Fascicule de thèses

Département EFPA
Écologie des Forêts, Prairies et milieux Aquatiques
Fascicule de thèses
Octobre 2008

Fascicule de thèses du département Ecologie des Forêts, Prairies et milieux Aquatiques
Octobre 2008 2
AVANT PROPOS
Le département Ecologie des Forêts, des Prairies et des milieux Aquatiques accueille en
moyenne 40 nouveaux doctorants par an, et héberge donc environ 120 doctorants
simultanément. Ces doctorants sont issus de 20 Ecoles Doctorales, dont les thèmes reflètent
la diversité des objets étudiés au département.
Ce document rassemble les résumés de 122 thèses en cours en 2008.
Il a été rédigé à l’occasion du séminaire des doctorants du département
qui a eu lieu du 6 au 8 octobre 2008 à Dinard.
Il est destiné aux doctorants pour permettre à chacun d’eux de se faire connaître. Il leur
permet aussi de se former à la rédaction d’un résumé destiné à être largement diffusé et de
s’informer sur les travaux des autres étudiants.
Il est également utile à la direction du département, aux différentes unités, aux responsables
de champ thématique et de réseaux, car il présente en condensé l’ensemble et la diversité
des fronts de recherche concrétisés par des thèses en cours.
Je remercie très chaleureusement le groupe des « animateurs des doctorants » (Anne
Jambois, Daniel Auclair, Thierry Caquet, Pascal Carrère, Sophie Gerber, Véronique Jorge,
Christophe Plomion) pour l’organisation et l’animation du séminaire ainsi que Cynthia
Mienville pour la réalisation méticuleuse du présent fascicule.
Jean-Marc Guehl
Chef du département EFPA

Fascicule de thèses du département Ecologie des Forêts, Prairies et milieux Aquatiques
Octobre 2008 3
S
So om mm ma ai ir re e
CT1 ....................................................................................................................................................... 11
Q
Qu ua al li it té é d de es s p pr ra ai ir ri ie es s f fr ra an nc c- -c co om mt to oi is se es s e et t c co on nt tr ri ib bu ut ti io on n à à l la a s sé éc cu ur ri it té é a al li im me en nt ta ai ir re e d de es s p pr ro od du ui it ts s d de e l la a
f
fi il li iè èr re e l la ai it t. . A Ap pp pr ro oc ch he e d de e l la a v vu ul ln né ér ra ab bi il li it té é d de es s p pr ra ai ir ri ie es s à à l la a p pr ré és se en nc ce e d d’ ’é év ve en nt tu ue el ls s c co on nt ta am mi in na an nt ts s d da an ns s l la a
c
ch ha aî în ne e « « s so ol l- -v vé ég gé ét ta at ti io on n- -l la ai it t » »
- - S Sa am mu ue el l M Ma aa as s - - . .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. . 1 12 2
T
Tr ra an ns sp pi ir ra at ti io on n e et t c cr ro oi is ss sa an nc ce e d de e l l' 'h hé év vé éa a: : i in nf fl lu ue en nc ce e d du u s st tr re es ss s h hy yd dr ri iq qu ue e e et t d de e l la a n né éc cr ro os se e d du u t tr ro on nc c. .
- -
S
Su up pa at t I Is sa ar ra an ng gk ko oo ol l N Na a A Ay yu ut tt th ha ay ya a - - . .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. . 1 13 3
Année de début de thèse : 2005 .......................................................................................................... 14
I
In nf fl lu ue en nc ce e d de e l la a s st tr ru uc ct tu ur re e p pa ay ys sa ag gè èr re e e et t d de e l la a r ré ép pa ar rt ti it ti io on n d du u b bo oi is s m mo or rt t s su ur r l le es s c co om mm mu un na au ut té és s d de e
C
Co ol lé éo op pt tè èr re es s s sa ap pr ro ox xy yl li iq qu ue es s
- - A An nt to oi in ne e B Br ri in n - - . .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. . 1 15 5
E
Ef ff fe et t d de es s c co on nt tr ra ai in nt te es s e en nv vi ir ro on nn ne em me en nt ta al le es s ( (O Oz zo on ne e e et t f fo or rt t C CO O2 2) ) s su ur r l le e b bo oi is s d de e j je eu un ne es s a ar rb br re es s : : é ét tu ud de e d de e
l
la a f fo or rm ma at ti io on n d du u b bo oi is s e et t c co on ns sé éq qu ue en nc ce es s s su ur r s se es s p pr ro op pr ri ié ét té és s e en n t ta an nt t q qu ue e m ma at té ér ri ia au u
- - N Ni ic co ol la as s R Ri ic ch he et t - - . .. .. .. . 1 16 6
C
Co on nt tr ri ib bu ut ti io on n à à l l’ ’é ét tu ud de e d de es s v va ar ri ia at ti io on ns s s sp pa at ti ia al le es s d de es s c co om mp po os sa an nt te es s d du u b bi il la an n d de e C Ca ar rb bo on ne e d d’ ’u un n s so ol l d de e
f
fo or rê êt t t tr ro op pi ic ca al le e : : e ef ff fe et t d de es s e es sp pè èc ce es s l li ig gn ne eu us se es s s su ur r l la a r re es sp pi ir ra at ti io on n d du u s so ol l
- - L La aë ët ti it ti ia a B Br re ec ch he et t - - . .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. . 1 17 7
D
De es s t tr ra ai it ts s d de es s g gr ra am mi in né ée es s a au u f fo on nc ct ti io on nn ne em me en nt t d de e l l’ ’é éc co os sy ys st tè èm me e p pr ra ai ir ri ia al l. . U Un ne e a ap pp pr ro oc ch he e d de e m mo od dé él li is sa at ti io on n
m
mé éc ca an ni is st te e. .
- - V Vi in nc ce en nt t M Ma ai ir re e - - . .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. . 1 18 8
B
Bi io od di is sp po on ni ib bi il li it té é d du u p ph ho os sp ph ho or re e d da an ns s l le es s s so ol ls s l la an nd da ai is s p po ou ur r l le es s p pe eu up pl le em me en nt ts s f fo or re es st ti ie er rs s d de e p pi in ns s
m
ma ar ri it ti im me es s
- - D Da av vi id d A Ac ch ha at t - - . .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. . 1 19 9
Année de début de thèse : 2006 .......................................................................................................... 20
R
Ro ol le e o of f p ph ho os sp ph ha at ta as se es s s se ec cr re et te ed d b by y t th he e s sy ym mb bi io ot ti ic c m mi ic cr ro ob bi ia al l p po op pu ul la at ti io on ns s a as ss so oc ci ia at te ed d w wi it th h P Pi in nu us s
p
pi in na as st te er r r ro oo ot ts s i in n t th he e e ec co os sy ys st te em m o of f L La an nd de es s o on n p ph ho os sp ph ho or ru us s m mo ob bi il li iz za at ti io on n
- - A Al li i M Mu uh ha am mm ma ad d A Ar ri if f - - . .. .. .. . 2 21 1
E
Es st ti im ma at ti io on n d de e l la a p pr ro od du uc ct ti iv vi it té é p pr ri im ma ai ir re e d du u P Pi in n m ma ar ri it ti im me e s so ou us s d de eu ux x c cl li im ma at ts s c co on nt tr ra as st té és s p pa ar r l la a m mé ét th ho od de e
a
al ll lo om mé ét tr ri iq qu ue e
- - O Ol lf fa a S Sh ha ai ie ek k - - . .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. . 2 22 2
D
Dé ét te er rm mi in na at ti io on n e et t c ca ar ra ac ct té ér ri is sa at ti io on n d de es s f fa ac ct te eu ur rs s d de e p pr ro od du uc ct ti io on n d da an ns s u un n m ma as ss si if f d de e p pl la an nt ta at ti io on ns s c cl lo on na al le es s
d
d’ ’e eu uc ca al ly yp pt tu us s
- - F Fa an nn ny y B Bi ik ki in nd do ou u - - . .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. . 2 23 3
M
Mo od dé él li is sa at ti io on n t tr ri id di im me en ns si io on nn ne el ll le e d de e l la a d dy yn na am mi iq qu ue e d de es s p pe eu up pl le em me en nt ts s f fo or re es st ti ie er rs s t tr ro op pi ic ca au ux x h hé ét té ér ro og gè èn ne es s : :
S
St tr ra at té ég gi ie es s d de e c cr ro oi is ss sa an nc ce e e et t t tr ra aj je ec ct to oi ir re es s d de e d dé év ve el lo op pp pe em me en nt t e en n f fo or rê êt t d de en ns se e h hu um mi id de e s se em mp pe er rv vi ir re en nt te e d de es s
G
Gh hâ ât ts
s o oc cc ci id de en nt ta au ux x d de e l l' 'I In nd de e. . - - C Cé éc ci il le e M Ma ad de el la ai in ne e- -A An nt ti in n - - . .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. . 2 25 5
M
Mo ob bi il li is sa at ti io on n d du u p ph ho os sp ph ho or re e o or rg ga an ni iq qu ue e d da an ns s l la a r rh hi iz zo os sp ph hè èr re e d de es s a ar rb br re es s f fo or re es st ti ie er rs s : : r ré ég gu ul la at ti io on n d de e l la a
s
sé éc cr ré ét ti io on n d de es s p ph ho os sp ph ha at ta as se es s d de es s c ch ha am mp pi ig gn no on ns s e ec ct to om my yc co or rh hi iz zi ie en ns s. . A Ap pp pr ro oc ch he es s b bi io oc ch hi im mi iq qu ue es s e et t
m
mo ol lé éc cu ul la ai ir re es s. .
- - J Ju ul li ie en n L Lo ou uc ch he e - - . .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. . 2 26 6
M
Mé éc ca an ni is sm me es s s so ou us s- -j ja ac ce en nt ts s d de e l la a p pr ro od du uc ct ti iv vi it té é d de es s p pl la an nt ta at ti io on ns s d d’ ’e eu uc ca al ly yp pt tu us s a au u C Co on ng go o : : e ef ff fe et ts s d de e l la a
f
fe er rt ti il li is sa at ti io on n e et t d de es s é éc cl la ai ir rc ci ie es s
- - H Hu ug gu ue es s Y Yv va an n G Go om ma at t - -
.
.. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. . 2 27 7
S
Si im mu ul la at ti io on n d de es s i im mp pa ac ct ts s d du u c ch ha an ng ge em me en nt t c cl li im ma at ti iq qu ue e s su ur r l le es s p pr ra ai ir ri ie es s e et t a ad da ap pt ta at ti io on ns s p po os ss si ib bl le es s
- - A An nn ne e- -
I
Is sa ab be el ll le e G Gr ra au ux x - - . .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. . 2 29 9
V
Va ar ri ia at ti io on ns s s sa ai is so on nn ni iè èr re es s e et t v va ar ri ia ab bi il li it té é i in nt te er rs sp pé éc ci if fi iq qu ue e d de es s é éc ch ha an ng ge es s g ga az ze eu ux x a au ux x n ni iv ve ea au ux x f fo ol li ia ai ir re e e et t
d
de es s t tr ro on nc cs s d de es s a ar rb br re es s e en n f fo or rê êt t t tr ro op pi ic ca al le e h hu um mi id de e
- - C Cl lé ém me en nt t S St ta ah hl l - - . .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. . 3 30 0
Année de début de thèse : 2007 .......................................................................................................... 31

Fascicule de thèses du département Ecologie des Forêts, Prairies et milieux Aquatiques
Octobre 2008 4
P
Pl la ac ce e d du u D Do ou ug gl la as s e en n F Fr ra an nc ce e d da an ns s l le e c co on nt te ex xt te e d de es s c ch ha an ng ge em me en nt ts s c cl li im ma at ti iq qu ue es s : : A Ap pp pr ro oc ch he es s
b
bi io og gé éo og gr ra ap ph hi iq qu ue e, , d de en nd dr ro oé éc co ol lo og gi iq qu ue e e et t g gé én né ét ti iq qu ue e d de e l la a r re es ss so ou ur rc ce e p pr ré és se en nt te e e et t f fu ut tu ur re e
- - A An nn ne e- -S So op ph hi ie e
S
Se er rg ge en nt t - - . .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. . 3 32 2
I
Im mp pa ac ct t d de es s d dé ép pô ôt ts s d d’ ’a az zo ot te e a at tm mo os sp ph hé ér ri iq qu ue e s su ur r l la a b bi io od di iv ve er rs si it té é d de es s p pr ra ai ir ri ie es s à à l l’ ’é éc ch he el ll le e d du u d do om ma ai in ne e
a
at tl la an nt ti iq qu ue e f fr ra an nç ça ai is s : : a ap pp pr ro oc ch he e c co om mp pa ar ra at ti iv ve e e et t e ex xp pé ér ri im me en nt ta al le e
- - C Ca as ss sa an nd dr re e G Ga au ud dn ni ik k - -
.
.. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. . 3 33 3
I
Im mp po or rt ta an nc ce e d de es s p pa ar ra as si it te es s e eu uc ca ar ry yo ot te es s d da an ns s l le es s s sy ys st tè èm me es s p pl la an nc ct to on ni iq qu ue es s l la ac cu us st tr re es s
- - J Je ea an n- -F Fr ra an nç ço oi is s
M
Ma an ng go ot t - - . .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. . 3 34 4
C
Ch ha an ng ge em me en nt ts s d de e l la a s st tr ru uc ct tu ur re e d de es s f fo or rê êt ts s t tr ro op pi ic ca al le es s: : v va ar ri ia at ti io on ns s n na at tu ur re el ll le es s o ou u c ch ha an ng ge em me en nt ts s
c
cl li im ma at ti iq qu ue es s ? ?
- - E Er rv va an n R Ru ut ti is sh ha au us se er r - - . .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. . 3 35 5
I
In nf fl lu ue en nc ce e d de es s p pr ra at ti iq qu ue es s a ag gr ri ic co ol le es s e et t d de e l l’ ’o oc cc cu up pa at ti io on n d de es s s so ol ls s d de ep pu ui is s d de eu ux x m mi il ll lé én na ai ir re es s s su ur r l la a
v
vé ég gé ét ta at ti io on n d de es s f fo or rê êt ts s l lo or rr ra ai in ne es s
- - D Da av vi id d E Et ti ie en nn ne e - - . .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. . 3 36 6
D
Dy yn na am mi iq qu ue es s s sa ai is so on nn ni iè èr re es s d de es s r ré és se er rv ve es s c ca ar rb bo on né ée es s e et t a az zo ot té ée es s c ch he ez z l le e c ch hê ên ne e s se es ss si il le e e et t l le e h hê êt tr re e. . M Mi is se e a au u
p
po oi in nt t d d’ ’u un n o ou ut ti il l d de e d di ia ag gn no os st ti ic c d de e l la a v vi it ta al li it té é d de es s a ar rb br re es s. .
- - R Ra an na a E El l Z Ze ei in n - - . .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. . 3 38 8
B
Bi il la an n e ea au u- -c ca ar rb bo on ne e d de es s m mo os sa aï ïq qu ue es s m ma aï ïs s- -f fo or rê êt t d du u b ba as ss si in n v ve er rs sa an nt t d de e l la a L Le ey yr re e : : E Et tu ud de e d de e p pl lu us si ie eu ur rs s
z
zo on ne es s m mo od dè èl le es s s su ur r l le es s 3 30 0 d de er rn ni iè èr re es s a an nn né ée es s
- - M Ma ar ri ie e G Gu ui il ll lo ot t - - . .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. . 3 39 9
L
Le es s P Pl la an nc ct to om my yc ce et te es s e en n m mi il li ie eu u l la ac cu us st tr re e : : d di is st tr ri ib bu ut ti io on n, , f fa ac ct te eu ur rs s d de e c co on nt tr rô ôl le e e et t i im mp pl li ic ca at ti io on n d da an ns s l le e
c
cy yc cl le e b bi io og gé éo oc ch hi im mi iq qu ue e d de e l l’ ’a az zo ot te e
- - T Th ho om ma as s P Po ol ll le et t - - . .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. . 4 40 0
L
La a m mo od dé él li is sa at ti io on n d de es s f fl lu ux x h hy yd dr ri iq qu ue es s l le e l lo on ng g d du u c co on nt ti in nu uu um m s so ol l- -p pl la an nt te e- -a at tm mo os sp ph hè èr re e d d’ ’u un ne e f fo or rê êt t : :
p
pa ar rt ti ic ci ip pa at ti io on ns s d de es s d di if ff fé ér re en nt ts s r ré és se er rv vo oi ir rs s d d’ ’e ea au u ; ; a ap pp pl li ic ca at ti io on n d da an ns s u un ne e o op pt ti iq qu ue e d de e c co om mp pa ar ra ai is so on n d de e
r
ré ép po on ns se es s e en nt tr
re e é éc co os sy ys st tè èm me es s à à d de es s c cl li im ma at ts s f fu ut tu ur rs s. . - - P Pa au ul li in ne e G Ga au ud di in n - - . .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. . 4 41 1
F
Fa ac ct te eu ur rs s c co on nt tr ro ol la an nt t l l’ ’a al lt te er ra at ti io on n b bi io ol lo og gi iq qu ue e d de es s m mi in ne er ra au ux x d da an ns s l la a r rh hi iz zo os sp ph he er re e d de es s e ec co os sy ys st te em me es s
f
fo or re es st ti ie er rs s
- - C Ch hr ri is st te el ll le e C Co ol ll li ig gn no on n - -
.
.. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. . 4 42 2
I
Im mp pa ac ct ts s d du u c ch ha an ng ge em me en nt t c cl li im ma at ti iq qu ue e s su ur r l le es s b bi il la an ns s d de e c ca ar rb bo on ne e e et t d de e g ga az z à à e ef ff fe et t d de e s se er rr re e d de e l la a p pr ra ai ir ri ie e
p
pe er rm ma an ne en nt te e e en n l li ie en n a av ve ec c l la a d di iv ve er rs si it té é f fo on nc ct ti io on nn ne el ll le e. . É Ét tu ud de e e ex xp pé ér ri im me en nt ta al le e. .-
- A Am mé él li ie e C Ca an nt ta ar re el l - -. .. .. .. .. .. .. .. .. . 4 43 3
Année de début de thèse : 2008 .......................................................................................................... 44
I
Im mp pa ac ct ts s d du u c ch ha an ng ge em me en nt t c cl li im ma at ti iq qu ue e ( (C CO O2 2, , T T, , s sé éc ch he er re es ss se e) ) e et t d de e l la a d di iv ve er rs si it té é v vé ég gé ét ta al le e s so ou ut te er rr ra ai in ne e s su ur r
l
la a d dé ém mo og gr ra ap ph hi ie e r ra ac ci in na ai ir re e e et t l la a r re es sp pi ir ra at ti io on n d du u s so ol l d d’ ’u un ne e p pr ra ai ir ri ie e p pe er rm ma an ne en nt te e
- - R Ré ém mi i P Pi il lo on n - -
. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. . 4 45 5
T
Tr ro op ph hi ic c r re el la at ti io on ns sh hi ip ps s i in n t th he e r rh hi iz zo os sp ph he er re e o of f w wo oo od dy y p pl la an nt ts s: : e ef ff fe ec ct t o of f t th he e c co om mm mu un ni it ti ie es s o of f f fu un ng gi i, ,
b
ba ac ct te er ri ia a a an nd d n ne em ma at to od de es s o on n m mi in ne er ra al l n nu ut tr ri it ti io on n o of f P Pi in nu us s p pi in na as st te er r. .
- - U Us sm ma an n I Ir rs sh ha ad d - -. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. . 4 46 6
S
Su ui iv vi i d d’ ’i in nd di ic ca at te eu ur rs s p ph hy ys si iq qu ue es s, , g gé éo oc ch hi im mi iq qu ue es s e et t b bi io ol lo og gi iq qu ue es s d de es s m mo od di if fi ic ca at ti io on ns s e et t d de e l la a r re es st ta au ur ra at ti io on n
d
du u f fo on nc ct ti io on nn ne em me en nt t d de e s so ol ls s f fo or re es st ti ie er rs s s so ou um mi is s à à u un n t ta as ss se em me en nt t m mé éc ca an ni iq qu ue e. .-
- N No oé ém mi ie e G Go ou ut ta al l - -
.
.. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. . 4 47 7
P
Pl la as st ti ic ci it té é a ar rc ch hi it te ec ct tu ur ra al le e d de e q qu ue el lq qu ue es s e es sp pè èc ce es s d de e f fo or rê êt ts s m mé éd di it te er rr ra an né ée en nn ne es s : : v va ar ri ia ab bi il li it té és s i in nt tr ra a- - e et t i in nt te er r- -
s
sp pé éc ci if fi iq qu ue e d de e l la a r ré ép po on ns se e d de es s a ar rb br re es s à à l la a s sé éc ch he er re es ss se e. .
- - T Ta au ug go ou ur rd de ea au u O Ol li iv vi ie er r - -
.
.. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. . 4 48 8
I
In nf fl lu ue en nc ce e d de e l la a d di iv ve er rs si it té é d de es s l li it ti iè èr re es s s su ur r l le es s c cy yc cl le es s b bi io og gé éo oc ch hi im mi iq qu ue es s e en n f fo or rê êt t t tr ro op pi ic ca al le e h hu um mi id de e
- -
S
Sa an nd dr ra a B Ba ar ra an nt ta al l - -
.
.. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. . 4 49 9
C
Ca au us se es s f fo on nc ct ti io on nn ne el ll le es s d du u d dé ép pé ér ri is ss se em me en nt t d de es s s sa ap pi in ni iè èr re es s ( (A Ab bi ie es s a al lb ba a M Mi il ll l. .) ) d de e l l’ ’a ar rr ri iè èr re e p pa ay ys s
m
mé éd di it te er rr ra an né ée en n
- - M Ma ax xi im me e C Ca ai il ll le er re et t - - . .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. . 5 50 0
CT2 ....................................................................................................................................................... 51

Fascicule de thèses du département Ecologie des Forêts, Prairies et milieux Aquatiques
Octobre 2008 5
Année de début de thèse : 2006 .......................................................................................................... 52
T
Tr ra ac ce ea ab bi il li it ty y o of f m my yc co or rr rh hi iz za al l f fu un ng gi i
- - M Ma ar rl li is s R Re ei ic ch h - - . .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. . 5 53 3
A
An na al ly ys se e d de es s p pe eu up pl le em me en nt ts s i ic ch ht th hy yo ol lo og gi iq qu ue es s r ré éc ci if fa au ux x e et t d de e l le eu ur rs s u us sa ag ge es s p po ou ur r l l’ ’é él la ab bo or ra at ti io on n d d’ ’u un n s su ui iv vi i à à
l
lo on ng g t te er rm me e. . É Ét tu ud de e d da an ns s l la a z zo on ne e d du u p pr ro oj je et t K Ko on ni ia am mb bo o ( (K Ko on né é, , N No ou uv ve el ll le e- -C Ca al lé éd do on ni ie e) )
- - N Ni ic co ol la as s
G
Gu ui il ll le em mo ot t - - . .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. . 5 54 4
R
Ré ég gu ul la ar ri it té é d d’ ’e ex xp pr re es ss si io on n d de es s p pr ro oc ce es ss su us s d de e c cr ro oi is ss sa an nc ce e, , r ra am mi if fi ic ca at ti io on n e et t f fl lo or ra ai is so on n c ch he ez z q qu ue el lq qu ue es s
e
es sp pè èc ce es s d de e C Ce ec cr ro op pi ia a. . A Ap pp pl li ic ca at ti io on n à à l l’ ’e es st ti im ma at ti io on n d de e l l’ ’â âg ge e d de e z zo on ne es s p pe er rt tu ur rb bé ée es s. .
- - P Pa au ul l- -C Ca am mi il lo o
Z
Za al la am me ea a - - . .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. . 5 55 5
C
Cl lo on na ag ge e p po os si it ti io on nn ne el l d de es s g gè èn ne es s i im mp pl li iq qu ué és s d da an ns s l la a s sy ym mb bi io os se e e ec ct to om my yc co or rh hi iz zi ie en nn ne e c ch he ez z l le e
b
ba as si id di io om my yc cè èt te e L La ac cc ca ar ri ia a b bi ic co ol lo or r e et t l le e P Pe eu up pl li ie er r. .
- - J Je es ss sy y L La ab bb bé é - - . .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. . 5 56 6
D
Dé ét te er rm mi in ni is sm me e g gé én né ét ti iq qu ue e d de e l la a r ré és si is st ta an nc ce e p pa ar rt ti ie el ll le e d du u p pe eu up pl li ie er r à à l la a r ro ou ui il ll le e f fo ol li ia ai ir re e
- - A Al lo oï ïs s B Br re es ss so on n - -
. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. . 5 57 7
C
Ca au us se es s e et t c co on ns sé éq qu ue en nc ce es s à à é éc ch he el ll le e i in nd di iv vi id du ue el ll le e d de es s i in nf fe es st ta at ti io on ns s d de e g ga al le e s sa ar rc co op pt ti iq qu ue e ( (S Sa ar rc co op pt te es s
s
sc ca ab bi ie ei i) ) c ch he ez z l le e b bo ou uq qu ue et ti in n i ib bé ér ri iq qu ue e ( (C Ca ap pr ra a p py yr re en na ai ic ca a) )
- - M Ma at th hi ie eu u S Sa ar ra as sa a - - . .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. . 5 58 8
E
Ef ff fe et t d de e l la a l ly ys se e v vi ir ra al le e e et t d de e l la a p pr ré éd da at ti io on n p pa ar r l le es s f fl la ag ge el ll lé és s s su ur r l le es s r re es ss so ou ur rc ce es s n nu ut tr ri it ti iv ve es s, , l la a
c
ca ar ra ac ct té ér ri is sa at ti io on n d de e l la a m ma at ti iè èr re e o or rg ga an ni iq qu ue e, , l la a d dy yn na am mi iq qu ue e e et t s st tr ru uc ct tu ur re e d de es s c co om mm mu un na au ut té és s m mi ic cr ro ob bi ie en nn ne es s
l
la ac cu us st tr re es s.
. - - L Ly yr ri ia a B Be er rd dj je eb b - - . .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. . 5 59 9
P
Po op pl la ar r r ro oo ot t d de ev ve el lo op pm me en nt t i in n r re es sp po on ns se e t to o f fu un ng ga al l s si ig gn na al ls s d du ur ri in ng g o on ns se et t o of f e ec ct to om my yc co or rr rh hi iz za ae e
- - J Ju ud di it th h
R
Ri ic ch ht te er r - - . .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. . 6 60 0
A
An na al ly ys se e d de e l la a d dy yn na am mi iq qu ue e d de es s p po op pu ul la at ti io on ns s h ha al li ie eu ut ti iq qu ue es s à à c cy yc cl le e d de e v vi ie e c co ou ur rt t
- - Y Yo ou ue en n V Ve er rm ma ar rd d - - . .. .. .. . 6 61 1
Année de début de thèse : 2007 .......................................................................................................... 62
E
Es st ti im ma at ti io on n e et t m mo od dé él li is sa at ti io on n d de e l l' 'i im mp pa ac ct t d de es s d dé ég gâ ât ts s s sa an ni it ta ai ir re es s s su ur r l la a p pr ro od du uc ct ti iv vi it té é d de es s f fo or rê êt ts s d de e p pi in n
m
ma ar ri it ti im me e e en n A Aq qu ui it ta ai in ne e
- - C Ch hr ri is st to op ph he e O Or ra az zi io o - - . .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. . 6 63 3
L
Le es s p pe eu up pl le em me en nt ts s b be en nt th hi iq qu ue es s : : d de es sc cr ri ip pt te eu ur rs s d de e l la a f fo on nc ct ti io on nn na al li it té é d de es s h ha ab bi it ta at ts s h ha al li ie eu ut ti iq qu ue es s e es ss se en nt ti ie el ls s
e
en n m mi il li ie eu u c cô ôt ti ie er r e et t e es st tu ua ar ri ie en n
- - C Ca ar ro ol li in ne e K Ko os st te ec ck ki i - - . .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. . 6 64 4
E
Ef ff fe et t d de es s t ty yp pe es s d de e l li is si iè èr re es s s su ur r l la a d di iv ve er rs si it té é v vé ég gé ét ta al le e
- - A Au ud dr re ey y A Al li ig gn ni ie er r - - . .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. . 6 66 6
M
Mo od dé él li is sa at ti io on n d de e l l’ ’é év vo ol lu ut ti io on n d de e l l’ ’a ag gr re es ss si iv vi it té é d de es s c ch ha am mp pi ig gn no on ns s p ph hy yt to op pa at th ho og gè èn ne es s : : c co ou up pl la ag ge e d de es s
a
ap pp pr ro oc ch he es s d d’ ’é ép pi id dé ém mi io ol lo og gi ie e e et t d de e b bi io ol lo og gi ie e é év vo ol lu ut ti iv ve e
- - A Au ud dr re ey y A An nd da an ns so on n - - . .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. . 6 67 7
C
Co on nt tr ri ib bu ut ti io on n d de es s b bo oi is s e et t d de e l le eu ur rs s l li is si iè èr re es s à à l la a d di iv ve er rs si it té é d de es s c ca ar ra ab bi iq qu ue es s d da an ns s l le es s p pa ay ys sa ag ge es s a ag gr ri i- -
f
fo or re es st ti ie er rs s
- - A An nt th ho on ny y R Ro ou um me e - -
.
.. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. . 6 68 8
R
Rô ôl le e d de es s g gè èn ne es s d du u s sy ys st tè èm me e i im mm mu un ni it ta ai ir re e d da an ns s l la a d di is st tr ri ib bu ut ti io on n e et t l l' 'é ém me er rg ge en nc ce e d de e l la a f fi iè èv vr re e
h
hé ém mo or rr ra ag gi iq qu ue e à à s sy yn nd dr ro om me e r ré én na al l c ca au us sé ée e p pa ar r l l' 'h ha an nt ta av vi ir ru us s P Pu uu um ma al la a c ch he ez z l le e c ca am mp pa ag gn no ol l r ro ou us ss sâ ât tr re e
M
My yo od de es s ( (C Cl le et th hr ri io on no om my ys s) ) g
gl la ar re eo ol lu us s. . - - E Em mm ma an nu ue el l G Gu ui iv vi ie er r - -
.
.. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. . 6 69 9
E
Ev va al lu ua at ti io on n d du u r ri is sq qu ue e d d’ ’i in nt tr ro og gr re es ss si io on n d d’ ’e es sp pè èc ce es s o ou u v va ar ri ié ét té és s c cu ul lt ti iv vé ée es s d da an ns s l le es s p po op pu ul la at ti io on ns s n na at tu ur re el ll le es s
d
de e p pe eu up pl li ie er r n no oi ir r
- - N Ni ic co ol la as s C Ch he en na au ul lt t - - . .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. . 7 70 0
M
Mo od dé él li is sa at ti io on n d de e l la a d di is st tr ri ib bu ut ti io on n e et t d de e l la a p pr ro od du uc ct ti iv vi it té é d de es s e es ss se en nc ce es s f fo or re es st ti iè èr re es s f fr ra an nç ça ai is se es s v vi is s- -à à- -v vi is s d de es s
f
fa ac ct te eu ur rs s d du u c cl li im ma at t e et t d du u s so ol l s se en ns si ib bl le es s a au ux x c ch ha an ng ge em me en nt ts s e en nv vi ir ro on nn ne em me en nt ta au ux x
- - R Ro om ma ai in n B Be er rt tr ra an nd d - -
.
.. .. .. . 7 71 1
Année de début de thèse : 2008 .......................................................................................................... 73