoA
poumons.
qui seront dé
Succinyldégradé
gradés dans le cycle de Krebs.
Succinyl-CoA
3
3
2
2
3
2
2
2
3-Cétoacyl-CoA transférase
-O C CH
CH2
Acé
é2toacé
Ac
toacétate
2
+
3-OH-butyrate
+
Acé
Acétoacé
toacétyltyl-CoA
NADH
+ H+
CO
2
Succinate
NAD+
O
CH3
C
O
O
CH2
C
CoA
S
-O C
2
CH2
CH2
C
HSCoA
Thiolase
O
Acé
-CoA 2 CH
Acétyltyl
Acéétoacéétyl--CoA3
Ac toac tyl CoA
C
-O C
2
CH2
CH2
CO2
Succinate
O
S CoA
CH3 C CH2
S
SuccinylSuccinyl-CoA
3-Cétoacyl-CoA transférase
O
C
S
HSCoA
Thiolase
CoA
En cas d’
d’encombrement du cycle de Krebs, il fourni
fourn
de l’
aux autres organes.
CONCLUSION
l’acé
acétoacé
toacétate/3
tate/3--OHOH-butyrate
Les corps cé
cétoniques sont donc une forme de transpo
des unité
unités acé
acétyl et sont utilisé
utilisés comme source énerg
Le foie convertit les acides gras en unité
unités ac
qui seront dé
dégradé
gradés dans le cycle de Krebs.
Ils sont normalement en concentration faible dans le
(0,1mmol/L; par comparaison la glycé
glycémie est de 4,4
En cas d’
d’encombrement du cycle de Krebs
En cas de concentration élevé
levée, une partie est excré
excrét
de l’
l’acé
acétoacé
toacétate/3
tate/3--OHOH-butyrate aux autres
Les corps cé
cétoniques sont donc une forme d
des unité
unités acé
acétyl et sont utilisé
utilisés comme sour
CoA
Ils sont normalement en concentration faib
(0,1mmol/L; par comparaison la glycé
glycémie e
En cas de concentration élevé
levée, une partie
O
Acé
Acétyltyl-CoA 2
CH3 C
S
CoA
Réactivation qui consiste a reformer l'acéto acétyl CoA, par un composé (succinyl CoA)
qui transfère son coenzyme A sur l'acéto acétate, et il est transformé en succinate (cʼest
aussi un intermédiaire dans le cycle de Krebs) et formation de l'acéto acétylCoA.
Enzyme: 3 céto acyl CoA transferase.
Cette réaction est différente de la réaction du cycle de krebs où on utilise le succinyl CoA.
Puis réaction de thiolise et récupération de deux acétylCoA qui vont pouvoir étre
récupérés par les tissus périphériques.
Le fois forme des corps cétoniques qui sont envoyés dans la circulation et qui sont utilisés
par les tissus périphériques.
Acétoacétate = forme hydrosoluble de transport d'acétyl du foie vers les tissus
périphériques.
Conclusion :
Le foie convertit les acides gras en unité acétyl CoA qui seront dégradés dans le cycle de
krebs. En cas d'encombrement du cycle de krebs, il fournit de l'acétoacétate 3 OH
butyrate aux autres organes. Les corps cétoniques sont donc une forme de transport des
unités acétyl.
Ils sont normalement en concentration faible dans le sang (0,1mmol/L par comparaison à
la glycémie: 4 à 6 mmol/L). en cas de concentration élevée, une partie est excrétée.
Le rapport acétoacétate/ 3 OH butyrate reflète l'état d'oxydation de la mitochondrie.
Rapport NAD+/ NADH mitochondrial
Rapport pyruvate/ lactate (en équilibre par une réaction catalysée par une enzyme
cytosolique) reflète l'état d'oxydoréduction du cytosol (rapport NAD+/NADH cytosolique).
Pathologies: maladies génétiques de la béta oxydation.
Les plus fréquentes: déficit en acyl CoA deshydrogénase.
Plusieurs enzymes en fonction de la longueur de la chaine de l'acide gras
Déficit en MCAD (pour les acides gras a chaine moyenne) maladie récessive autosomique
- épisode hypoglycémique avec hypocétonémie (risque de coma) en cas de jeun.
- excrétion d'acides organiques urinaires, accumulation spécifique d'acylcarnitines dans le
plasma (la carnitine est le transporteur des acides gras)
- traitement : éviter les périodes de jeune, en cas d'épisode aigus, injection intraveineuse
de glucose.
"
IV- Dégradation des protéines et des acides aminés
"
Schéma général
La source essentielle de nutriments pour les oxydations cellulaire est les glucides et les
lipides. Mais dans des conditions particulière on peut utiliser les protéines exogènes (dans
un régime hyperprotéinique) ou les protéines endogènes. Les protéines sont dégradées
en acides aminés, qui vont pouvoir rejoindre le métabolisme général a différentes étapes.
Normalement, les protéines qui sont dégradées en acides aminés, leur destinée principal
c'est de reformer des protéines.
Se que l'on voit ici, c'est dans des conditions particulières. Dans certains cas les protéines
peuvent etre utilisées comme source énergétique (ex : régime hyperprotéiné), ou dans le
cas ou on a un apport faible en glucide.
1- Digestion des protéines alimentaires
"
Elle commence au niveau de l'estomac (tractus gastro-intestinal) avec une hydrolyse
partielle des protéines (milieu acide pH de 1 à 2,5) avec une enzyme : la pepsine.
Puis prés du pancréas, sécrétion de composés :
- ions bicarbonates (HCO3-) qui servent à la neutralisation du pH bol alimentaire qui est
très acide du fait du passage dans l'estomac => pH autour de 7
- des pro-enzymes (zymogenes) comme le trypsinogène, la chymiotrypsinogène les
procarboxypeptidase A et B, elles vont servir a finir la dégradation des protéines et des
peptines déjà obtenus.
Au niveau de lʼintestin grele : lʼentéropeptidase, est une enzyme qui provient des cellules
intestinales, est capable d'activer les zymogènes en particulier le trypsinogène activé en
trypsine
La trypsine est capable d'activer des molécules de trypsinogènes au niveau de l'intestin.
Elle va aussi sʼauto-activer. La protéine est dégradé en acides aminées libres, il se
retrouvent dans les cellules intestinales (car absorbées), passage dans la circulation
sanguine et aboutissent au niveau du foie.
2- Pour les protéines endogènes
"
Les protéines sont souvent régénérées. Elles ont une durée de vie variable : de quelques
minutes (lorsqu'on a des facteurs de régulations (de transcription)) à plusieurs semaines
(comme l'hémoglobine = 4mois).
Trois grands systèmes :
- Système lysosomal, sac contenant des enzymes en excès. Système global, non sélectif,
fonctionnant par autophagie et à l'aide de protéases appelées cathepsines.
Dégradation en acides aminés et peptides libérés dans le cytosol.
- Système calpaïne-calpastatine dépendant de la concentration cellulaire en calcium,
spécialisé dans la dégradation des protéines du cytosquelette.
- Système spécifique ubiquitine protéasome (ubiquitaire), système présent dans le
cytoplasme et soigneusement régulé. Système spécifique: Les protéines destinées a être
dégradées sont marquée par de l'ubicuitine, qui forme une liaison covalente avec une
protéine.
Un systèmedes
enzymatique
ubiquitine ligase peut reconnaitre ces protéines pour
2°- Dégradation
protéines endogènes
Dégradation
des acides aminés
les ubiquitiniler. Ces protéines sont dégradées dans le protéasome. 3°(cylindre
creux dans
Duré
Durée de vie trè
très variable: de quelques mn à plusieurs semaines (Hb
(Hb:: 120 jours)
lequel les composés qui doivent être dégradé cheminent.
Les divers acides aminés servent à la biosynthè
• Trois grandsest
systèmes:
(Lʼubiquitine
un peptide). Il nʼy a pas de mise en réserve des protéines.
et d’autres composés comme les hormones ou
- le système lysosomal (foie et rein)
système global, non sélectif fonctionnant par autophagie et à l’aide
Les acides aminés superflus sont dégradés dans
3-protéases
Dégradation
des acides
aminés
de
appelées cathepsines:
dégradation
en peptides et AA
(pas de mise en réserve comme les glucides ou
libérés dans le cytosol
- le système calpaïne-calpastatine dépendant de la concentration
Les
divers
acides
aminés
servent
à
la
biosynthèse
des
propres
protéines
de l'individu et
cellulaire en calcium, spécialisé dans la dégradation des protéines du
a) Elimination du groupe !-aminé :
cytosquelette
d'autres
composés comme les hormones ou neurotransmetteurs.
par transaminases et glutamate deshydro
- le système spécifique ubiquitine-protéasome (ubiquitaire)
+
Les
acides aminés superflus sont dégradés dans le foie. Le corps ne peutNHpas
mettre en
4 et urée (+++)
système présent dans le cytoplasme, soigneusement régulé
réserve
les acides aminés.
*les protéines destinées à être dégradées sont marquées par une
liaison covalente avec un peptide appelé ubiquitine
b) Transformation du squelette carboné
*une fois ubiquitinylées,
protéines
à
Pour dégradé
un acide les
aminé,
il sont
y adégradées
deux étapes:
l’intérieur du protéasome (complexe protéique cylindrique)
1) Elimination du groupement alpha aminé
On utilise les transaminases et glutamate deshydrogénase, pour aboutir a la synthèse
d'ammoniac et à l'urée (molécule qui contient de l'azote)
Résumé pour l'élimination du groupement aminé:
Proteines cellulaires
Aminoacides
provenant
des proté
protéines
ingé
ingérées
+
H3N
COOC
R
ac.
ac. aminé
aminés
3°- Dégradation des acides aminés
FOIE
COO-
Transaminase
C
H
COOC
O
COO-
+
C
H3N
H
[CH2]2
[CH2]2
COO!-cétoglu
COOGLU
O
a) Elimination du groupe !-aminé :
R
ac.
ac. !-céto
b) Transformation du squelette carboné:
*Acides aminés glucoformateurs:
Pyruvate
Intermédiaires du cycle de Krebs
*Acides aminés cétogènes:
Acétyl-CoA
NH4+
uré
urée
NH4+
uré
urée
Acétoacétyl-CoA
On utilise une transaminase spécifique, qui transforme l'acide alpha aminé en acide alpha
cétonique (acide aminé) , on a besoin d'un accepteur qui est l'acide alpha cétoglutarate,
qui donne du glutamate (acide glutamique) par une réaction de transaminastion( une
spécifique pour chaque acide aminé).
A partir de l'acide glutamique: Une enzyme, la glutamate deshydrogénase, peut libérer
NH3 sous forme de NH4+ pour régénérer l'alpha cétoglutarate.
NH4+ est transformé en urée le plus souvent.
2) Transformation du squelette carboné
Pour chaque acide aminé un squelette carboné particulier, on a donc un métabolisme
particulier pour chaque acide aminé.
Il existe deux type d'acides aminé:
- acides aminés glucoformateurs, on aboutit a des réactions de transformation simple:
néoglycogenèse (pyruvate, intermédiaire du cycle de krebs) si on a besoin de reformer du
glucose.
- acides aminés cétogènes, ils donnent naissance à des composés qui peuvent aboutir à
des corps cétoniques (ceux qui donnent de l'acéthyl CoA ou de acétoacéthyl CoA)
Ces aa ne peuvent pas donner du glucose, donc soit lʼacétyl coA est dégradé soit il aboutit
a des intermédiaires pour le cycle de Krebs.
"
Métabolisme cellulaire
METABOLISME CELLULAIRE
Amino acides
Glucides
Glycolyse
Dégradation des aminoacide
Exemple des C3
Acides gras
!-oxydation
ALA
SER
NH3+
Pyruvate
CH3
Acétyl-CoA
CH
NH3+
COO-
CH
COO-
HS
"-cétoto-glu
GLU
KREBS
HOH2C
CH3
C
COO-
O
H+ et é
ATP
Chaîne respiratoire
PYRUVATE
2 CO2
Dégradation des aminoacides (exemple de C3)
Alanine, sérine, cystéine
l'alanine est transaminé et donne du pyruvate par l'alanine transaminase.
Tout comme la sérine et le cystéine.
Bilan énergétique de la dégradation d'une molécule d’ALA
Les
acides aminés abondants, en C3, sont facilement capable de donner du pyruvate, ils
Comparaison des
Nombre de Nombre d'ATP
sont glucoformateurs.
Différentes étapes ou
NADH ou de formés à partir
Dégradation
enzymedes aminoacides
FADH2
d'ADP
Exemple des C3
3 catégo
nutriments
formés
Transamination
Ala -> pyruvate
–
–
CYS
SER
Complexe de la pyruvate
1 NADH
2,5
+
du
NH3+
deshydrogénase NH3
CH3 deCH COO
HOH
CH COO- 1 HSH
Cycle
Isocitrate
deshydrogénase
NADH
2,5CH COO
2C
2C
"-cétoglutarate deshydrogénase
Krebs
1 NADH
2,5
Succinyl-CoA synthétase
–
1
"-cétoto-gluSuccinate deshydrogénase
1 FADH2
1,5
CH3 C COOMalate deshydrogénase
1 NADH
2,5
GLU
O TOTAL
12,5
ALA
Décarboxylation
pyruvate
NH3+
PYRUVATE
• Rendement énergétique par atom
Glucides (glucose) : 5,3 ATP form
Lipides (stéarate) : 6,7 ATP form
Protides (ALA) :
4,2 ATP form
2 CO2
Bilan
énergétique
de de
la dégradation
d'une molécule
Bilan
énergétique
la des
dégradation
d'uned’ALA
molécule d'alanine.
Dégradation
aminoacides
Comparaison des 3 caté
nutriments
Exemple des C3 Nombre de Nombre d'ATP
Différentes étapes ou
NADH ou de formés à partir
enzyme
ALA
Transamination
NH3+
SER
Ala -> pyruvate
CH3 CH COO
C
Décarboxylation
ComplexeHOH
de 2la
du pyruvate
FADH2
formés
–
NH3+
-
CH COO 1 NADH
HSH2C
pyruvate
deshydrogénase
Cycle
"-cde
étoto-glu Isocitrate deshydrogénase
"-cétoglutarate
deshydrogénase
Krebs
CH
C COO3
Succinyl-CoA synthétase
GLU
O
Succinate deshydrogénase
Malate deshydrogénase
PYRUVATE
TOTAL
1 NADH
1 NADH
–
1 FADH2
1 NADH
d'ADP
CYS
–
NH3+
CH
• Rendement énergétique par at
Glucides (glucose) : 5,3 ATP f
Lipides (stéarate) : 6,7 ATP fo
Protides (ALA) :
4,2 ATP f
COO
2,5-
2,5
2,5
1
1,5
2,5
12,5
Alanine donne du pyruvate par une réaction de transamination
A partir d'une pyruvate, transformation en acéthyl CoA, avec 1 NADH est formé, on peut
former 2,5 ATP.
Puis cycle
de krebs, pour
tour, on a 3 de
NADH, 1 FADH2 et 10 ATP formés
Comparaison
des un
3 catégories
On a 12,5 ATP formés.
nutriments
Comparaison des 3 catégories de nutriments.
• Rendement énergétique par atome de C
Glucides (glucose) : 5,3 ATP formés/C (32/6)
Lipides (stéarate) : 6,7 ATP formés/C (120/18)
Protides (ALA) :
4,2 ATP formés/C (12,5/3)
Les acides aminés ne sont pas adaptés pour former de l'énergie, le rendement est faible.
L'acide gras saturé est la plus réduit, les acides aminés sont très oxydé.
le but des acides aminés et pour la biosynthèses des protéines ou d'autres composés.
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