Génétique Lexique ADN mitochondrial Génome extrachromosomique. Ils dirigent la fabrication des enzymes de la respiration cellulaire. Se réplique à l’intérieur de la mitochondrie lors de la cytokinèse et sa transmission de l’ADN mitochondrial est purement maternelle. Allèle dominant/récessif L’allèle dominant s’exprime à l’état hétérozygote. L’allèle récessif s’exprime lorsqu’il est a l’état homozygote. Analyse génétique classique ou clonage fusionnelle On part de la protéine → séquence acides aminés → séquence nucléotidique → localisation du gêne. Analyse génétique positionnelle ou inversée Recherche de la position du gêne dans le génome par la recherche de marqueurs polymorphes dont la transmission suit la transmission de la maladie → détermine la séquence du gêne → la protéine et la fonction. Aneuploïdie Chromosome en trop ou manquant pour une seule paire de chromosomes. Anomalies chromosomiques Plus grandes que les anomalies moléculaires et concernent plusieurs gênes. Repérables grâce à des techniques de cytogénétique. Anomalies de nombres Excès ou perte de chromosome(s) entier(s). Anomalies de structure - translocation réciproque; échange de segments entre deux chromosomes. - translocation robertsonnienne; fusion de deux chromosomes acrocentriques. - délétion, inversion, duplication de segments de chromosomes, etc. … Bases purines - adénine (A) - guanine (G) Bases pyrimidines - cytosine (C) - thymine (T) Caryotype en haute résolution Obtenu à l’aide de chromosomes en prométaphase qui sont un peu plus allongés que ceux en métaphase, et, qui permettent ainsi la visualisation d’anomalies portant sur de petits segments de chromosomes. CGH/« comparative genomic hybridization » Recherche de microdélétions ou duplications par comparaison de l’ADN du patient avec un ADN contrôle. Codons Start/stop codons Congénital(e) Déjà présent(e) à la naissance. Consanguinité Union de deux individus génétiquement apparentés. Corpuscule de Barr Chromosome X lyonisé condensé lors de l’interphase. Crossing-over Échange réciproque entre les chromatides des chromosomes homologues au cours de la prophase de la première division méiotique. Cytokinèse Division cellulaire. Dérive génétique (= « genetic drift ») Se réfère à un isolat au changement de fréquence d’un gène qui se produit par hasard. Diagnostic prédictif Détermine si un individu sain a, ou non, un risque accru de développer un jour une maladie déterminée → probabilité. Diagnostic présymptomatique Détermine si une personne saine dans une famille à risques développera, ou ne développera pas, un jour une maladie déterminée. Disomies uniparentales Héritage de deux chromosomes (ou segments) d’un seul parent en l’absence du chromosome correspond de l’autre parent. → Elles permettent la correction d’une aneuploïdie (monosomie ou trisomie). Hétérodisomie Présence des deux chromosomes homologues d’un seul parent en l’absence de celui de l’autre parent. Isodisomie Deux fois le même chromosome d’un seul parent en l’absence du chromosome correspondant de l’autre parent. → Peut causer une maladie récessive si dédouble une mutation dont le parent est porteur sain. Dysmorphie Anomalie du développement telle qu’elle peut être visualisée dans un grand nombre de syndromes ayant une origine génétique ou environnementale. Effet fondateur Présence d’un allèle rare chez le fondateur d’un groupe lors de migrations ou de constitution de groupes autres. Empreinte génétique X génomique Étude simultanée d’un grand nombre de loci polymorphes permet d’obtenir une sorte code barre spécifique à un individu. (Utiliser dans le médico-légal et dans les tests de paternité) Empreinte génomique ou parentale = phénomène épigénétique L’expression d’un gène est différente suivant qu’il a été transmis par le père ou la mère. Enzymes de restrictions Elles coupent l’ADN en des sites (séquence de nucléotides) plus ou moins fréquents bien définis selon l’enzyme. Epissage de l’ARN Réunion des segments restants correspondants aux exons contenus dans le transcrit primaire de l’ARN messager. Études des subtélomères FISH avec des sondes ADN permettant la mise en évidence de certaines régions. Excision de l‘ARN Coupure, élimination des introns. Exons Fragments de la séquence codante d’un gêne. Séquences exprimées. FISH/hybridation in situ Procédé permettant de repérer des séquences d’ADN sur une préparation cytogénétique. Permet de repérer des anomalies non visibles par les méthodes classiques. Possible que si l’on connaît l’anomalie à rechercher. Gêne de contrôle/ « housekeeping genes »/gênes de ménage Contrôlent l’expression des gênes de structure → la production de protéines. Gênes de structure Codent pour des protéines faisant part de la structure du corps humain. Génétique des populations Elle étudie la fréquence des gènes et des génotypes dans les populations ainsi que les facteurs qui peuvent les modifier au cours des générations. Génome Ensemble du matériel génétique d’une cellule d’un individu réparti sur 23 paires de chromosomes. Génotype X phénotype Constitution génétique d’un individu ou ensemble des allèles que possède un individu pour un gêne donné. X manifestation apparente du génotype; interaction entre facteurs génétiques et environnementaux. Gynécomastie Développement des seins. Haplotype Set d’allèles (situés sur des loci très proches) contenu dans le complexe HLA d’un seul chromosome 6. Hétérogénéité génétique Un même phénotype peut être du à des mécanismes génétiques différents. Histones Protéines des nucléosomes qui donnent à l’ADN sa forme de base. Hybridation Utilise la propriété de complémentarité des duplex (bases) d’ADN et d’ARN. En deux temps; dénaturation de la double chaîne d’ADN et hybridation de l’ADN avec des sondes bien connues. Compte tenu du fait que ces sondes vont s’apparier de façon complémentaire aux base de l’ADN, en observant leur position on peut déduire la composition du brin d’ADN. Iatrogène Se dit des troubles provoqués par un traitement médical ou un médicament. Introns Séquences de nucléotides intercalaires. Séquences non traduites. Locus/i Localisation précise d’un gêne sur un chromosome. Lyonisation Inactivation d’un des chromosomes X de la femme contrôlé par le gêne XIST (sur X). Ce chromosome est condensé et apparaît dans les cellules en interphase sous forme du corpuscule de Barr. Maladies héréditaires monogéniques Dues à des mutations ponctuelles et remaniements génomiques de petites tailles au niveau d‘un seul gêne! Mises en évidence grâce à l’examen des chromosomes au microscope. Malformation Défaut structurel d’un organe ou d’une partie d’un organe. - Majeure: entraîne un handicap physique, mental ou social en l’absence de traitement. - Mineure: pas de conséquences médicales majeures. Marqueur génétique Polymorphisme facilement détectable. Méthylation Adjonction d’un groupe méthyle (CH3) à la base cytosine d’un gêne. Le gêne devient inactif et ne sert plus à la production de protéines. Mutation Changement dans la séquence des nucléotides ou dans l’arrangement de l’ADN dans le génome. Erreur survenue lors de la réplication de l’ADN qui persiste et est transmise à toutes les cellules filles de la cellule au code erroné. (Classification et type: voir tableaux) Myoclonie Contraction musculaire rapide, involontaire, de faible amplitude, siégeant à l’ensemble du muscle ou localisé à un faisceau musculaire. Nucléotide Molécule formée par un acide phosphorique, un sucre et une base. Phénocopie Imitation d’un phénotype déterminé par un génotype. Le phénotype résulte de l’interaction d’un facteur de l’environnement et d’un autre génotype. Phénotype Manifestions apparente du génotype en interaction avec des facteurs environnementaux. Polymorphismes Différences alléliques pour un même locus (fréquence apparition de différents allèles est plus grande ou égale à 2%). Certains polymorphismes peuvent avoir un effet sur l’activité de certains enzymes cruciaux au niveau du métabolisme de certains médicaments. → Locus polymorphe. Prion Glycoprotéine dont la forme normale est PrPc, elle est sensible à la protéase et joue un rôle important dans le maintient et le développement de la structure du système nerveux. Sa forme anormale, PrPsc, est résistante à la protéase. Elle ne diffère de PrPc que par sa structure dans l’espace Race Variété intra spécifique dont les individus partagent des traits qui les distinguent des individus appartenant à une autre race et dont le maintient dépend essentiellement de croissements strictement endogames. Recombinaison Formation de nouvelles combinaisons de gênes par crossing-over. Réplication de l’ADN est semi-conservatrice Un seul des deux brins de départ est conservé dans la nouvelle double hélice d’ADN. Subtélomères Régions situées juste en dessous des télomères des chromosomes. Ce sont les extrémités des chromosomes. Substances tératogènes Elles altèrent le développement embryonnaire ou fœtale. Substances mutagènes Elle altèrent le matériel génétique et peuvent induire un cancer (cellule somatique) ou une maladie génétique (cellule germinale). Syndrome Ensemble de signes cliniques liés à une étiologie commune. Syndrome de flushing asiatique Déficit de ALDH, enzyme qui métabolise l’alcool, conduisant à une sorte d’intolérance à l’alcool provoquant des effets nuisibles intenses. Système HLA ou complexe majeur d’histocompatibilité Antigènes à la surface des cellules qui déterminent la compatibilité tissulaire, c’est-àdire, la capacité d’un organisme à tolérer un greffon issu d’un autre individu. → Rôle majeur dans le système immunitaire. (Translocations) cryptiques (Translocations) non visibles au caryotype à haute résolution. Variants rares Différences alléliques (« polymorphismes ») pour un même locus (fréquence de moins de 2%).