Microbiologie 2 (commensalisme et infection)

COMMENSALISME
ET
INFECTION
I -Les réservoirs bactériens
• L’environnement
Bactéries saprophytes
• L’ homme, les animaux
Bactéries commensales
1 - Flore environnementale
• Réservoir de micro-organisme :
– Eau
– Surface
– Air
• Responsable d’infections :
– Légionellose : pneumopathie à Legionella
– Pseudomonas ‘
– Aspergillus (pneumopathie chez ID)
2 - Flores commensales
L’homme est constitué de 1000 milliards (1012)
de cellules eucaryotes
L’homme est porteur de 100 000 milliards (1014)
de bactéries
Flores commensales
cutanéo-muqueuse
• Flore résidente ou colonisante
– Bactéries survivent et se multiplient
– occupent régulièrement un endroit donné
– pas de réaction de défense de l ’hôte ≠
infection (réaction inflammatoire)
• Stable pour un individu
• Se reconstitue quand on cherche à l’éliminer
Flores commensales
cutanéo-muqueuse : rôle
•
•
•
•
Rôle de protection (effet barrière) +++
Rôle métabolique
Organisée en écosystèmes
différents selon les sites :
– pH, humidité, pression partielle en O2
Composition
des flores commensales
• Peau : 102 à 105 bactéries / cm2 :
– Staphylocoques blancs
– Staphylococcus aureus
– Corynebactéries
• Bouche :
– Streptocoques
– Bactéries anaérobies
• Nasopharynx :
– Streptocoques (Pneumocoque)
– Haemophilus
– Neisseria
• Tractus intestinal :
– principal réservoir de bactéries
– 1011 bactéries / g de selles dans le colon
• Entérobactéries
• bactéries anaérobies
• Vagin :
– 108-109 bactéries / g de sécrétion vaginale
chez la femmes adulte :
• lactobacilles
II - Origine des infections
• On distingue :
– les bactéries pathogènes strictes
– les bactéries occasionnellement
pathogènes
1-Bactéries pathogènes strictes
Salmonella typhi
• responsable de la fièvre typhoide
• infection : fièvre, diarrhée et élimination des
bactéries dans les selles
Mycobacterium tuberculosis
• Responsable de la tuberculose
pathogène spécifique de l ’homme
• contamination : aérienne,
par les gouttelettes de salive d ’un sujet malade
2 -Bactéries occasionnellement
pathogènes
• Bactéries de la flore commensale
• A l ’origine d ’une infection secondairement
- altération de la barrière
– immunodépression locale ou générale
– matériel en place
Bactéries occasionnellement pathogènes
Exemples
Infection à pneumocoque
(Streptococcus pneumoniae)
• appartient à la flore commensale du
rhinopharynx
• sous l ’influence de différents facteurs,
d ’une baisse de l ’immunité locale ou
humorale entraîne une infection
respiratoire, ou ORL, otite, sinusite.
Infections à Staphylocoque doré (S. aureus)
• commensal de la peau peut être responsable d ’un
abcès : furoncle, panaris ….
• Va coloniser la base du poil, se multiplier et donner
un abcès.
Infections à Entérobactéries (Escherichia coli)
• commensal du tube digestif
• peut-être responsable d’infections urinaires
• va coloniser l’épithélium vésical en remontant du tube
digestif grâce à leur pili puis multiplication
III - L’ infection bactérienne
- Pénétration d’un germe particulièrement
pathogène
- Rupture de l’équilibre entre pathogénicité de
certains germes commensaux et des moyens
de défense de l’organisme
Facteurs favorisant :
- altération des barrières
- baisse de l’immunité de l’hôte
- présence de matériel étranger
L’ infection bactérienne est la conséquence
de plusieurs évènements successifs :
- Pénétration de la bactérie dans l’organisme
adhésion bactérienne, franchissement de la barrière
- Multiplication de la bactérie localement
infection locale
Afflux de polynucléaires et macrophages
(si foyer superficiel : rougeur, chaleur, douleur)
L’ infection bactérienne est la conséquence
de plusieurs évènements successifs :
Dans certains cas :
Possibilité de passage dans la circulation générale
- sanguine (bactériémie) ou lymphatique
infection générale
Cliniquement : fièvre, hyperleucocytose, CRP
recherche de la porte d’entrée +++
Possibilité de foyers d’infections secondaires
Infection locale / Infection générale
Exemples :
Cystite / Pyélonéphrite
Abcès cutané
Défense de l’hôte
• Mise en jeu d’une cascade de défenses spécifiques
et/ou non spécifiques qui tend à éliminer les
bactéries.
• Immunité non spécifique :
– réaction inflammatoire (afflux de polynucléaires)
• Immunité spécifique
– humorale : synthèse d’anticorps (Lymphocytes B)
– cellulaire : activation des macrophages (Lymphocytes T)
IV - Voies de contamination
1 – Voie orale ou digestive :
Ingestion d’aliments ou d’eau contaminés
Exemples :
- Salmonelles, Listeria monocytogenes
- Rotavirus, Virus de l’hépatite A
- Tænia (ver solitaire)
Voies de contamination
2 – Voie respiratoire :
Inhalation d’aérosol ou de particules
associées à des bactéries ou virus
Exemples :
- M. tuberculosis, S. pneumoniae,
- Legionella pneumophila …
- Virus de la grippe
Voies de contamination
3 - Muqueuses :
contact direct, voie sexuelle (IST),
salive
Exemples :
•VIH, hépatite B
•Syphilis, Gonocoque
Voies de contamination
4 - Transcutanée :
Nécessite une brèche de la barrière cutanée
• Piqûre par un insecte
- Paludisme
•Inoculation iatrogène par piqûre d’aiguille :
- Hépatite B
V - Infections nosocomiales
Infection contractée à l’hôpital
dont : infections iatrogènes
Infections iatrogènes (1)
• Infection post-opératoire :
– Colonisation lors de l’intervention par une bactérie
commensale (ex : médiastinite à S. aureus)
• Infection sur matériel
Ex : infection sur cathéter
– cathéter colonisé par les bactéries de la peau
(ex : staphylocoque à coagulase négative)
– multiplication des bactéries
– passage dans le sang : septicémie
Infections iatrogènes (2)
• Infection lors de soins (pansements …) :
– Contamination par les germes du malade
– Contamination par la flore transitoire des
personnes effectuant les soins
Mesures de protection contre les
infections en milieu hospitalier
• Limiter la transmission de germes portés par
le malade :
– Asepsie de la zone avant intervention
• Limiter la transmission de germes portés ou
transportés par le personnel soignant :
– Lavage des mains
– Port de gants, de tablier, de masque …
Notion de bactéries
multi-résistantes (BMR)
• Staphylocoque doré résistant à la Méticilline
• Mesures de prévention contre la dissémination
des BMR
- Mise en isolement des patients
- Mise en place de précautions contact avec le
personnel soignant