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LAC DE REMORAY
ETUDE DES CHIROPTERES FORESTIERS
DU MASSIF DE LA GRAND’COTE (25)

Illustrations :
Première de couverture :
Murin de Daubenton (Myotis daubentonii). © BILAT Yves, 2011
Quatrième de couverture :
Chablis dans la parcelle D (l'ilot de sénescence). © CLAUDE Jocelyn, 2013
Toutes les photos de chiroptères d'Yves BILAT sont protégées par des droits d'auteurs
(http://www.yvesbilat.ch/photo/). Toute reproduction est donc interdite sans son accord.
L'ensemble des images sont faites sur des animaux sauvages sans capture préalable.
Sauf mention contraire, les autres photos, de Jocelyn CLAUDE ou de Franck BASSET,
ont été prises dans l'exercice de leurs fonctions, elles sont donc publiques.
Terrain :
Franck BASSET (ONF, réseau mammifères)
Jocelyn CLAUDE (Amis de la réserve
naturelle du lac de Remoray)
Cyrille LEBIHAN (ONF, réseau
mammifères)
Alice ZIMMERMANN (ONF, réseau
mammifères)
Analyses ultrasonores
Philippe FAVRE (ONF, réseau mammifères)
Synthèse, rédaction et mise en page :
Jocelyn CLAUDE
Franck BASSET
Remerciements :
Nous tenons à remercie chaleureusement :
 le personnel ONF de l’Unité Territoriale de Labergement-Sainte-Marie, tout
particulièrement François CHANAL, pour son accueil et sa disponibilité ;
 Françoise VAGNEUR et Vincent BENARD de l’ONF,
 Yves BILAT pour la mise à disposition de ses clichés ;
 Jérémy FROIDEVAUX pour ses remarques avisées et ses compléments bibliographiques ;
 Philippe FAVRE, pour son travail de validation et d’analyse des séquences ultrasonores ;
 Alice ZIMMERMANN et Cyrille LEBIHAN, pour leur participation à cette étude ;
 l’équipe salarié de la CPEPESC-FC, notamment Cathy BRESSON pour l’analyse des
Anabats de 2011 et son soutien ;
 Bruno TISSSOT, pour ses corrections orthographiques et syntaxiques ;
 Les bénévoles de l’association des amis de la réserve naturelle du lac de Remoray.
Pour citer ce rapport :
CLAUDE J. & BASSET F., 2014. Etude des chiroptères forestiers du massif de la Grand’Côte (25),
Rapport d’étude, Les amis de la réserve naturelle du lac de Remoray-ONF, Labergement-Sainte-
Marie - Lons-le-Saunier, 44 p et annexes.

Etude des chiroptères forestiers
du massif de la Grand’Côte (25)
Sommaire
Introduction ................................................................................................................................ 1
1. Matériels & Méthodes ......................................................................................................... 2
1.1. Les chauves-souris forestières ..................................................................................... 2
1.2. Le massif de la Grand'Côte .......................................................................................... 8
1.3. Les prospections de terrain ........................................................................................ 12
2. Résultats ............................................................................................................................ 21
2.1. Captures aux filets japonais ....................................................................................... 21
2.2. Ecoute au détecteur d’ultrasons ................................................................................. 22
2.3. SM2 ........................................................................................................................... 23
3. Analyses ............................................................................................................................ 24
3.1. Indice d'activité .......................................................................................................... 24
3.2. Composition du cortège ............................................................................................. 25
3.1. Comparatifs entre série écologique et série de production ........................................ 29
4. Vers une meilleure intégration des exigences de chiroptères dans la gestion forestière .. 35
Conclusion ................................................................................................................................ 39
Table des illustrations ............................................................................................................... 40
Bibliographie ............................................................................................................................ 42
Annexes .................................................................................................................................... 45

CLAUDE & BASSET, 2013 Inventaire des chiroptères forestiers
2013 Page n°1/48
Introduction
Les chauves-souris ont des
caractéristiques morphologiques (vol actif),
biologiques (écholocation, hibernation),
éthologiques (migrations, changements de
gîtes) particulières qui les placent à part chez
les mammifères. Elles sont considérées
comme des espèces bio indicatrices.
Beaucoup dépendent de la forêt à un
moment ou à un autre de leur cycle de vie,
pour la reproduction, le gîte, le repos ou la
chasse. Actuellement, les connaissances sur
les chiroptères forestiers européens sont très
incomplètes, notamment en forêt d’altitude. Malgré de multiples et forts statuts de
protection, leur état de conservation est préoccupant (1 espèce sur 2 est menacée).
Les chauves-souris font l'objet d’un plan national d’action 2009-2013 (Tapiero,
2013).
En Franche-Comté, suite à une étude préliminaire réalisée dans la partie
forestière de la réserve naturelle nationale (RNN) du lac de Remoray (Claude, 2012),
de nouvelles prospections sur les chiroptères forestiers ont été réalisées sur l'ensemble
du massif de la Grand’Côte.
Ce travail s'inscrit dans le cadre des révisions du plan d'aménagement de la
Forêt domaniale du Mont Sainte Marie (2015-2034), du plan de gestion de la Réserve
Biologique Domaniale Dirigée de la Grand'Côte (2015-2024), du plan de gestion de la
RNN (2015-2019) et du Document d'objectif du site Natura 2000 (extension de
périmètre). Sur financements FEDD
1
et Natura 2000, cette étude est réalisée
conjointement par l’ONF (réseau mammifères) et la RNN du lac de Remoray.
Enfin, ce travail s'inscrit dans l'action prioritaire R7 du plan régional d'action
pour les chiroptères intitulée "Etude et conservation des chiroptères en forêt" (Roué et
al., 2012).
Après une présentation des matériels et méthodes, ce rapport présente et analyse
les résultats des 2 années de suivi. Enfin, des préconisations de gestion seront
formulées afin d'intégrer les exigences des chiroptères dans les différents documents
de gestion du massif forestier de la Grand'Côte.
1
Fond d'intervention pour l'environnement et le développement durable, financé par l'ONF
Figure 1 : Femelle d’Oreillard Roux (Plecotus auritus)

CLAUDE & BASSET, 2013 Inventaire des chiroptères forestiers
2013 Page n°2/48
1. Matériels & Méthodes
1.1. Les chauves-souris forestières
Les chauve-souris forestières sont des espèces qui passent au moins une saison de
l’année en forêt et/ou chassent préférentiellement dans ce type de milieu. En d’autres termes,
ce sont des espèces qui effectuent une partie, voire la totalité, de leur cycle biologique en
forêt. Cette partie traite de leurs principales caractéristiques et dégage les intérêts et difficultés
de leur étude.
1.1.1. Systématique actuelle
Les chiroptères sont des vertébrés mammifères
scrotifères, répartis en deux sous ordres : les Ptérodiformes
et les Vespertiloniformes. Quatre familles sont présentes en
Europe sur les 18 mondiales : Rhinolophidae,
Vespertilionidae, Miniopteridae et Molossidae.
1.1.2. Surprenants mammifères
Les chiroptères sont les seuls mammifères capables de voler activement grâce à la
modification de leurs membres postérieurs.
De plus, les individus se dirigent la nuit grâce à un système d’écholocation. Ils
émettent, par la bouche (Vespertillonidae, Molossidae et Miniopteridae) ou les narines
(Rinolophidae), des séries de sons, inaudibles (ultrasons) par l’homme. Ils analysent ensuite
l’écho perçu pour se repérer ou pour localiser leurs
proies (Barataud, 1999). Les chauves-souris
structurent leurs ultra-sons en fonction du type de
milieu fréquenté. Les ultrasons utilisés se
caractérisent grâce à différents paramètres : gammes
de fréquences utilisées, variation des fréquences,
rythme (Tupinier, 1996). Ces caractéristiques sont
propres à chaque espèce ou groupe d’espèces, ce qui
rend possible l’identification acoustique des chiroptères par le biais d’un détecteur
d’ultrasons.
Ces petits vertébrés possèdent une longévité élevée (jusqu'à 32 ans) pour une masse
comprise entre 4 et 30 grammes (respectivement la Pipistrelle commune Pipistrellus
pipistrellus et le Molosse de Cestonie Tadarida teniotis).
Source : Lecointre et Guyader, 2006
Figure 2 : Phylogénie des mammifères
Source : PNV, 1997
Figure 3 : Principe d’écholocation
Vertébrés
Gnatostomes
Ostéichtiens
Sarcoptérigiens
Rhiphidistiens
Tétrapodes
Amniotes
Mammifères