Foucher Julien LP ATIB 2009

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A
ssociation pour la
C onnaissance et la
R echerche
O rnithologique en
L oire-
A tlantique
Evaluation de la ressource alimentaire disponible
pour les passereaux paludicoles
en zone de halte migratoire
Exemple de la roselière de Donges Est en Loire-Atlantique (44)
Rapport de licence professionnelle
Analyses et Techniques d’Inventaires de la Biodiversité
Julien Foucher, année 2008 – 2009
UFR de Biologie
Université Claude Bernard Lyon 1

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Remerciements
Je tiens tout d’abord à remercier mon maître de stage, Hubert Dugué, et Etienne
Giraudot, pour leur soutien et leurs conseils tout au long du stage.
Je remercie ensuite
- Franck Herbrecht & Bernard Kaufmann, pour leurs conseils sur l’échantillonnage
des invertébrés,
- Didier Montfort, pour sa disponibilité et sa gentillesse,
- Aurélia Lachaux pour son aide en botanique,
- Romain Lorillière pour ses conseils en analyses de données,
- Pierre-Yves Henri pour sa formation aux analyses de Capture-Marquage-
Recapture.
Sans oublier Nicolas Chenaval et Vanessa Lelant pour leurs conseils judicieux.
Je tiens également à remercier vivement tous les bénévoles du camp de Donges sans
qui les opérations de baguage n’auraient pu être effectuées.
Et tous ceux que j’aurais omis de citer…

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Présentation de la structure
ACROLA
Association pour la Connaissance et la Recherche Ornithologique en Loire-Atlantique
La Jannais des Douets 44360 Cordemais
Site web : http://www.cigogne-odoborro.fr/ e-mail : [email protected]
L’ACROLA est une association de type loi 1901 créée fin 2006. Elle regroupe une
équipe d’ornithologues passionnés, des biologistes multidisciplinaires désireux
d’apporter leurs compétences personnelles et des bagueurs collaborateurs du Centre
de Recherche sur la Biologie et les Populations d’Oiseaux (CRBPO), un département
du Muséum National d’Histoire Naturelle.
L’association mène deux axes de recherche :
- Le programme « Cigognes », rassemblant des actions de protection et de suivi
des cigognes blanches en Loire-Atlantique (observations de terrain, réalisation et
pose de plates-formes avec des élèves d’établissements scolaires, baguage,
élaboration et gestion d’une base de données des observations, animation d’un
site Web, réalisation d’un film…). L’ACROLA amplifie le travail de suivi des
cigognes blanches en Loire-Atlantique et participe au programme national
d’étude.
- Le programme « paludicoles », dans la continuité de son expérience du baguage
des fauvettes paludicoles dans les roselières de l’estuaire de la Loire depuis
1994, l’équipe de l’ACROLA organise et assure le camp de baguage et de
formation de Donges Est et diversifie ses moyens de recherches pour améliorer
les connaissances dans ce domaine.
Les travaux et études scientifiques sont réalisés grâce au soutien des partenaires de
l’association. Citons par exemple :
- E.R.D.F. ( Electricité de France)
- R.T.E ( Réseau de Transport d’Electricité)
- Le Grand Port Maritime Nantes-St Nazaire
- La raffinerie TOTAL.
- Le Crédit Agricole Loire-Atlantique Vendée

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REMERCIEMENTS.......................................................................................................................................1
PRESENTATION DE LA STRUCTURE........................................................................................................3
INTRODUCTION ........................................................................................................................5
1_ PRESENTATION DE LA ZONE D’ETUDE............................................................................6
1-1_ C ONTEXTE ECOLOGIQUE ET HISTORIQUE ............................................................................6
1-2_ L E SITE D ’ ETUDE ...............................................................................................................7
1-3_ P RESENTATION DES DIFFERENTES STATIONS ......................................................................7
1-4_ C HOIX DES STATIONS ........................................................................................................9
2_ MATERIEL ET METHODES..................................................................................................9
2-1_ P ROTOCOLE D ’ ECHANTILLONNAGE DES INVERTEBRES .........................................................9
2-1-1_ Méthode de capture et pièges utilisés......................................................................9
2-1-2_ Protocole et emplacement des pièges ...................................................................11
2-1-3_ Identification des invertébrés..................................................................................12
2-2_ P ROTOCOLE DE CAPTURE DES FAUVETTES PALUDICOLES ..................................................13
2-2-1_ Programme « Halte migratoire »............................................................................13
2-2-2_ Protocole « ACROLA »..........................................................................................13
2-3_ A NALYSES ......................................................................................................................14
3_ RESULTATS .......................................................................................................................15
3-1_ I NVERTEBRES .................................................................................................................15
3-1-1_ Présentation générale............................................................................................15
3-1-2_ Diversité et Abondance..........................................................................................17
3-1-3_ Biomasse...............................................................................................................18
3-1-4_ Comparaison scirpaie / phragmitaie.......................................................................21
3-2_ O ISEAUX ........................................................................................................................23
3-2-1_ Présentation générale............................................................................................23
3-2-2_ Probabilités de capture de quatre espèces représentatives...................................24
3-2-3_ Indice ACROLA......................................................................................................26
4_ DISCUSSION ......................................................................................................................26
CONCLUSION ET PERSPECTIVES........................................................................................29
BIBLIOGRAPHIE......................................................................................................................30
ANNEXES ................................................................................................................................32

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Introduction
Près de la moitié des oiseaux européens sont des migrateurs. Cette migration entraîne
de formidables dépenses d’énergie d’où l’absolue nécessité de trouver des zones
d’escales pour reconstituer leurs réserves de graisse.
Aujourd’hui, les changements, d’ordre climatique ou résultant de l’occupation des sols
par les activités humaines, fragilisent ces stratégies et peuvent à terme, poser la
question du statut de conservation de ces espèces migratrices. Cette question se pose
de manière particulièrement aigüe pour les fauvettes paludicoles, tributaires des
roselières qui sont en forte régression à travers l’Europe.
L’estuaire de la Loire représente un ensemble de plus de 20 000 hectares de zones
humides (5000 ha d’eau libre à marée haute; 2000 ha de vasières ; 700 ha de
roselières, 15000 ha de prairies) accueillant une grande diversité d’espèces végétales
et animales. Au sein de cette mosaïque de paysage, d’une grande valeur écologique,
Donges-Est apparaît comme un maillon clé de l’estuaire de la Loire. En effet, sur 750
ha nous retrouvons l’ensemble des habitats présentés ci-dessus, et notamment ceux
qui ont le plus souffert du développement socio-économique de l’estuaire ligérien. C’est
sur Donges-Est que se situe la plus grande roselière de l’estuaire (200 ha).
Pour mieux gérer et protéger les espaces vitaux pour des centaines de milliers de
passereaux que sont les zones de halte migratoire, il est important de comprendre
comment les oiseaux utilisent la ressource alimentaire disponible. Dans ce cadre, ce
rapport présente les résultats de l’inventaire des invertébrés de la roselière de Donges-
Est, réalisé en 2009, mené conjointement aux opérations de capture-marquage-
recapture d’oiseaux, effectuées depuis 2003.